211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2422 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2422  homoserine kinase  100 
 
 		 316 aa  627  1e-179  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0320  homoserine kinase  61.02 
 
 		 320 aa  356  2.9999999999999997e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.234549 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1201  homoserine kinase  53.44 
 
 		 336 aa  278  7e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.326603  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0885  homoserine kinase  51.1 
 
 		 310 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1057  homoserine kinase  52.56 
 
 		 317 aa  268  7e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4151  homoserine kinase  52.75 
 
 		 321 aa  268  1e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.317014  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1650  Homoserine kinase  47.81 
 
 		 336 aa  266  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0491324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1300  homoserine kinase  52.99 
 
 		 304 aa  253  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1788  homoserine kinase  47.91 
 
 		 317 aa  251  8.000000000000001e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.542876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19320  homoserine kinase  53.79 
 
 		 304 aa  249  5e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2354  homoserine kinase  49.35 
 
 		 324 aa  244  9.999999999999999e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000501713 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2621  homoserine kinase  48.54 
 
 		 305 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1746  homoserine kinase  57.14 
 
 		 300 aa  242  6e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0611668  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1254  homoserine kinase  55.31 
 
 		 328 aa  241  1e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0775555 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4029  homoserine kinase  51.44 
 
 		 314 aa  241  1e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116733 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3936  homoserine kinase  50.47 
 
 		 316 aa  240  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2463  homoserine kinase  56.76 
 
 		 310 aa  239  4e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635742  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3647  homoserine kinase  51.44 
 
 		 309 aa  236  3e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.529848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29940  homoserine kinase  50.49 
 
 		 291 aa  234  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.197382 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1007  homoserine kinase  51.47 
 
 		 317 aa  233  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0632  homoserine kinase  53.58 
 
 		 310 aa  232  5e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.305614  decreased coverage  0.0010744 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09890  homoserine kinase  53.93 
 
 		 315 aa  229  3e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1283  homoserine kinase  47.27 
 
 		 311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.335201 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1232  homoserine kinase  47.77 
 
 		 330 aa  213  4.9999999999999996e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1230  homoserine kinase  40.56 
 
 		 355 aa  199  3.9999999999999996e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000185797 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3880  homoserine kinase  50.73 
 
 		 314 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1903  homoserine kinase  45.42 
 
 		 336 aa  198  7.999999999999999e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6154  homoserine kinase  49.81 
 
 		 295 aa  198  7.999999999999999e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1608  Homoserine kinase  37.73 
 
 		 370 aa  197  3e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2300  homoserine kinase  48.15 
 
 		 315 aa  197  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2097  homoserine kinase  50.95 
 
 		 300 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000128102  normal  0.0746509 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3894  homoserine kinase  51.74 
 
 		 314 aa  193  4e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3968  homoserine kinase  51.74 
 
 		 314 aa  193  4e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353705  normal  0.701993 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2478  homoserine kinase  39.58 
 
 		 297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.979123  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2115  homoserine kinase  40.7 
 
 		 300 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.185248 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4346  homoserine kinase  49.41 
 
 		 314 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0197752  normal  0.0812998 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1166  homoserine kinase  40.68 
 
 		 301 aa  179  4e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000188911  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11323  homoserine kinase  47.66 
 
 		 316 aa  177  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2309  homoserine kinase  37.69 
 
 		 308 aa  177  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1074  homoserine kinase  43.96 
 
 		 313 aa  176  6e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46461  predicted protein  37.5 
 
 		 426 aa  170  3e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.5833  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1960  homoserine kinase  39.46 
 
 		 307 aa  167  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000160344  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1305  homoserine kinase  37.29 
 
 		 296 aa  167  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1240  homoserine kinase  40.58 
 
 		 314 aa  166  4e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000301538  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0910  homoserine kinase  38.49 
 
 		 311 aa  164  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000332858 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2880  homoserine kinase  38.64 
 
 		 303 aa  162  5.0000000000000005e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0703126  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1080  homoserine kinase  33.98 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.129806 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1871  homoserine kinase  34.81 
 
 		 305 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1581  homoserine kinase  36.6 
 
