239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0899 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0899  homoserine kinase  100 
 
 
306 aa  632  1e-180  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.29792  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1391  homoserine kinase  67.66 
 
 
304 aa  439  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00775199  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1418  homoserine kinase  67.66 
 
 
304 aa  439  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.011674  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2894  homoserine kinase  40.61 
 
 
304 aa  243  3e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.710654  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3039  homoserine kinase  40.49 
 
 
304 aa  238  5.999999999999999e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2053  homoserine kinase  45.68 
 
 
297 aa  236  3e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0296035  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2075  homoserine kinase  45.13 
 
 
297 aa  235  7e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000541431  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1835  homoserine kinase  45.13 
 
 
297 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.439683  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1827  homoserine kinase  44.77 
 
 
297 aa  231  9e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.115577  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1970  homoserine kinase  44.77 
 
 
297 aa  231  9e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.358252  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1119  homoserine kinase  42.95 
 
 
288 aa  231  1e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1784  homoserine kinase  44.77 
 
 
297 aa  231  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1801  homoserine kinase  44.4 
 
 
297 aa  230  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0151771  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2004  homoserine kinase  44.4 
 
 
297 aa  230  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.268179999999999e-43 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1498  homoserine kinase  43.4 
 
 
297 aa  228  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121661  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1972  homoserine kinase  43.31 
 
 
297 aa  226  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0856158  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3355  homoserine kinase  43.88 
 
 
297 aa  225  8e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000409306  hitchhiker  0.0000000000000103928 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0507  homoserine kinase  43.33 
 
 
286 aa  219  3.9999999999999997e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1281  homoserine kinase  39.93 
 
 
296 aa  213  2.9999999999999995e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.045186  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0785  homoserine kinase  40.79 
 
 
292 aa  201  9.999999999999999e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1074  homoserine kinase  37.99 
 
 
287 aa  200  3e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000054772  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2478  homoserine kinase  33.93 
 
 
297 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.979123  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2794  homoserine kinase  40.15 
 
 
302 aa  177  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0354264  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2309  homoserine kinase  37.73 
 
 
308 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1166  homoserine kinase  37.37 
 
 
301 aa  170  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000188911  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2880  homoserine kinase  39.39 
 
 
303 aa  169  6e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0703126  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2115  homoserine kinase  36.19 
 
 
300 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.185248 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1440  homoserine kinase  34.21 
 
 
306 aa  166  4e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.231357  normal  0.456587 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1031  homoserine kinase  36.36 
 
 
315 aa  166  6.9999999999999995e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1305  homoserine kinase  37.54 
 
 
296 aa  166  6.9999999999999995e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5245  homoserine kinase  36.19 
 
 
304 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18581  homoserine kinase  36.7 
 
 
316 aa  163  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.566516 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2253  homoserine kinase  35 
 
 
317 aa  162  4.0000000000000004e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.227732  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0932  homoserine kinase  36 
 
 
315 aa  161  1e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.732555  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2698  homoserine kinase  35.96 
 
 
300 aa  161  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0218075  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0910  homoserine kinase  36.21 
 
 
311 aa  160  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000332858 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1960  homoserine kinase  34.98 
 
 
307 aa  159  4e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000160344  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1018  homoserine kinase  35.31 
 
 
305 aa  157  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06511  homoserine kinase  35.74 
 
 
315 aa  156  3e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.893933  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1080  homoserine kinase  35.38 
 
 
304 aa  155  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.129806 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14830  homoserine kinase  29.93 
 
 
297 aa  155  8e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17524  normal  0.116843 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0031  homoserine kinase  35.38 
 
 
315 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1897  homoserine kinase  35.16 
 
 
305 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359865  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1871  homoserine kinase  35.16 
 
 
305 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08010  homoserine kinase  32.85 
 
 
311 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0100938  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06601  homoserine kinase  35.64 
 
 
315 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06211  homoserine kinase  35.07 
 
 
315 aa  149  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0595  homoserine kinase  34.43 
 
 
315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10551  homoserine kinase  36.82 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06511  homoserine kinase  34.94 
 
