203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1903 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1903  homoserine kinase  100 
 
 
336 aa  652    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1232  homoserine kinase  57.94 
 
 
330 aa  302  5.000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3880  homoserine kinase  56.59 
 
 
314 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2300  homoserine kinase  55.63 
 
 
315 aa  255  8e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3894  homoserine kinase  56.91 
 
 
314 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3968  homoserine kinase  56.91 
 
 
314 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353705  normal  0.701993 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1283  homoserine kinase  52.86 
 
 
311 aa  243  5e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.335201 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1057  homoserine kinase  52.59 
 
 
317 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175086  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4346  homoserine kinase  55.37 
 
 
314 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0197752  normal  0.0812998 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1788  homoserine kinase  50.19 
 
 
317 aa  238  1e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.542876  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1201  homoserine kinase  49.82 
 
 
336 aa  233  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.326603  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09890  homoserine kinase  53.85 
 
 
315 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19320  homoserine kinase  51.85 
 
 
304 aa  232  6e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11323  homoserine kinase  52.98 
 
 
316 aa  231  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29940  homoserine kinase  54.41 
 
 
291 aa  229  7e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.197382 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2463  homoserine kinase  55.47 
 
 
310 aa  227  3e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635742  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2422  homoserine kinase  47.99 
 
 
316 aa  227  3e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4151  homoserine kinase  50 
 
 
321 aa  224  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.317014  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2097  homoserine kinase  52.59 
 
 
300 aa  218  7.999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000128102  normal  0.0746509 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0885  homoserine kinase  49.07 
 
 
310 aa  218  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1254  homoserine kinase  51.79 
 
 
328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0775555 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1650  Homoserine kinase  43.23 
 
 
336 aa  208  9e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0491324  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0320  homoserine kinase  46.79 
 
 
320 aa  208  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.234549 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0632  homoserine kinase  48.12 
 
 
310 aa  207  3e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.305614  decreased coverage  0.0010744 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1300  homoserine kinase  44.56 
 
 
304 aa  203  4e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6154  homoserine kinase  50.93 
 
 
295 aa  198  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1746  homoserine kinase  45.89 
 
 
300 aa  194  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0611668  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2621  homoserine kinase  46.04 
 
 
305 aa  191  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3647  homoserine kinase  48.3 
 
 
309 aa  190  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.529848  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4029  homoserine kinase  46.84 
 
 
314 aa  189  5e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116733 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1007  homoserine kinase  46.55 
 
 
317 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3936  homoserine kinase  46.55 
 
 
316 aa  186  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1166  homoserine kinase  41.91 
 
 
301 aa  186  7e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000188911  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2354  homoserine kinase  44.81 
 
 
324 aa  183  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000501713 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1074  homoserine kinase  45.76 
 
 
313 aa  171  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2478  homoserine kinase  36.36 
 
 
297 aa  171  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.979123  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1871  homoserine kinase  36.39 
 
 
305 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1608  Homoserine kinase  37.06 
 
 
370 aa  167  2e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1897  homoserine kinase  36.05 
 
 
305 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359865  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2115  homoserine kinase  37.45 
 
 
300 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.185248 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1960  homoserine kinase  37.83 
 
 
307 aa  166  4e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000160344  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1440  homoserine kinase  36.13 
 
 
306 aa  163  3e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.231357  normal  0.456587 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2309  homoserine kinase  36.49 
 
 
308 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5245  homoserine kinase  38.8 
 
 
304 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1581  homoserine kinase  35.58 
 
 
307 aa  160  4e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1305  homoserine kinase  41.35 
 
 
296 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1080  homoserine kinase  37.83 
 
 
304 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.129806 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1230  homoserine kinase  37.94 
 
 
355 aa  154  1e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000185797 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1018  homoserine kinase  37.28 
 
 
305 aa  153  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2794  homoserine kinase  36.74 
 
 
302 aa  152  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0354264  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2880  homoserine kinase  37.78 
 
