74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3977 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3977  GHMP kinase  100 
 
 		 327 aa  675    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5465  GHMP kinase  56.88 
 
 		 326 aa  327  1.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0206  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase, putative  48.93 
 
 		 325 aa  253  3e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0147  GHMP kinase  47.09 
 
 		 325 aa  251  1e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4245  GHMP kinase  40.55 
 
 		 328 aa  223  4e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.469148 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0788  GHMP kinase  40.24 
 
 		 328 aa  219  5e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0617  GHMP kinase  37.61 
 
 		 333 aa  214  9.999999999999999e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.170003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5597  GHMP kinase  42.64 
 
 		 326 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0793  GHMP kinase  40.91 
 
 		 331 aa  204  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4217  GHMP kinase  40.12 
 
 		 347 aa  191  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0447  GHMP kinase  38.62 
 
 		 347 aa  191  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4922  GHMP kinase  37.98 
 
 		 359 aa  182  8.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.272679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0153  GHMP kinase  37.8 
 
 		 347 aa  178  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1662  GHMP kinase  34.15 
 
 		 326 aa  175  8e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.501068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1635  GHMP kinase  34.15 
 
 		 326 aa  175  8e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1227  GHMP kinase  33.45 
 
 		 333 aa  159  6e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1068  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  32.8 
 
 		 346 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2174  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  32.8 
 
 		 346 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3278  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  32.8 
 
 		 346 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3243  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  32.8 
 
 		 346 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.455647  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0532  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  32.8 
 
 		 346 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22033  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3292  WcbL  32.8 
 
 		 346 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2296  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  32.8 
 
 		 346 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3600  GHMP kinase  35.95 
 
 		 349 aa  152  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0720  GHMP kinase  34.23 
 
 		 341 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3115  GHMP kinase  31.21 
 
 		 339 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0236  GHMP kinase  34.99 
 
 		 350 aa  138  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10116  D-alpha-D-heptose-7-phosphate kinase hddA  35.56 
 
 		 386 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1742  GHMP kinase  30.97 
 
 		 343 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.2795 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1610  capsular biosynthesis sugar kinase, putative  30.12 
 
 		 339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.594755  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1424  capsular biosynthesis sugar kinase, putative  30.56 
 
 		 339 aa  126  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.878412  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1759  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  29.82 
 
 		 339 aa  122  6e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.44471  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3668  GHMP kinase  31 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1374  GHMP kinase  31.53 
 
 		 337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0374  GHMP kinase  31.37 
 
 		 343 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.638274  normal  0.807327 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3581  GHMP kinase  31.33 
 
 		 345 aa  106  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1336  hypothetical protein  30.16 
 
 		 327 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.296421  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3592  GHMP kinase  25.16 
 
 		 354 aa  89  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.437274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0952  GHMP kinase  24.28 
 
 		 354 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.70731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2647  GHMP kinase  26.58 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2431  GHMP kinase  22.18 
 
 		 343 aa  62.8  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.696498  normal  0.378909 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1201  Galactokinase  25.93 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2135  mevalonate kinase  26.5 
 
 		 314 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0439  mevalonate kinase  25 
 
 		 328 aa  52  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  25.15 
 
 		 380 aa  52  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0454  mevalonate kinase  26.15 
 
 		 310 aa  51.2  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  25.96 
 
 		 391 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0891  mevalonate kinase  28.57 
 
 		 322 aa  50.1  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2604  mevalonate kinase  24.28 
 
 		 327 aa  49.7  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.395275  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  28.42 
 
 		 403 aa  49.3  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0819  Galactokinase  26.13 
 
 		 403 aa  48.9  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.847114  normal  0.0773074 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  22.67 
 
 		 349 aa  48.9  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1097  galactokinase  26.34 
 
 		 385 aa  48.9  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0010459  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0415  galactokinase  28.12 
 
 		 355 aa  48.9  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2945  galactokinase  28.57 
 
 		 383 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1411  galactokinase  28.57 
 
 		 383 aa  48.1  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0532  galactokinase  26.33 
 
 		 351 aa  48.1  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.560664  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2857  galactokinase  28.57 
 
 		 383 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00232  galactokinase  29.03 
 
 		 379 aa  47.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0476  mevalonate kinase  27.1 
 
 		 321 aa  47  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1736  mevalonate kinase  25.73 
 
 		 316 aa  47  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1628  galactokinase  24.02 
 
 		 350 aa  46.6  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1562  galactokinase  24.02 
 
 		 350 aa  46.6  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0315  mevalonate kinase  22.65 
 
 		 313 aa  46.2  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  29.7 
 
 		 391 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0579  GHMP kinase  24.31 
 
 		 361 aa  44.3  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000495739  decreased coverage  0.000433765 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0316  GHMP kinase  25.83 
 
 		 359 aa  44.3  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1835  mevalonate kinase  24.4 
 
 		 310 aa  44.3  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.782527 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  25.44 
 
 		 395 aa  43.9  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3336  galactokinase  27.03 
 
 		 409 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.325513  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2002  mevalonate kinase  26.45 
 
 		 356 aa  43.5  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.360358  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0939  galactokinase  20.36 
 
 		 389 aa  43.5  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0628  mevalonate kinase  23.43 
 
 		 306 aa  42.7  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0613  mevalonate kinase  23.43 
 
 		 306 aa  42.7  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>