 
302 aa  145  9e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1064  homoserine kinase  32.46 
 
 
303 aa  144  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2422  homoserine kinase  35.11 
 
 
316 aa  142  5e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1479  homoserine kinase  33.21 
 
 
315 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1318  homoserine kinase  30 
 
 
300 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.607391  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0320  homoserine kinase  32.46 
 
 
320 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.234549 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0593  homoserine kinase  31.71 
 
 
304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1023  homoserine kinase  37.82 
 
 
323 aa  139  7.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0538  homoserine kinase  30.32 
 
 
309 aa  139  7.999999999999999e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.283285  unclonable  0.0000000181031 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3124  homoserine kinase  31.84 
 
 
310 aa  138  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1581  homoserine kinase  30.57 
 
 
307 aa  136  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0885  homoserine kinase  33.69 
 
 
310 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16080  homoserine kinase  29.58 
 
 
293 aa  133  3e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.222088  hitchhiker  0.000000158758 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1201  homoserine kinase  31.27 
 
 
336 aa  132  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.326603  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46461  predicted protein  30.57 
 
 
426 aa  131  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.5833  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1794  homoserine kinase  32.19 
 
 
284 aa  130  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.324471  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0950  homoserine kinase  33.71 
 
 
290 aa  130  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.388606 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1368  homoserine kinase  29.58 
 
 
297 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0883  homoserine kinase  32.15 
 
 
307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000117754  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1788  homoserine kinase  30.27 
 
 
317 aa  127  3e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.542876  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2621  homoserine kinase  33.81 
 
 
305 aa  126  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1074  homoserine kinase  31.9 
 
 
313 aa  125  9e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1213  homoserine kinase  30.14 
 
 
314 aa  124  2e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.241016  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0632  homoserine kinase  31.97 
 
 
310 aa  124  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.305614  decreased coverage  0.0010744 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2050  homoserine kinase  30.29 
 
 
300 aa  124  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.189135  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0674  homoserine kinase  26.8 
 
 
293 aa  123  3e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0444063  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1057  homoserine kinase  32.01 
 
 
317 aa  124  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175086  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0118  homoserine kinase  30.92 
 
 
303 aa  123  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1681  homoserine kinase  28.99 
 
 
292 aa  123  5e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0164309  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0220  homoserine kinase  27.46 
 
 
292 aa  122  6e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000123965  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0074  homoserine kinase  29.94 
 
 
309 aa  122  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.281834 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_10263  predicted protein  34.19 
 
 
265 aa  122  9.999999999999999e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.111228  normal  0.879833 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3593  homoserine kinase  30.21 
 
 
310 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0002  homoserine kinase  30.21 
 
 
310 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.475933  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0004  homoserine kinase  30.21 
 
 
310 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00003  homoserine kinase  30.21 
 
 
310 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.646398  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3652  homoserine kinase  30.21 
 
 
310 aa  120  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0002  homoserine kinase  30.21 
 
 
310 aa  120  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0004  homoserine kinase  30.21 
 
 
310 aa  120  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00003  hypothetical protein  30.21 
 
 
310 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.716854  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0003  homoserine kinase  30.21 
 
 
310 aa  120  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0003  homoserine kinase  29.93 
 
 
309 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1746  homoserine kinase  30.4 
 
 
300 aa  120  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0611668  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08843  homoserine kinase (Eurofung)  31.41 
 
 
355 aa  119  4.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1495  homoserine kinase  29.14 
 
 
293 aa  119  4.9999999999999996e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.122475  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1493  homoserine kinase  26.69 
 
 
294 aa  119  6e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00125886  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1240  homoserine kinase  28.42 
 
 
314 aa  119  7e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000301538  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2354  homoserine kinase  34.07 
 
 
324 aa  119  7.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000501713 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0003  homoserine kinase  29.59 
 
 
309 aa  119  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0003  homoserine kinase  29.59 
 
 
309 aa  119  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.119068  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0003  homoserine kinase  29.59 
 
 
309 aa  119  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.45853  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>