113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1227 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1227  GHMP kinase  100 
 
 		 333 aa  676    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0617  GHMP kinase  41.16 
 
 		 333 aa  249  5e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.170003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0793  GHMP kinase  40 
 
 		 331 aa  204  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1635  GHMP kinase  37.88 
 
 		 326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1662  GHMP kinase  37.88 
 
 		 326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.501068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4922  GHMP kinase  38.37 
 
 		 359 aa  191  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.272679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0147  GHMP kinase  38.18 
 
 		 325 aa  182  7e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0206  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase, putative  37.69 
 
 		 325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4245  GHMP kinase  34.53 
 
 		 328 aa  169  6e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.469148 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0788  GHMP kinase  33.63 
 
 		 328 aa  159  7e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5465  GHMP kinase  36.45 
 
 		 326 aa  156  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5597  GHMP kinase  30.82 
 
 		 326 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0447  GHMP kinase  33.09 
 
 		 347 aa  140  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3977  GHMP kinase  33.13 
 
 		 327 aa  139  8.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4217  GHMP kinase  32.1 
 
 		 347 aa  132  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0720  GHMP kinase  31.15 
 
 		 341 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0153  GHMP kinase  29.24 
 
 		 347 aa  126  6e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1742  GHMP kinase  29.63 
 
 		 343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.2795 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1424  capsular biosynthesis sugar kinase, putative  28.62 
 
 		 339 aa  114  3e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.878412  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1759  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  29.47 
 
 		 339 aa  113  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.44471  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1610  capsular biosynthesis sugar kinase, putative  29.15 
 
 		 339 aa  113  5e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.594755  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0236  GHMP kinase  27.68 
 
 		 350 aa  107  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3115  GHMP kinase  26.8 
 
 		 339 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2296  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  29.34 
 
 		 346 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3292  WcbL  29.34 
 
 		 346 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0532  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  29.34 
 
 		 346 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22033  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1068  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  29.34 
 
 		 346 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3243  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  29.34 
 
 		 346 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.455647  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3278  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  29.34 
 
 		 346 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2174  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  29.34 
 
 		 346 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3600  GHMP kinase  29.79 
 
 		 349 aa  100  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3668  GHMP kinase  27.66 
 
 		 336 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1336  hypothetical protein  29.18 
 
 		 327 aa  96.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.296421  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10116  D-alpha-D-heptose-7-phosphate kinase hddA  29.32 
 
 		 386 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0374  GHMP kinase  25.17 
 
 		 343 aa  89.7  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.638274  normal  0.807327 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3581  GHMP kinase  28.62 
 
 		 345 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1374  GHMP kinase  29.01 
 
 		 337 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3592  GHMP kinase  27.12 
 
 		 354 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.437274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0952  GHMP kinase  26.47 
 
 		 354 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.70731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  27.76 
 
 		 403 aa  65.1  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  26.8 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2647  GHMP kinase  28.63 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  24.43 
 
 		 383 aa  62  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1829  mevalonate kinase  25.99 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  26.09 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  29.39 
 
 		 359 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0315  mevalonate kinase  25.41 
 
 		 313 aa  57  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  27.49 
 
 		 349 aa  56.6  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210895 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1710  GHMP kinase  24.42 
 
 		 350 aa  56.6  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2085  galactokinase  25.45 
 
 		 394 aa  56.6  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0776  galactokinase  27.27 
 
 		 355 aa  56.2  0.0000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2431  GHMP kinase  21.99 
 
 		 343 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.696498  normal  0.378909 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0316  GHMP kinase  28.2 
 
 		 359 aa  55.1  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1201  Galactokinase  32.46 
 
 		 410 aa  54.7  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0681  mevalonate kinase  28.22 
 
 		 290 aa  52.8  0.000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2481  galactokinase  25.32 
 
 		 348 aa  52.4  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.883324  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2212  galactokinase  26.95 
 
 		 399 aa  51.2  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.180846  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1114  GHMP kinase  27.82 
 
 		 382 aa  51.2  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0415  galactokinase  24.52 
 
 		 355 aa  51.6  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  26.09 
 
 		 389 aa  51.6  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  24.43 
 
 		 393 aa  50.8  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1197  galactokinase  24.51 
 
 		 405 aa  50.8  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.765458  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  26.5 
 
 		 349 aa  50.8  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0939  galactokinase  22.68 
 
 		 389 aa  50.8  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2888  galactokinase  26.27 
 
 		 383 aa  50.4  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10631  galactokinase  25.51 
 
 		 363 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00193784  normal  0.94952 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  28.63 
 
 		 385 aa  50.4  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1097  galactokinase  28.4 
 
 		 385 aa  49.3  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0010459  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0997  galactokinase  25 
 
 		 362 aa  48.9  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00864415  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0891  mevalonate kinase  25.76 
 
 		 322 aa  49.3  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1248  galactokinase  21.69 
 
 		 382 aa  48.1  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0577  galactokinase  23.66 
 
 		 384 aa  48.1  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0502  galactokinase  26.22 
 
 		 384 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.592539  normal  0.852074 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  25.07 
 
 		 382 aa  48.1  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0439  mevalonate kinase  28.82 
 
 		 328 aa  48.5  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2604  mevalonate kinase  27.99 
 
 		 327 aa  48.5  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.395275  normal  0.323877 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  23.5 
 
 		 382 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1677  galactokinase  38.53 
 
 		 400 aa  47.4  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114591 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  23.5 
 
 		 382 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  23.5 
 
 		 382 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  23.5 
 
 		 382 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  22.89 
 
 		 382 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0810  galactokinase  22.44 
 
 		 382 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  23.5 
 
 		 382 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2395  mevalonate kinase  23.89 
 
 		 303 aa  47.4  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000672574  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  29.76 
 
 		 414 aa  47.4  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2152  galactokinase  27.63 
 
 		 358 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  24.86 
 
 		 386 aa  47  0.0005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4315  mevalonate kinase  43.1 
 
 		 313 aa  46.6  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0652  galactokinase  22.41 
 
 		 388 aa  46.6  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.430663  hitchhiker  0.00000383534 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0869  galactokinase  22.62 
 
 		 382 aa  46.6  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  25.73 
 
 		 391 aa  46.2  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0901  galactokinase  22.62 
 
 		 382 aa  46.6  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2002  mevalonate kinase  40.24 
 
 		 356 aa  46.2  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.360358  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0838  galactokinase  22.62 
 
 		 382 aa  46.2  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0579  GHMP kinase  23.44 
 
 		 361 aa  45.4  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000495739  decreased coverage  0.000433765 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3717  galactokinase  24.86 
 
 		 376 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0664685  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1326  mevalonate kinase, putative  31.54 
 
 		 292 aa  44.7  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0418302  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1701  galactokinase  25.43 
 
 		 398 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  24.57 
 
 		 391 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>