209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0538 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0538  homoserine kinase  100 
 
 		 309 aa  638    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.283285  unclonable  0.0000000181031 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16080  homoserine kinase  49.82 
 
 		 293 aa  266  2e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.222088  hitchhiker  0.000000158758 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1960  homoserine kinase  36.15 
 
 		 307 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000160344  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2309  homoserine kinase  35.48 
 
 		 308 aa  172  5e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1166  homoserine kinase  36.21 
 
 		 301 aa  169  4e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000188911  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1305  homoserine kinase  39.06 
 
 		 296 aa  169  6e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2115  homoserine kinase  32.54 
 
 		 300 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.185248 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1064  homoserine kinase  33.97 
 
 		 303 aa  155  1e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5245  homoserine kinase  36.23 
 
 		 304 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1018  homoserine kinase  34.8 
 
 		 305 aa  151  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14830  homoserine kinase  33.96 
 
 		 297 aa  150  3e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17524  normal  0.116843 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1871  homoserine kinase  33.56 
 
 		 305 aa  149  7e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1080  homoserine kinase  32.74 
 
 		 304 aa  149  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.129806 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1897  homoserine kinase  33.22 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0596  homoserine kinase  34.8 
 
 		 293 aa  146  4.0000000000000006e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1440  homoserine kinase  35.97 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.231357  normal  0.456587 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1031  homoserine kinase  33.1 
 
 		 315 aa  143  4e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0593  homoserine kinase  33.58 
 
 		 304 aa  143  4e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1581  homoserine kinase  32.7 
 
 		 307 aa  142  8e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0932  homoserine kinase  34.47 
 
 		 315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.732555  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1057  homoserine kinase  36.47 
 
 		 317 aa  140  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2478  homoserine kinase  34.21 
 
 		 297 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.979123  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2794  homoserine kinase  32.94 
 
 		 302 aa  139  7e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0354264  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0899  homoserine kinase  30.32 
 
 		 306 aa  139  7.999999999999999e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.29792  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2880  homoserine kinase  33.21 
 
 		 303 aa  137  3.0000000000000003e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0703126  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0031  homoserine kinase  31.75 
 
 		 315 aa  136  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0674  homoserine kinase  30.63 
 
 		 293 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0444063  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06511  homoserine kinase  31.75 
 
 		 315 aa  136  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.893933  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1119  homoserine kinase  34.71 
 
 		 288 aa  135  9e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18581  homoserine kinase  31.94 
 
 		 316 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.566516 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2698  homoserine kinase  32.81 
 
 		 300 aa  135  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0218075  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1300  homoserine kinase  33.55 
 
 		 304 aa  133  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1318  homoserine kinase  31.82 
 
 		 300 aa  133  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.607391  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1368  homoserine kinase  30.26 
 
 		 297 aa  133  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1281  homoserine kinase  33.68 
 
 		 296 aa  132  6e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.045186  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0129  homoserine kinase  33.33 
 
 		 292 aa  132  7.999999999999999e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0595  homoserine kinase  31.25 
 
 		 315 aa  132  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08010  homoserine kinase  29.28 
 
 		 311 aa  132  7.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0100938  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0169  homoserine kinase  33.33 
 
 		 292 aa  132  7.999999999999999e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00243862  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46461  predicted protein  34.73 
 
 		 426 aa  132  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.5833  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1240  homoserine kinase  33.1 
 
 		 314 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000301538  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0320  homoserine kinase  33.83 
 
 		 320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.234549 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1074  homoserine kinase  33.8 
 
 		 313 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2050  homoserine kinase  34.09 
 
 		 300 aa  130  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.189135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06211  homoserine kinase  31.25 
 
 		 315 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0147  homoserine kinase  32.92 
 
 		 292 aa  130  3e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00399009  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06601  homoserine kinase  31.02 
 
 		 315 aa  129  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1794  homoserine kinase  35.48 
 
