88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0952 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0952  GHMP kinase  100 
 
 		 354 aa  721    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.70731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3592  GHMP kinase  90.31 
 
 		 354 aa  644    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.437274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1742  GHMP kinase  25.51 
 
 		 343 aa  94.7  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.2795 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1610  capsular biosynthesis sugar kinase, putative  25.3 
 
 		 339 aa  94  4e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.594755  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2174  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  26.16 
 
 		 346 aa  90.9  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2296  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  26.16 
 
 		 346 aa  90.9  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0720  GHMP kinase  28.9 
 
 		 341 aa  91.3  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3278  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  26.16 
 
 		 346 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3292  WcbL  26.16 
 
 		 346 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3243  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  26.16 
 
 		 346 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.455647  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1068  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  26.16 
 
 		 346 aa  90.9  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0532  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  26.16 
 
 		 346 aa  90.9  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22033  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1424  capsular biosynthesis sugar kinase, putative  25.3 
 
 		 339 aa  90.1  5e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.878412  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2647  GHMP kinase  30.3 
 
 		 293 aa  89.7  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1759  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  25.3 
 
 		 339 aa  89.4  9e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.44471  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3115  GHMP kinase  25.95 
 
 		 339 aa  88.2  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0236  GHMP kinase  29.69 
 
 		 350 aa  88.2  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1662  GHMP kinase  26.16 
 
 		 326 aa  82.8  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.501068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1635  GHMP kinase  26.16 
 
 		 326 aa  82.8  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0617  GHMP kinase  26.62 
 
 		 333 aa  82.8  0.000000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.170003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10116  D-alpha-D-heptose-7-phosphate kinase hddA  28.5 
 
 		 386 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3581  GHMP kinase  28.97 
 
 		 345 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4922  GHMP kinase  28.23 
 
 		 359 aa  72  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.272679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0374  GHMP kinase  25.95 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.638274  normal  0.807327 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1374  GHMP kinase  26.44 
 
 		 337 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4245  GHMP kinase  25.89 
 
 		 328 aa  68.6  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.469148 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3668  GHMP kinase  27.72 
 
 		 336 aa  67.4  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5597  GHMP kinase  25.55 
 
 		 326 aa  67  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0447  GHMP kinase  31.15 
 
 		 347 aa  66.6  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0206  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase, putative  26.05 
 
 		 325 aa  62.4  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0147  GHMP kinase  26.47 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0788  GHMP kinase  26.6 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4217  GHMP kinase  29 
 
 		 347 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3977  GHMP kinase  23.94 
 
 		 327 aa  58.9  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2431  GHMP kinase  25.77 
 
 		 343 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.696498  normal  0.378909 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  29.2 
 
 		 369 aa  57  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0793  GHMP kinase  23.78 
 
 		 331 aa  54.7  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1227  GHMP kinase  24.91 
 
 		 333 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2395  mevalonate kinase  29.96 
 
 		 303 aa  54.7  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000672574  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3600  GHMP kinase  29.13 
 
 		 349 aa  53.1  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0577  galactokinase  33.33 
 
 		 384 aa  52.4  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0153  GHMP kinase  27.27 
 
 		 347 aa  51.6  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  23.21 
 
 		 386 aa  51.6  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0652  galactokinase  31.18 
 
 		 388 aa  50.4  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.430663  hitchhiker  0.00000383534 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4020  galactokinase  32.26 
 
 		 388 aa  50.4  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000198069 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2212  galactokinase  34.94 
 
 		 399 aa  49.7  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.180846  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1599  mevalonate kinase  28.64 
 
 		 315 aa  49.7  0.00009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.309754  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0439  mevalonate kinase  26.23 
 
 		 328 aa  48.9  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1562  galactokinase  24.65 
 
 		 350 aa  48.9  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1835  mevalonate kinase  29.27 
 
 		 310 aa  49.3  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.782527 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  24.9 
 
 		 387 aa  49.3  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1628  galactokinase  24.65 
 
 		 350 aa  48.9  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  40.91 
 
 		 389 aa  48.9  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1421  mevalonate kinase  27.6 
 
 		 301 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.238571  hitchhiker  0.00767711 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3662  galactokinase  34.41 
 
 		 412 aa  48.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0296405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2604  mevalonate kinase  30.48 
 
 		 327 aa  47.8  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.395275  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  44.12 
 
 		 372 aa  47.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3271  galactokinase  36.25 
 
 		 388 aa  47.4  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6391  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2085  galactokinase  26.34 
 
 		 385 aa  46.6  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  26.05 
 
 		 403 aa  47  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0776  galactokinase  27.27 
 
 		 355 aa  46.6  0.0007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  27.68 
 
 		 391 aa  46.6  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0414  galactokinase  38.81 
 
 		 381 aa  46.2  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2541  mevalonate kinase  28.18 
 
 		 328 aa  46.2  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  41.43 
 
 		 349 aa  45.8  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210895 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1653  mevalonate kinase  29.25 
 
 		 314 aa  45.8  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0316  GHMP kinase  28.12 
 
 		 359 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0647  galactokinase  25.21 
 
 		 389 aa  45.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00202468  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  26.64 
 
 		 349 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3249  galactokinase  29.03 
 
 		 387 aa  44.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1097  galactokinase  31.82 
 
 		 385 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0010459  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0657  galactokinase  23.91 
 
 		 387 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1829  mevalonate kinase  30.47 
 
 		 338 aa  45.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1633  galactokinase  22.59 
 
 		 384 aa  44.3  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0892  galactokinase  42.19 
 
 		 391 aa  44.3  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0958973 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0532  galactokinase  24.64 
 
 		 351 aa  44.3  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.560664  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  24.49 
 
 		 391 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0921  pantothenate kinase  33.1 
 
 		 278 aa  43.9  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.610677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3668  galactokinase  37.5 
 
 		 380 aa  43.9  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1197  galactokinase  35.21 
 
 		 405 aa  43.5  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.765458  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1336  hypothetical protein  25.3 
 
 		 327 aa  43.9  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.296421  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0415  galactokinase  24.73 
 
 		 355 aa  43.5  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0997  galactokinase  26.56 
 
 		 362 aa  43.1  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00864415  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2857  galactokinase  38.24 
 
 		 383 aa  43.1  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1411  galactokinase  38.24 
 
 		 383 aa  43.1  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2945  galactokinase  38.24 
 
 		 383 aa  43.1  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1710  GHMP kinase  25.43 
 
 		 350 aa  42.7  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  22.06 
 
 		 383 aa  42.7  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>