82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0793 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0793  GHMP kinase  100 
 
 
331 aa  687    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0617  GHMP kinase  51.83 
 
 
333 aa  360  1e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.170003  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4922  GHMP kinase  43.4 
 
 
359 aa  259  5.0000000000000005e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.272679  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1635  GHMP kinase  41.54 
 
 
326 aa  256  4e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1662  GHMP kinase  41.54 
 
 
326 aa  256  4e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.501068  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0788  GHMP kinase  40.49 
 
 
328 aa  219  6e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1227  GHMP kinase  38.72 
 
 
333 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464209  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5597  GHMP kinase  42.02 
 
 
326 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0206  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase, putative  40.49 
 
 
325 aa  203  3e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3977  GHMP kinase  41.27 
 
 
327 aa  201  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0147  GHMP kinase  40.72 
 
 
325 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4245  GHMP kinase  37.04 
 
 
328 aa  196  5.000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.469148 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0153  GHMP kinase  38.44 
 
 
347 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5465  GHMP kinase  36.75 
 
 
326 aa  172  5.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0447  GHMP kinase  34.32 
 
 
347 aa  150  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4217  GHMP kinase  35.5 
 
 
347 aa  149  5e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3292  WcbL  32.41 
 
 
346 aa  135  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0532  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  32.41 
 
 
346 aa  135  9e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22033  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1068  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  32.41 
 
 
346 aa  135  9e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2296  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  32.41 
 
 
346 aa  135  9e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3243  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  32.41 
 
 
346 aa  135  9e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.455647  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3278  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  32.41 
 
 
346 aa  135  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2174  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  32.41 
 
 
346 aa  135  9e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1742  GHMP kinase  32.27 
 
 
343 aa  129  7.000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.2795 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0374  GHMP kinase  33.53 
 
 
343 aa  124  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.638274  normal  0.807327 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10116  D-alpha-D-heptose-7-phosphate kinase hddA  33.23 
 
 
386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3581  GHMP kinase  34.71 
 
 
345 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3115  GHMP kinase  29.11 
 
 
339 aa  119  7.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1374  GHMP kinase  34.71 
 
 
337 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1610  capsular biosynthesis sugar kinase, putative  28.66 
 
 
339 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.594755  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1424  capsular biosynthesis sugar kinase, putative  28.96 
 
 
339 aa  117  3.9999999999999997e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.878412  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1759  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  28.27 
 
 
339 aa  116  6.9999999999999995e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.44471  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0720  GHMP kinase  30.64 
 
 
341 aa  113  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0236  GHMP kinase  30.48 
 
 
350 aa  112  8.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3668  GHMP kinase  31.25 
 
 
336 aa  105  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3600  GHMP kinase  31.61 
 
 
349 aa  100  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1336  hypothetical protein  26.42 
 
 
327 aa  93.2  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.296421  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2431  GHMP kinase  25.73 
 
 
343 aa  87.4  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.696498  normal  0.378909 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2647  GHMP kinase  27.37 
 
 
293 aa  85.9  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3592  GHMP kinase  26.87 
 
 
354 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.437274  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0952  GHMP kinase  25.16 
 
 
354 aa  69.7  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.70731  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0891  mevalonate kinase  26.23 
 
 
322 aa  69.3  0.00000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2395  mevalonate kinase  23.64 
 
 
303 aa  62.4  0.000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000672574  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0316  GHMP kinase  25.57 
 
 
359 aa  57.4  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4315  mevalonate kinase  24.66 
 
 
313 aa  53.1  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10631  galactokinase  23.79 
 
 
363 aa  52  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00193784  normal  0.94952 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2085  galactokinase  23.51 
 
 
394 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  23.53 
 
 
403 aa  52  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  22.32 
 
 
393 aa  51.6  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1100  mevalonate kinase  23.66 
 
 
306 aa  51.6  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.979552  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2085  galactokinase  22.9 
 
 
385 aa  51.6  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351225  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  21.88 
 
 
389 aa  50.4  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2002  mevalonate kinase  41.89 
 
 
356 aa  50.4  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.360358  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0454  mevalonate kinase  22.67 
 
 
310 aa  50.4  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  22.89 
 
 
372 aa  49.7  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0776  galactokinase  21.94 
 
 
355 aa  49.7  0.00008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  23.4 
 
 
359 aa  49.3  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  24.23 
 
 
349 aa  48.5  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  20.82 
 
 
395 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  22.22 
 
 
385 aa  47.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  25 
 
 
391 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  26.83 
 
 
405 aa  46.6  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  21.64 
 
 
380 aa  46.2  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0439  mevalonate kinase  24.77 
 
 
328 aa  46.2  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1000  GHMP kinase domain protein  26.85 
 
 
370 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00600942  normal  0.518194 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0536  galactokinase  23.78 
 
 
396 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2607  galactokinase  25.5 
 
 
399 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00377614  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40742  mevalonate kinase  26.05 
 
 
432 aa  45.8  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0150941 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  23.75 
 
 
387 aa  45.4  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  21.68 
 
 
414 aa  44.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1201  Galactokinase  27.84 
 
 
410 aa  44.3  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2604  mevalonate kinase  26.76 
 
 
327 aa  43.9  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.395275  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1829  mevalonate kinase  27.7 
 
 
338 aa  43.9  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1835  mevalonate kinase  25.24 
 
 
310 aa  43.9  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.782527 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  25.36 
 
 
391 aa  43.5  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0315  mevalonate kinase  23.45 
 
 
313 aa  43.5  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1326  mevalonate kinase, putative  24.89 
 
 
292 aa  43.5  0.006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0418302  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0425  galactokinase  22.32 
 
 
351 aa  43.1  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64864  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40817  predicted protein  18.6 
 
 
382 aa  43.1  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3238  galactokinase  38.46 
 
 
397 aa  42.7  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.217049  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0467  mevalonate kinase  22.25 
 
 
314 aa  42.7  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.250256  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  26.38 
 
 
369 aa  42.7  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>