 
303 aa  151  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0703126  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0910  homoserine kinase  38.2 
 
 
311 aa  150  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000332858 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46461  predicted protein  35.19 
 
 
426 aa  147  4.0000000000000006e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.5833  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0118  homoserine kinase  36.96 
 
 
303 aa  146  5e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1031  homoserine kinase  36.26 
 
 
315 aa  144  3e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1240  homoserine kinase  37.79 
 
 
314 aa  144  3e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000301538  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14830  homoserine kinase  39.86 
 
 
297 aa  142  6e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17524  normal  0.116843 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3124  homoserine kinase  42.59 
 
 
310 aa  141  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06211  homoserine kinase  34.23 
 
 
315 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0593  homoserine kinase  33.45 
 
 
304 aa  140  3e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1064  homoserine kinase  36.3 
 
 
303 aa  139  4.999999999999999e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0932  homoserine kinase  35.9 
 
 
315 aa  139  6e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.732555  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0595  homoserine kinase  34.56 
 
 
315 aa  139  8.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0031  homoserine kinase  34.53 
 
 
315 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1794  homoserine kinase  42.32 
 
 
284 aa  138  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.324471  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06601  homoserine kinase  34.02 
 
 
315 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0883  homoserine kinase  41.39 
 
 
307 aa  138  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000117754  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06511  homoserine kinase  34.53 
 
 
315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.893933  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2698  homoserine kinase  32.72 
 
 
300 aa  135  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0218075  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18581  homoserine kinase  35.16 
 
 
316 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.566516 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0674  homoserine kinase  33.11 
 
 
293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0444063  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1368  homoserine kinase  30.11 
 
 
297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_10263  predicted protein  35.82 
 
 
265 aa  133  5e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.111228  normal  0.879833 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06511  homoserine kinase  32.75 
 
 
302 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1281  homoserine kinase  31.25 
 
 
296 aa  130  3e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.045186  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0392  homoserine kinase  34.72 
 
 
281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0375  homoserine kinase  34.72 
 
 
281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1827  homoserine kinase  33.78 
 
 
297 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.115577  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1801  homoserine kinase  33.78 
 
 
297 aa  127  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0151771  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1784  homoserine kinase  33.56 
 
 
297 aa  127  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1970  homoserine kinase  33.78 
 
 
297 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.358252  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08010  homoserine kinase  31.23 
 
 
311 aa  127  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0100938  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2004  homoserine kinase  33.78 
 
 
297 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.268179999999999e-43 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2075  homoserine kinase  33.56 
 
 
297 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000541431  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2053  homoserine kinase  33.56 
 
 
297 aa  126  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0296035  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1835  homoserine kinase  34.04 
 
 
297 aa  126  7e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.439683  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2253  homoserine kinase  36.9 
 
 
317 aa  125  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.227732  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3355  homoserine kinase  33.9 
 
 
297 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000409306  hitchhiker  0.0000000000000103928 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0899  homoserine kinase  31.54 
 
 
306 aa  124  3e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.29792  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1318  homoserine kinase  35.4 
 
 
300 aa  123  4e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.607391  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0129  homoserine kinase  30.74 
 
 
292 aa  122  6e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0169  homoserine kinase  30.74 
 
 
292 aa  122  6e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00243862  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1023  homoserine kinase  39.48 
 
 
323 aa  122  7e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1972  homoserine kinase  33.78 
 
 
297 aa  122  8e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0856158  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0147  homoserine kinase  30.74 
 
 
292 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00399009  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2050  homoserine kinase  38.1 
 
 
300 aa  120  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.189135  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10551  homoserine kinase  34.8 
 
 
303 aa  120  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1495  homoserine kinase  30.42 
 
 
293 aa  120  3.9999999999999996e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.122475  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1498  homoserine kinase  34.52 
 
 
297 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121661  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1391  homoserine kinase  29.5 
 
 
304 aa  119  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00775199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>