 		 284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.324471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1391  homoserine kinase  30.68 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00775199  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1418  homoserine kinase  30.68 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.011674  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0885  homoserine kinase  34.45 
 
 		 310 aa  127  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3124  homoserine kinase  33.33 
 
 		 310 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1074  homoserine kinase  30.74 
 
 		 287 aa  126  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000054772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0910  homoserine kinase  30.07 
 
 		 311 aa  126  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000332858 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19320  homoserine kinase  34.15 
 
 		 304 aa  126  6e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06511  homoserine kinase  30.99 
 
 		 302 aa  125  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0785  homoserine kinase  30.89 
 
 		 292 aa  124  3e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3355  homoserine kinase  29.97 
 
 		 297 aa  124  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000409306  hitchhiker  0.0000000000000103928 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1498  homoserine kinase  30.3 
 
 		 297 aa  124  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121661  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1201  homoserine kinase  33.45 
 
 		 336 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.326603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0507  homoserine kinase  34.35 
 
 		 286 aa  122  7e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1835  homoserine kinase  30.5 
 
 		 297 aa  122  8e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.439683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1784  homoserine kinase  30.66 
 
 		 297 aa  122  9e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4151  homoserine kinase  34.5 
 
 		 321 aa  122  9e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.317014  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2253  homoserine kinase  31.68 
 
 		 317 aa  122  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.227732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0246  homoserine kinase  30.74 
 
 		 294 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00137655  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2075  homoserine kinase  30.31 
 
 		 297 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000541431  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1827  homoserine kinase  30.31 
 
 		 297 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.115577  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1801  homoserine kinase  30.31 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0151771  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1970  homoserine kinase  30.31 
 
 		 297 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.358252  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2004  homoserine kinase  30.31 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.268179999999999e-43 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0950  homoserine kinase  36.29 
 
 		 290 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.388606 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2422  homoserine kinase  31.31 
 
 		 316 aa  120  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0220  homoserine kinase  28.4 
 
 		 292 aa  120  3e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000123965  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1972  homoserine kinase  30.5 
 
 		 297 aa  120  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0856158  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2053  homoserine kinase  31.01 
 
 		 297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0296035  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2894  homoserine kinase  31.52 
 
 		 304 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.710654  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1681  homoserine kinase  29.11 
 
 		 292 aa  119  7.999999999999999e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0164309  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3039  homoserine kinase  31.52 
 
 		 304 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1788  homoserine kinase  31.94 
 
 		 317 aa  118  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.542876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1479  homoserine kinase  32.34 
 
 		 315 aa  116  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1493  homoserine kinase  27.21 
 
 		 294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00125886  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2354  homoserine kinase  35.71 
 
 		 324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000501713 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0632  homoserine kinase  35.27 
 
 		 310 aa  114  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.305614  decreased coverage  0.0010744 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09890  homoserine kinase  32.71 
 
 		 315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2621  homoserine kinase  34.91 
 
 		 305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1650  Homoserine kinase  32.89 
 
 		 336 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0491324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0118  homoserine kinase  31.32 
 
 		 303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3936  homoserine kinase  35.96 
 
 		 316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1023  homoserine kinase  33.81 
 
 		 323 aa  110  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1746  homoserine kinase  35.98 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0611668  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85224  homoserine kinase  25.89 
 
 		 353 aa  110  3e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.481244  normal  0.37391 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10551  homoserine kinase  30.19 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0392  homoserine kinase  28.12 
 
 		 281 aa  107  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1007  homoserine kinase  33.21 
 
 		 317 aa  106  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0883  homoserine kinase  30.64 
 
 		 307 aa  105  7e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000117754  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0003  homoserine kinase  29.02 
 
 		 309 aa  105  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0003  homoserine kinase  29.02 
 
 		 309 aa  105  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.611229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0003  homoserine kinase  29.02 
 
 		 309 aa  105  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0003  homoserine kinase  29.02 
 
 		 309 aa  105  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.119068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>