 		 307 aa  159  6e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08010  homoserine kinase  35.74 
 
 		 311 aa  159  7e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0100938  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1897  homoserine kinase  34.49 
 
 		 305 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359865  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0593  homoserine kinase  34.85 
 
 		 304 aa  158  1e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5245  homoserine kinase  40.3 
 
 		 304 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1064  homoserine kinase  37.88 
 
 		 303 aa  157  3e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2794  homoserine kinase  37.25 
 
 		 302 aa  154  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0354264  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1495  homoserine kinase  36.12 
 
 		 293 aa  152  8.999999999999999e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.122475  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1031  homoserine kinase  37.87 
 
 		 315 aa  150  2e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14830  homoserine kinase  38.91 
 
 		 297 aa  150  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17524  normal  0.116843 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1440  homoserine kinase  38.31 
 
 		 306 aa  149  5e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.231357  normal  0.456587 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0118  homoserine kinase  37.3 
 
 		 303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2698  homoserine kinase  33.82 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0218075  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1018  homoserine kinase  35.61 
 
 		 305 aa  147  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_10263  predicted protein  39.25 
 
 		 265 aa  147  3e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.111228  normal  0.879833 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18581  homoserine kinase  37.13 
 
 		 316 aa  146  5e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.566516 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0932  homoserine kinase  38.32 
 
 		 315 aa  145  6e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.732555  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0674  homoserine kinase  33.08 
 
 		 293 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0444063  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0950  homoserine kinase  41.92 
 
 		 290 aa  144  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.388606 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2050  homoserine kinase  42.05 
 
 		 300 aa  144  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.189135  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0899  homoserine kinase  35.11 
 
 		 306 aa  142  5e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.29792  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0031  homoserine kinase  34.94 
 
 		 315 aa  142  5e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0246  homoserine kinase  32.31 
 
 		 294 aa  142  5e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00137655  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06511  homoserine kinase  34.94 
 
 		 315 aa  142  9e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.893933  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0129  homoserine kinase  31.47 
 
 		 292 aa  141  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3124  homoserine kinase  41.22 
 
 		 310 aa  142  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0169  homoserine kinase  31.47 
 
 		 292 aa  141  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00243862  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06601  homoserine kinase  33.83 
 
 		 315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0147  homoserine kinase  31.47 
 
 		 292 aa  140  3e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00399009  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2253  homoserine kinase  40 
 
 		 317 aa  139  7e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.227732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0220  homoserine kinase  29.23 
 
 		 292 aa  139  8.999999999999999e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000123965  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0595  homoserine kinase  34.44 
 
 		 315 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1368  homoserine kinase  28.96 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06511  homoserine kinase  35.09 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06211  homoserine kinase  34.32 
 
 		 315 aa  138  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10551  homoserine kinase  35.51 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1794  homoserine kinase  42.37 
 
 		 284 aa  133  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.324471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1391  homoserine kinase  33.33 
 
 		 304 aa  133  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00775199  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1418  homoserine kinase  33.33 
 
 		 304 aa  133  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.011674  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1318  homoserine kinase  34.6 
 
 		 300 aa  132  7.999999999999999e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.607391  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1493  homoserine kinase  28.43 
 
 		 294 aa  132  9e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00125886  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1281  homoserine kinase  32.58 
 
 		 296 aa  131  2.0000000000000002e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.045186  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1681  homoserine kinase  28.76 
 
 		 292 aa  129  7.000000000000001e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0164309  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85224  homoserine kinase  31.03 
 
 		 353 aa  129  8.000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.481244  normal  0.37391 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1784  homoserine kinase  34.6 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1835  homoserine kinase  35.38 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.439683  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1801  homoserine kinase  34.6 
 
 		 297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0151771  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2004  homoserine kinase  34.6 
 
 		 297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.268179999999999e-43 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2075  homoserine kinase  34.22 
 
 		 297 aa  125  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000541431  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2053  homoserine kinase  31.49 
 
 		 297 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0296035  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1827  homoserine kinase  34.22 
 
 		 297 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.115577  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1970  homoserine kinase  34.22 
 
 		 297 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.358252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>