62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3600 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3600  GHMP kinase  100 
 
 
349 aa  678    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3977  GHMP kinase  37.76 
 
 
327 aa  157  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0617  GHMP kinase  29.57 
 
 
333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.170003  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0206  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase, putative  34.33 
 
 
325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0788  GHMP kinase  35.24 
 
 
328 aa  134  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4245  GHMP kinase  33.84 
 
 
328 aa  133  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.469148 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0147  GHMP kinase  33.84 
 
 
325 aa  129  6e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5465  GHMP kinase  37.99 
 
 
326 aa  129  9.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0447  GHMP kinase  32.44 
 
 
347 aa  124  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4217  GHMP kinase  33.83 
 
 
347 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3668  GHMP kinase  33.72 
 
 
336 aa  118  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0720  GHMP kinase  32.46 
 
 
341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1227  GHMP kinase  30.31 
 
 
333 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464209  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0793  GHMP kinase  31.61 
 
 
331 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4922  GHMP kinase  32.94 
 
 
359 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.272679  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0153  GHMP kinase  31.66 
 
 
347 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0374  GHMP kinase  34.84 
 
 
343 aa  109  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.638274  normal  0.807327 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1635  GHMP kinase  32.57 
 
 
326 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1662  GHMP kinase  32.57 
 
 
326 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.501068  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5597  GHMP kinase  32.11 
 
 
326 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0532  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  31.94 
 
 
346 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22033  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3292  WcbL  31.94 
 
 
346 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1068  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  31.94 
 
 
346 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3243  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  31.94 
 
 
346 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.455647  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3278  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  31.94 
 
 
346 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2174  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  31.94 
 
 
346 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2296  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  31.94 
 
 
346 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1610  capsular biosynthesis sugar kinase, putative  24.85 
 
 
339 aa  100  4e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.594755  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1742  GHMP kinase  29.34 
 
 
343 aa  100  5e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.2795 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1759  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  25.68 
 
 
339 aa  99.8  7e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.44471  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1424  capsular biosynthesis sugar kinase, putative  24.78 
 
 
339 aa  97.4  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.878412  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10116  D-alpha-D-heptose-7-phosphate kinase hddA  35.62 
 
 
386 aa  96.3  7e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0236  GHMP kinase  30.15 
 
 
350 aa  93.6  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3115  GHMP kinase  27.25 
 
 
339 aa  92.8  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1374  GHMP kinase  32.2 
 
 
337 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3581  GHMP kinase  32.38 
 
 
345 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3592  GHMP kinase  30.31 
 
 
354 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.437274  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1336  hypothetical protein  21.84 
 
 
327 aa  73.6  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.296421  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0952  GHMP kinase  29.68 
 
 
354 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.70731  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2431  GHMP kinase  27.07 
 
 
343 aa  69.7  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.696498  normal  0.378909 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0316  GHMP kinase  25.74 
 
 
359 aa  58.5  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2647  GHMP kinase  28.76 
 
 
293 aa  58.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0681  mevalonate kinase  24.83 
 
 
290 aa  57.8  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0579  GHMP kinase  27.04 
 
 
361 aa  54.7  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000495739  decreased coverage  0.000433765 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1000  GHMP kinase domain protein  29.89 
 
 
370 aa  54.7  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00600942  normal  0.518194 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0776  galactokinase  25.83 
 
 
355 aa  53.5  0.000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0022  cytidyltransferase-like protein  28.3 
 
 
366 aa  51.6  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.112935  normal  0.136771 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0439  mevalonate kinase  27.1 
 
 
328 aa  52  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2395  mevalonate kinase  27.27 
 
 
303 aa  51.6  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000672574  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1114  GHMP kinase  36.21 
 
 
382 aa  50.1  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2604  mevalonate kinase  28.84 
 
 
327 aa  49.7  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.395275  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0891  mevalonate kinase  26.84 
 
 
322 aa  48.9  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  32.37 
 
 
405 aa  48.1  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0476  mevalonate kinase  30.4 
 
 
321 aa  48.5  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1201  Galactokinase  30.39 
 
 
410 aa  48.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1829  mevalonate kinase  26.54 
 
 
338 aa  47.8  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2002  mevalonate kinase  37.66 
 
 
356 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.360358  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2607  galactokinase  28.21 
 
 
399 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00377614  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0467  mevalonate kinase  24.68 
 
 
314 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.250256  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1033  mevalonate kinase  23.97 
 
 
322 aa  44.3  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2376  mevalonate kinase  25.24 
 
 
289 aa  44.3  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0465  GHMP kinase  29.55 
 
 
360 aa  43.9  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0240407  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>