97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_3243 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A0532  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  100 
 
 
346 aa  719    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22033  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2296  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  100 
 
 
346 aa  719    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3292  WcbL  100 
 
 
346 aa  719    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2174  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  100 
 
 
346 aa  719    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3278  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  100 
 
 
346 aa  719    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3243  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  100 
 
 
346 aa  719    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.455647  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1068  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  100 
 
 
346 aa  719    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0720  GHMP kinase  58.36 
 
 
341 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3115  GHMP kinase  52.79 
 
 
339 aa  329  5.0000000000000004e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1742  GHMP kinase  51.03 
 
 
343 aa  328  9e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.2795 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1759  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  48.97 
 
 
339 aa  316  3e-85  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.44471  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1610  capsular biosynthesis sugar kinase, putative  48.97 
 
 
339 aa  315  6e-85  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.594755  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1424  capsular biosynthesis sugar kinase, putative  48.67 
 
 
339 aa  313  2.9999999999999996e-84  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.878412  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10116  D-alpha-D-heptose-7-phosphate kinase hddA  47.8 
 
 
386 aa  277  2e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0236  GHMP kinase  46.09 
 
 
350 aa  249  6e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3668  GHMP kinase  39.07 
 
 
336 aa  197  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0374  GHMP kinase  38.95 
 
 
343 aa  188  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.638274  normal  0.807327 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1374  GHMP kinase  37.61 
 
 
337 aa  171  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3581  GHMP kinase  37.32 
 
 
345 aa  168  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0153  GHMP kinase  35.14 
 
 
347 aa  145  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0447  GHMP kinase  32.38 
 
 
347 aa  144  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0617  GHMP kinase  30.59 
 
 
333 aa  135  7.000000000000001e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.170003  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4217  GHMP kinase  31.14 
 
 
347 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3977  GHMP kinase  32.8 
 
 
327 aa  132  6e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0206  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase, putative  30.07 
 
 
325 aa  129  7.000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0147  GHMP kinase  30.64 
 
 
325 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0788  GHMP kinase  31.23 
 
 
328 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0793  GHMP kinase  32.41 
 
 
331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5465  GHMP kinase  33.11 
 
 
326 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4922  GHMP kinase  30.67 
 
 
359 aa  116  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.272679  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1635  GHMP kinase  31.67 
 
 
326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1662  GHMP kinase  31.67 
 
 
326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.501068  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5597  GHMP kinase  31.08 
 
 
326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4245  GHMP kinase  27.21 
 
 
328 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.469148 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1227  GHMP kinase  28.14 
 
 
333 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464209  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0952  GHMP kinase  27.07 
 
 
354 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.70731  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2647  GHMP kinase  28.53 
 
 
293 aa  99.4  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3592  GHMP kinase  26.73 
 
 
354 aa  99  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.437274  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3600  GHMP kinase  29.9 
 
 
349 aa  83.6  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0316  GHMP kinase  24.9 
 
 
359 aa  64.7  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2431  GHMP kinase  24.71 
 
 
343 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.696498  normal  0.378909 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0891  mevalonate kinase  24.81 
 
 
322 aa  60.5  0.00000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0579  GHMP kinase  40.54 
 
 
361 aa  57  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000495739  decreased coverage  0.000433765 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1114  GHMP kinase  25.19 
 
 
382 aa  56.6  0.0000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0439  mevalonate kinase  26.61 
 
 
328 aa  55.8  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  28.74 
 
 
403 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  26.02 
 
 
359 aa  54.3  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  25.42 
 
 
349 aa  54.7  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  29.35 
 
 
369 aa  54.3  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0776  galactokinase  22.67 
 
 
355 aa  54.3  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0425  galactokinase  29.79 
 
 
351 aa  53.9  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64864  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2604  mevalonate kinase  27.91 
 
 
327 aa  53.9  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.395275  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  25.44 
 
 
349 aa  53.5  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.210895 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4315  mevalonate kinase  23.47 
 
 
313 aa  52.8  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0578  galactokinase  21.37 
 
 
388 aa  52.8  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2395  mevalonate kinase  26.53 
 
 
303 aa  52.4  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000672574  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  28.24 
 
 
380 aa  52.4  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0681  mevalonate kinase  26.87 
 
 
290 aa  52  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  26.04 
 
 
391 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  23.38 
 
 
414 aa  50.8  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1829  mevalonate kinase  27.57 
 
 
338 aa  50.4  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40817  predicted protein  24.26 
 
 
382 aa  50.4  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0454  mevalonate kinase  24.32 
 
 
310 aa  50.1  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4019  galactokinase  29.06 
 
 
357 aa  49.3  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1201  Galactokinase  24.5 
 
 
410 aa  48.5  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  21.87 
 
 
383 aa  47.8  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2888  galactokinase  24.05 
 
 
383 aa  47.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1562  galactokinase  24.85 
 
 
350 aa  47.4  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0657  galactokinase  31.52 
 
 
387 aa  47  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1628  galactokinase  24.85 
 
 
350 aa  47.4  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  25.75 
 
 
395 aa  47.4  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4110  galactokinase  31.73 
 
 
356 aa  47  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1248  galactokinase  28.9 
 
 
382 aa  46.6  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10631  galactokinase  23.35 
 
 
363 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00193784  normal  0.94952 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0415  galactokinase  27.59 
 
 
355 aa  47  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2212  galactokinase  27.22 
 
 
399 aa  46.2  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.180846  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2152  galactokinase  29.91 
 
 
358 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1632  galactokinase  26.11 
 
 
394 aa  46.6  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0476  mevalonate kinase  27.31 
 
 
321 aa  45.4  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1336  hypothetical protein  21.84 
 
 
327 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.296421  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0819  Galactokinase  22.63 
 
 
403 aa  45.4  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.847114  normal  0.0773074 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2085  galactokinase  22.54 
 
 
394 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0577  galactokinase  30.64 
 
 
384 aa  44.7  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0899  homoserine kinase  26.83 
 
 
306 aa  43.9  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.29792  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0838  galactokinase  28.32 
 
 
382 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1338  mevalonate kinase  31.4 
 
 
317 aa  43.5  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.332068  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  25 
 
 
372 aa  43.5  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0901  galactokinase  28.32 
 
 
382 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  28.32 
 
 
382 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0869  galactokinase  28.32 
 
 
382 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0647  galactokinase  26.86 
 
 
389 aa  43.5  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00202468  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  23.24 
 
 
393 aa  43.5  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0214  GHMP kinase  28.81 
 
 
355 aa  43.1  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0700927  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3018  galactokinase  23.58 
 
 
361 aa  43.1  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1677  galactokinase  22.48 
 
 
400 aa  43.1  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114591 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1033  mevalonate kinase  24.88 
 
 
322 aa  42.7  0.009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  27.17 
 
 
382 aa  42.7  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>