262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1074 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1074  homoserine kinase  100 
 
 
313 aa  608  1e-173  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2115  homoserine kinase  48.99 
 
 
300 aa  277  1e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.185248 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1166  homoserine kinase  49.5 
 
 
301 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000188911  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2478  homoserine kinase  44.97 
 
 
297 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.979123  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2309  homoserine kinase  46.32 
 
 
308 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1581  homoserine kinase  44.32 
 
 
307 aa  238  1e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1960  homoserine kinase  42.09 
 
 
307 aa  236  4e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000160344  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1305  homoserine kinase  45.97 
 
 
296 aa  223  3e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5245  homoserine kinase  45.45 
 
 
304 aa  219  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1201  homoserine kinase  45.54 
 
 
336 aa  217  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.326603  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3124  homoserine kinase  53.99 
 
 
310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06601  homoserine kinase  40.4 
 
 
315 aa  213  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0932  homoserine kinase  42.37 
 
 
315 aa  213  3.9999999999999995e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.732555  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1031  homoserine kinase  42.37 
 
 
315 aa  213  3.9999999999999995e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1871  homoserine kinase  42.33 
 
 
305 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06211  homoserine kinase  41.69 
 
 
315 aa  212  5.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1440  homoserine kinase  43.86 
 
 
306 aa  212  7.999999999999999e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.231357  normal  0.456587 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1897  homoserine kinase  41.81 
 
 
305 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359865  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0595  homoserine kinase  40.68 
 
 
315 aa  209  7e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08010  homoserine kinase  40.56 
 
 
311 aa  207  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0100938  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18581  homoserine kinase  41.69 
 
 
316 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.566516 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06511  homoserine kinase  40 
 
 
302 aa  205  8e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1018  homoserine kinase  42.34 
 
 
305 aa  203  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1064  homoserine kinase  39.53 
 
 
303 aa  204  2e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1080  homoserine kinase  42 
 
 
304 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.129806 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1318  homoserine kinase  39.66 
 
 
300 aa  202  6e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.607391  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2794  homoserine kinase  44.96 
 
 
302 aa  201  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0354264  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06511  homoserine kinase  40.68 
 
 
315 aa  199  3e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.893933  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2880  homoserine kinase  41.69 
 
 
303 aa  199  5e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0703126  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0593  homoserine kinase  37.77 
 
 
304 aa  199  6e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0031  homoserine kinase  40 
 
 
315 aa  196  3e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1240  homoserine kinase  46.64 
 
 
314 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000301538  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0885  homoserine kinase  44.64 
 
 
310 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1007  homoserine kinase  47.74 
 
 
317 aa  195  8.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0118  homoserine kinase  44.81 
 
 
303 aa  194  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2422  homoserine kinase  43.96 
 
 
316 aa  193  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0320  homoserine kinase  43.82 
 
 
320 aa  192  9e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.234549 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2253  homoserine kinase  45.26 
 
 
317 aa  191  1e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.227732  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14830  homoserine kinase  46.64 
 
 
297 aa  191  2e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17524  normal  0.116843 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4029  homoserine kinase  46.79 
 
 
314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116733 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1057  homoserine kinase  47.58 
 
 
317 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175086  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10551  homoserine kinase  43.35 
 
 
303 aa  188  9e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1300  homoserine kinase  44.74 
 
 
304 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1650  Homoserine kinase  40.4 
 
 
336 aa  183  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0491324  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2463  homoserine kinase  50.56 
 
 
310 aa  181  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635742  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0883  homoserine kinase  44.59 
 
 
307 aa  180  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000117754  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3647  homoserine kinase  46.84 
 
 
309 aa  179  5.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.529848  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3936  homoserine kinase  46.52 
 
 
316 aa  177  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0910  homoserine kinase  38.69 
 
 
311 aa  177  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000332858 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0632  homoserine kinase  46.07 
 
 
310 aa  176  4e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.305614  decreased coverage  0.0010744 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1788  homoserine kinase  45.76 
 
 
317 aa  176  4e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.542876  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2050  homoserine kinase  41.37 
 
