101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4217 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4217  GHMP kinase  100 
 
 		 347 aa  712    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0447  GHMP kinase  91.64 
 
 		 347 aa  617  1e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0153  GHMP kinase  39.64 
 
 		 347 aa  212  9e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0788  GHMP kinase  43.2 
 
 		 328 aa  202  7e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0236  GHMP kinase  41.02 
 
 		 350 aa  199  5e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3977  GHMP kinase  40.12 
 
 		 327 aa  193  4e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0206  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase, putative  41.12 
 
 		 325 aa  192  7e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0147  GHMP kinase  40.83 
 
 		 325 aa  191  2e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5465  GHMP kinase  40.36 
 
 		 326 aa  189  8e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0720  GHMP kinase  39.8 
 
 		 341 aa  188  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5597  GHMP kinase  41.37 
 
 		 326 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4245  GHMP kinase  36.42 
 
 		 328 aa  171  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.469148 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3115  GHMP kinase  34.13 
 
 		 339 aa  170  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0617  GHMP kinase  32.46 
 
 		 333 aa  167  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.170003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4922  GHMP kinase  35.21 
 
 		 359 aa  163  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.272679  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2296  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  33.55 
 
 		 346 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3292  WcbL  33.55 
 
 		 346 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0532  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  33.55 
 
 		 346 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22033  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1068  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  33.55 
 
 		 346 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3243  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  33.55 
 
 		 346 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.455647  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3278  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  33.55 
 
 		 346 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2174  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  33.55 
 
 		 346 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0374  GHMP kinase  35.31 
 
 		 343 aa  159  5e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.638274  normal  0.807327 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0793  GHMP kinase  35.5 
 
 		 331 aa  155  7e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1227  GHMP kinase  32.76 
 
 		 333 aa  149  9e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464209  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1610  capsular biosynthesis sugar kinase, putative  31.25 
 
 		 339 aa  147  3e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.594755  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1759  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  31.34 
 
 		 339 aa  144  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.44471  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1742  GHMP kinase  32.2 
 
 		 343 aa  143  4e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.2795 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1424  capsular biosynthesis sugar kinase, putative  30.65 
 
 		 339 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.878412  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10116  D-alpha-D-heptose-7-phosphate kinase hddA  33.96 
 
 		 386 aa  138  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1635  GHMP kinase  31.85 
 
 		 326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1662  GHMP kinase  31.85 
 
 		 326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.501068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3668  GHMP kinase  32.25 
 
 		 336 aa  128  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1374  GHMP kinase  33.43 
 
 		 337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3581  GHMP kinase  33.13 
 
 		 345 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3600  GHMP kinase  33.83 
 
 		 349 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2647  GHMP kinase  30.23 
 
 		 293 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2431  GHMP kinase  26.56 
 
 		 343 aa  92.4  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.696498  normal  0.378909 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3592  GHMP kinase  26.8 
 
 		 354 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.437274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0952  GHMP kinase  27.63 
 
 		 354 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.70731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1336  hypothetical protein  25.62 
 
 		 327 aa  75.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.296421  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0579  GHMP kinase  26.69 
 
 		 361 aa  72.4  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000495739  decreased coverage  0.000433765 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1829  mevalonate kinase  27.67 
 
 		 338 aa  67.8  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2604  mevalonate kinase  28.23 
 
 		 327 aa  67  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.395275  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1114  GHMP kinase  24.43 
 
 		 382 aa  64.3  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0891  mevalonate kinase  27.31 
 
 		 322 aa  62.8  0.000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  24.9 
 
 		 372 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  23.49 
 
 		 380 aa  61.2  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0439  mevalonate kinase  28.44 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0681  mevalonate kinase  26.15 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4315  mevalonate kinase  23.05 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0316  GHMP kinase  28.14 
 
 		 359 aa  55.5  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  27.27 
 
 		 349 aa  55.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210895 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0476  mevalonate kinase  27.8 
 
 		 321 aa  54.3  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1358  mevalonate kinase  22.87 
 
 		 314 aa  53.9  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1710  GHMP kinase  25.34 
 
 		 350 aa  53.9  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1201  Galactokinase  25.93 
 
 		 410 aa  53.9  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  23.34 
 
 		 405 aa  53.5  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1602  mevalonate kinase  25.24 
 
 		 316 aa  53.1  0.000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0123084  normal  0.126865 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0657  galactokinase  25 
 
 		 387 aa  52.8  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0454  mevalonate kinase  23.61 
 
 		 310 aa  51.6  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0810  galactokinase  23.19 
 
 		 382 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0869  galactokinase  23.19 
 
 		 382 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0838  galactokinase  23.19 
 
 		 382 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0901  galactokinase  23.19 
 
 		 382 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0969  galactokinase  28.85 
 
 		 392 aa  50.4  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.003784  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0892  galactokinase  25.5 
 
 		 391 aa  50.4  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0958973 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3653  galactokinase  26.2 
 
 		 434 aa  50.1  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  22.9 
 
 		 382 aa  50.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  24.6 
 
 		 385 aa  49.3  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  26.09 
 
 		 391 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2045  mevalonate kinase  27.21 
 
 		 330 aa  49.3  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  23.27 
 
 		 369 aa  48.1  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0415  galactokinase  24.86 
 
 		 355 aa  48.5  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1736  mevalonate kinase  24.45 
 
 		 316 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2395  mevalonate kinase  23.91 
 
 		 303 aa  47.8  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000672574  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  23.24 
 
 		 389 aa  47.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  22.81 
 
 		 382 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  22.81 
 
 		 382 aa  47  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  22.81 
 
 		 382 aa  47  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  22.81 
 
 		 382 aa  47  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  22.81 
 
 		 382 aa  47  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0776  galactokinase  34.15 
 
 		 355 aa  46.6  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  27.17 
 
 		 349 aa  46.6  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  24.72 
 
 		 391 aa  46.2  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1248  galactokinase  21.97 
 
 		 382 aa  45.4  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2135  mevalonate kinase  23.63 
 
 		 314 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0997  galactokinase  27.83 
 
 		 362 aa  45.4  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00864415  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0467  mevalonate kinase  26.67 
 
 		 314 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.250256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0811  galactokinase  22.51 
 
 		 382 aa  44.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  22.51 
 
 		 382 aa  45.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2202  GHMP kinase  40 
 
 		 475 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2213  mevalonate kinase  25.63 
 
 		 289 aa  44.3  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0532  galactokinase  26.01 
 
 		 351 aa  44.3  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.560664  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1100  mevalonate kinase  23.32 
 
 		 306 aa  43.9  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.979552  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3018  galactokinase  22.02 
 
 		 361 aa  43.9  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2212  galactokinase  25 
 
 		 399 aa  43.9  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.180846  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1835  mevalonate kinase  25.76 
 
 		 310 aa  43.1  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.782527 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1000  GHMP kinase domain protein  22.62 
 
 		 370 aa  42.7  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00600942  normal  0.518194 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0646  mevalonate kinase  24.19 
 
 		 319 aa  42.7  0.01  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.199793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>