151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1374 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1374  GHMP kinase  100 
 
 		 337 aa  688    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3581  GHMP kinase  97.92 
 
 		 345 aa  626  1e-178  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0374  GHMP kinase  77.15 
 
 		 343 aa  504  1e-141  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.638274  normal  0.807327 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3668  GHMP kinase  71.51 
 
 		 336 aa  469  1.0000000000000001e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0236  GHMP kinase  39.53 
 
 		 350 aa  211  1e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2296  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  37.61 
 
 		 346 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3292  WcbL  37.61 
 
 		 346 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0532  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  37.61 
 
 		 346 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22033  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1068  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  37.61 
 
 		 346 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3243  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  37.61 
 
 		 346 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.455647  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3278  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  37.61 
 
 		 346 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2174  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  37.61 
 
 		 346 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3115  GHMP kinase  37.28 
 
 		 339 aa  181  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1610  capsular biosynthesis sugar kinase, putative  34.97 
 
 		 339 aa  177  2e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.594755  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1424  capsular biosynthesis sugar kinase, putative  34.97 
 
 		 339 aa  176  6e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.878412  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1759  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  34.97 
 
 		 339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.44471  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1742  GHMP kinase  34.69 
 
 		 343 aa  172  5.999999999999999e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.2795 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0720  GHMP kinase  36.39 
 
 		 341 aa  162  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10116  D-alpha-D-heptose-7-phosphate kinase hddA  36.03 
 
 		 386 aa  153  5e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0153  GHMP kinase  34.46 
 
 		 347 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0617  GHMP kinase  33.44 
 
 		 333 aa  137  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.170003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4217  GHMP kinase  33.43 
 
 		 347 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0447  GHMP kinase  32.94 
 
 		 347 aa  120  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0793  GHMP kinase  34.71 
 
 		 331 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1635  GHMP kinase  33.77 
 
 		 326 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1662  GHMP kinase  33.77 
 
 		 326 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.501068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0147  GHMP kinase  32.48 
 
 		 325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0206  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase, putative  29.29 
 
 		 325 aa  110  5e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3977  GHMP kinase  31.53 
 
 		 327 aa  109  7.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4245  GHMP kinase  29.68 
 
 		 328 aa  105  8e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.469148 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5597  GHMP kinase  33.12 
 
 		 326 aa  105  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5465  GHMP kinase  33.45 
 
 		 326 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4922  GHMP kinase  32.84 
 
 		 359 aa  101  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.272679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3592  GHMP kinase  29.35 
 
 		 354 aa  99  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.437274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0788  GHMP kinase  27.89 
 
 		 328 aa  98.6  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1227  GHMP kinase  29.29 
 
 		 333 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0952  GHMP kinase  26.87 
 
 		 354 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.70731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2647  GHMP kinase  30.03 
 
 		 293 aa  87  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3600  GHMP kinase  33.45 
 
 		 349 aa  85.9  8e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0891  mevalonate kinase  27.14 
 
 		 322 aa  85.5  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  28.7 
 
 		 349 aa  75.5  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210895 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2212  galactokinase  29.07 
 
 		 399 aa  71.2  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.180846  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  26.59 
 
 		 385 aa  71.6  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0579  GHMP kinase  45.95 
 
 		 361 aa  70.9  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000495739  decreased coverage  0.000433765 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2431  GHMP kinase  24.7 
 
 		 343 aa  70.1  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.696498  normal  0.378909 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0578  galactokinase  22.87 
 
 		 388 aa  69.7  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0620  phosphomevalonate kinase  27.48 
 
 		 313 aa  69.7  0.00000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.373049  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0721  mevalonate kinase  27.48 
 
 		 313 aa  69.7  0.00000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00059401  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1114  GHMP kinase  48.72 
 
 		 382 aa  69.3  0.00000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  28.49 
 
 		 349 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0657  galactokinase  27.43 
 
 		 387 aa  67  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0316  GHMP kinase  33.33 
 
 		 359 aa  66.6  0.0000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1336  hypothetical protein  23.51 
 
 		 327 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.296421  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  21.88 
 
 		 383 aa  63.5  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1516  galactokinase  21.37 
 
 		 385 aa  62.8  0.000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2604  mevalonate kinase  25.63 
 
 		 327 aa  62.4  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.395275  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0439  mevalonate kinase  26.33 
 
 		 328 aa  62.4  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0536  galactokinase  22.16 
 
 		 396 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  26.15 
 
 		 369 aa  61.2  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1677  galactokinase  28 
 
 		 400 aa  61.2  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114591 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0776  galactokinase  28.34 
 
 		 355 aa  61.6  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2395  mevalonate kinase  26.11 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000672574  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1710  GHMP kinase  28.06 
 
 		 350 aa  59.3  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2085  galactokinase  22.26 
 
 		 394 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  29.09 
 
 		 403 aa  59.3  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  25.61 
 
 		 395 aa  58.9  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  22.87 
 
 		 387 aa  58.9  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0476  mevalonate kinase  28.3 
 
 		 321 aa  58.5  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10631  galactokinase  30.08 
 
 		 363 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00193784  normal  0.94952 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  20.94 
 
 		 386 aa  58.2  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0315  mevalonate kinase  23.49 
 
 		 313 aa  57  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2202  GHMP kinase  24.86 
 
 		 475 aa  56.6  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0681  mevalonate kinase  24.53 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2135  mevalonate kinase  28.76 
 
 		 314 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0577  galactokinase  29.45 
 
 		 384 aa  55.5  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  23.17 
 
 		 387 aa  55.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2481  galactokinase  26.15 
 
 		 348 aa  54.7  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.883324  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2692  galactokinase  27.02 
 
 		 392 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  0.174085 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4315  mevalonate kinase  22.96 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  24.35 
 
 		 414 aa  55.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40817  predicted protein  34.88 
 
 		 382 aa  53.5  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  25.45 
 
 		 380 aa  53.5  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  27.54 
 
 		 359 aa  53.5  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1552  galactokinase  23.49 
 
 		 387 aa  52.8  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  23.49 
 
 		 387 aa  52.8  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1201  Galactokinase  26.98 
 
 		 410 aa  52.8  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  23.55 
 
 		 391 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3018  galactokinase  26.38 
 
 		 361 aa  52.4  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1736  mevalonate kinase  26.11 
 
 		 316 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00232  galactokinase  22.97 
 
 		 379 aa  52  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  27.03 
 
 		 372 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2002  mevalonate kinase  30.71 
 
 		 356 aa  50.4  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.360358  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0580  mevalonate kinase  23.28 
 
 		 317 aa  50.1  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.761954  normal  0.0461716 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1000  GHMP kinase domain protein  27.33 
 
 		 370 aa  50.1  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00600942  normal  0.518194 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  26.87 
 
 		 389 aa  50.1  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2376  mevalonate kinase  28.17 
 
 		 289 aa  49.7  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1069  galactokinase  22.45 
 
 		 396 aa  49.3  0.00008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1033  mevalonate kinase  22.71 
 
 		 322 aa  48.9  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1562  galactokinase  25.62 
 
 		 350 aa  48.9  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1628  galactokinase  25.62 
 
 		 350 aa  48.9  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>