 
300 aa  175  7e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.189135  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19320  homoserine kinase  43.38 
 
 
304 aa  176  7e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1283  homoserine kinase  46.91 
 
 
311 aa  175  8e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.335201 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4151  homoserine kinase  46.15 
 
 
321 aa  175  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.317014  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0220  homoserine kinase  35.91 
 
 
292 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000123965  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46461  predicted protein  39.06 
 
 
426 aa  174  1.9999999999999998e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.5833  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_10263  predicted protein  42.54 
 
 
265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.111228  normal  0.879833 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1794  homoserine kinase  41.67 
 
 
284 aa  173  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.324471  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1232  homoserine kinase  44.07 
 
 
330 aa  172  9e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29940  homoserine kinase  43.56 
 
 
291 aa  168  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.197382 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16080  homoserine kinase  36.64 
 
 
293 aa  166  5e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.222088  hitchhiker  0.000000158758 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1281  homoserine kinase  41.06 
 
 
296 aa  163  4.0000000000000004e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.045186  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1746  homoserine kinase  45.45 
 
 
300 aa  162  6e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0611668  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09890  homoserine kinase  43.41 
 
 
315 aa  162  9e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0246  homoserine kinase  35 
 
 
294 aa  161  1e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00137655  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0129  homoserine kinase  34.98 
 
 
292 aa  160  2e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0674  homoserine kinase  34.87 
 
 
293 aa  160  2e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0444063  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0147  homoserine kinase  34.98 
 
 
292 aa  160  2e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00399009  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0169  homoserine kinase  34.98 
 
 
292 aa  160  2e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00243862  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2698  homoserine kinase  32.69 
 
 
300 aa  160  3e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0218075  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0596  homoserine kinase  33.55 
 
 
293 aa  159  4e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3355  homoserine kinase  38.37 
 
 
297 aa  158  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000409306  hitchhiker  0.0000000000000103928 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1835  homoserine kinase  37.6 
 
 
297 aa  156  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.439683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1784  homoserine kinase  37.21 
 
 
297 aa  155  6e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2075  homoserine kinase  37.21 
 
 
297 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000541431  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1903  homoserine kinase  43.17 
 
 
336 aa  154  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85224  homoserine kinase  33.33 
 
 
353 aa  155  1e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.481244  normal  0.37391 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1801  homoserine kinase  37.6 
 
 
297 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0151771  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1972  homoserine kinase  38.13 
 
 
297 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0856158  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2004  homoserine kinase  37.6 
 
 
297 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.268179999999999e-43 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0950  homoserine kinase  43.08 
 
 
290 aa  153  4e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.388606 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2053  homoserine kinase  36.82 
 
 
297 aa  153  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0296035  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1827  homoserine kinase  37.21 
 
 
297 aa  152  5e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.115577  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1970  homoserine kinase  37.21 
 
 
297 aa  152  5e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.358252  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1254  homoserine kinase  42.29 
 
 
328 aa  152  8e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0775555 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1023  homoserine kinase  43.97 
 
 
323 aa  152  8.999999999999999e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2300  homoserine kinase  41.67 
 
 
315 aa  151  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2720  homoserine kinase  36.54 
 
 
304 aa  150  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.46169  normal  0.699908 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1498  homoserine kinase  37.6 
 
 
297 aa  149  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121661  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0392  homoserine kinase  36.02 
 
 
281 aa  149  5e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6154  homoserine kinase  42.21 
 
 
295 aa  149  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1368  homoserine kinase  29.5 
 
 
297 aa  149  5e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0507  homoserine kinase  35.45 
 
 
286 aa  149  6e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0375  homoserine kinase  36.02 
 
 
281 aa  149  8e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0785  homoserine kinase  34.58 
 
 
292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08843  homoserine kinase (Eurofung)  33.52 
 
 
355 aa  147  3e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1479  homoserine kinase  36.81 
 
 
315 aa  146  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1119  homoserine kinase  34.35 
 
 
288 aa  145  6e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2354  homoserine kinase  41.54 
 
 
324 aa  145  8.000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000501713 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>