196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1232 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1232  homoserine kinase  100 
 
 		 330 aa  642    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1903  homoserine kinase  57.86 
 
 		 336 aa  287  1e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2300  homoserine kinase  53.99 
 
 		 315 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3880  homoserine kinase  53.37 
 
 		 314 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1201  homoserine kinase  52.96 
 
 		 336 aa  260  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.326603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3894  homoserine kinase  53.68 
 
 		 314 aa  249  6e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3968  homoserine kinase  53.68 
 
 		 314 aa  249  6e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353705  normal  0.701993 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4346  homoserine kinase  55.25 
 
 		 314 aa  248  7e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0197752  normal  0.0812998 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11323  homoserine kinase  52.91 
 
 		 316 aa  248  9e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0885  homoserine kinase  51.37 
 
 		 310 aa  242  5e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19320  homoserine kinase  50.35 
 
 		 304 aa  240  2e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1057  homoserine kinase  53.15 
 
 		 317 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3936  homoserine kinase  53.4 
 
 		 316 aa  238  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29940  homoserine kinase  52.4 
 
 		 291 aa  238  1e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.197382 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2422  homoserine kinase  47.77 
 
 		 316 aa  232  5e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1788  homoserine kinase  44.37 
 
 		 317 aa  232  6e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.542876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09890  homoserine kinase  54.77 
 
 		 315 aa  232  6e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1300  homoserine kinase  44.97 
 
 		 304 aa  230  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2463  homoserine kinase  54.08 
 
 		 310 aa  229  4e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635742  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3647  homoserine kinase  51.22 
 
 		 309 aa  228  9e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.529848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0632  homoserine kinase  49.82 
 
 		 310 aa  228  2e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.305614  decreased coverage  0.0010744 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4151  homoserine kinase  47.9 
 
 		 321 aa  225  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.317014  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0320  homoserine kinase  47.06 
 
 		 320 aa  224  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.234549 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1650  Homoserine kinase  45.31 
 
 		 336 aa  223  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0491324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4029  homoserine kinase  49.13 
 
 		 314 aa  223  4e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116733 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1283  homoserine kinase  47.74 
 
 		 311 aa  213  2.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.335201 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1007  homoserine kinase  50.34 
 
 		 317 aa  213  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1254  homoserine kinase  45.86 
 
 		 328 aa  211  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0775555 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2097  homoserine kinase  49.82 
 
 		 300 aa  206  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000128102  normal  0.0746509 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6154  homoserine kinase  50.86 
 
 		 295 aa  206  6e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1746  homoserine kinase  45.08 
 
 		 300 aa  203  4e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0611668  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3723  homoserine kinase  41.96 
 
 		 389 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.422816  normal  0.66686 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2621  homoserine kinase  45.61 
 
 		 305 aa  182  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1166  homoserine kinase  39.86 
 
 		 301 aa  176  5e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000188911  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2354  homoserine kinase  43.79 
 
 		 324 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000501713 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1960  homoserine kinase  38.14 
 
 		 307 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000160344  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2309  homoserine kinase  34.08 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1230  homoserine kinase  40.25 
 
 		 355 aa  169  4e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000185797 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2478  homoserine kinase  36.66 
 
 		 297 aa  168  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.979123  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1074  homoserine kinase  44.07 
 
 		 313 aa  168  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1608  Homoserine kinase  39.04 
 
 		 370 aa  167  2e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2115  homoserine kinase  35.03 
 
 		 300 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.185248 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46461  predicted protein  37.93 
 
 		 426 aa  160  4e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.5833  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1581  homoserine kinase  33.68 
 
 		 307 aa  159  4e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5245  homoserine kinase  39.02 
 
 		 304 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0118  homoserine kinase  37.16 
 
 		 303 aa  151  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1440  homoserine kinase  35.65 
 
 		 306 aa  149  9e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.231357  normal  0.456587 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1305  homoserine kinase  36.51 
 
 		 296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1240  homoserine kinase  38.85 
 
 		 314 aa  147  3e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000301538  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2880  homoserine kinase  33.67 
 
 		 303 aa  145  6e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0703126  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1871  homoserine kinase  35.27 
 
 		 305 aa  145  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1897  homoserine kinase  34.93 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1495  homoserine kinase  32.17 
 
 		 293 aa  144  2e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.122475  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1064  homoserine kinase  33.12 
 
 		 303 aa  144  3e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0593  homoserine kinase  31.95 
 
 		 304 aa  144  3e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_10263  predicted protein  36.99 
 
 		 265 aa  139  4.999999999999999e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.111228  normal  0.879833 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1031  homoserine kinase  33.11 
 
 		 315 aa  139  8.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1080  homoserine kinase  35.26 
 
 		 304 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.129806 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1018  homoserine kinase  33.45 
 
 		 305 aa  137  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18581  homoserine kinase  32.77 
 
 		 316 aa  135  9e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.566516 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0031  homoserine kinase  32.31 
 
 		 315 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06511  homoserine kinase  32.31 
 
 		 315 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.893933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06211  homoserine kinase  31.76 
 
 		 315 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2794  homoserine kinase  34.97 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0354264  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06601  homoserine kinase  31.97 
 
 		 315 aa  133  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0932  homoserine kinase  32.77 
 
 		 315 aa  133  5e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.732555  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3124  homoserine kinase  37.93 
 
 		 310 aa  132  6e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14830  homoserine kinase  38.57 
 
 		 297 aa  132  6.999999999999999e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17524  normal  0.116843 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0595  homoserine kinase  30.89 
 
 		 315 aa  132  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2698  homoserine kinase  31.74 
 
 		 300 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0218075  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1281  homoserine kinase  32.36 
 
 		 296 aa  131  2.0000000000000002e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.045186  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0910  homoserine kinase  33.01 
 
 		 311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000332858 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0883  homoserine kinase  40.08 
 
 		 307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000117754  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1368  homoserine kinase  29.62 
 
 		 297 aa  129  6e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06511  homoserine kinase  30.8 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16080  homoserine kinase  32.43 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.222088  hitchhiker  0.000000158758 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1318  homoserine kinase  33.56 
 
 		 300 aa  127  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.607391  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1493  homoserine kinase  29.51 
 
 		 294 aa  126  6e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00125886  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0674  homoserine kinase  30.45 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0444063  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3355  homoserine kinase  31.37 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000409306  hitchhiker  0.0000000000000103928 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08010  homoserine kinase  30.38 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0100938  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0246  homoserine kinase  28.32 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00137655  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08843  homoserine kinase (Eurofung)  32.93 
 
 		 355 aa  123  5e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1119  homoserine kinase  30.1 
 
 		 288 aa  122  7e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1784  homoserine kinase  31.37 
 
 		 297 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1801  homoserine kinase  31.37 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0151771  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2004  homoserine kinase  31.37 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.268179999999999e-43 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1827  homoserine kinase  31.05 
 
 		 297 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.115577  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1970  homoserine kinase  31.05 
 
 		 297 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.358252  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1972  homoserine kinase  31.08 
 
 		 297 aa  120  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0856158  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1835  homoserine kinase  31.86 
 
 		 297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.439683  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08040  homoserine kinase  51.25 
 
 		 162 aa  119  4.9999999999999996e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85224  homoserine kinase  30.94 
 
 		 353 aa  119  7e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.481244  normal  0.37391 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2075  homoserine kinase  31.05 
 
 		 297 aa  119  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000541431  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2053  homoserine kinase  29.66 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0296035  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0220  homoserine kinase  28.47 
 
 		 292 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000123965  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0147  homoserine kinase  29.5 
 
 		 292 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00399009  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0129  homoserine kinase  29.5 
 
 		 292 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0507  homoserine kinase  31.11 
 
 		 286 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0169  homoserine kinase  29.5 
 
 		 292 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00243862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>