212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0885 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0885  homoserine kinase  100 
 
 
310 aa  608  1e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1650  Homoserine kinase  65.18 
 
 
336 aa  407  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0491324  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3936  homoserine kinase  63.84 
 
 
316 aa  317  2e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1201  homoserine kinase  57.05 
 
 
336 aa  304  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.326603  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1057  homoserine kinase  55.13 
 
 
317 aa  275  7e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175086  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2422  homoserine kinase  51.1 
 
 
316 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3647  homoserine kinase  58.72 
 
 
309 aa  265  5.999999999999999e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.529848  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4029  homoserine kinase  56.71 
 
 
314 aa  263  2e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116733 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0632  homoserine kinase  54.82 
 
 
310 aa  261  1e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.305614  decreased coverage  0.0010744 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0320  homoserine kinase  51.27 
 
 
320 aa  257  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.234549 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2463  homoserine kinase  59.11 
 
 
310 aa  255  7e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635742  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19320  homoserine kinase  56.72 
 
 
304 aa  253  3e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1300  homoserine kinase  54.24 
 
 
304 aa  244  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09890  homoserine kinase  50.96 
 
 
315 aa  243  3e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1788  homoserine kinase  46.45 
 
 
317 aa  242  7e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.542876  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4151  homoserine kinase  50.83 
 
 
321 aa  238  1e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.317014  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1746  homoserine kinase  53.38 
 
 
300 aa  235  6e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0611668  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1254  homoserine kinase  52.73 
 
 
328 aa  234  1.0000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0775555 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1007  homoserine kinase  52.73 
 
 
317 aa  232  7.000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2097  homoserine kinase  51.14 
 
 
300 aa  225  8e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000128102  normal  0.0746509 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1232  homoserine kinase  51.37 
 
 
330 aa  225  8e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1283  homoserine kinase  52.65 
 
 
311 aa  225  8e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.335201 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29940  homoserine kinase  48.84 
 
 
291 aa  215  9e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.197382 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2354  homoserine kinase  46.6 
 
 
324 aa  211  9e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000501713 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2621  homoserine kinase  46.13 
 
 
305 aa  209  5e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2300  homoserine kinase  49.47 
 
 
315 aa  207  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6154  homoserine kinase  52.77 
 
 
295 aa  206  4e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2115  homoserine kinase  38.54 
 
 
300 aa  202  5e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.185248 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1166  homoserine kinase  42.44 
 
 
301 aa  201  9e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000188911  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11323  homoserine kinase  48.18 
 
 
316 aa  200  3e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2309  homoserine kinase  37.18 
 
 
308 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0593  homoserine kinase  36.97 
 
 
304 aa  193  3e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3880  homoserine kinase  48.21 
 
 
314 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1903  homoserine kinase  49.07 
 
 
336 aa  189  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3894  homoserine kinase  47.81 
 
 
314 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3968  homoserine kinase  47.81 
 
 
314 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353705  normal  0.701993 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1960  homoserine kinase  35.26 
 
 
307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000160344  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1440  homoserine kinase  38.7 
 
 
306 aa  180  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.231357  normal  0.456587 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1581  homoserine kinase  33.55 
 
 
307 aa  181  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1074  homoserine kinase  44.64 
 
 
313 aa  178  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2478  homoserine kinase  37.77 
 
 
297 aa  176  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.979123  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1305  homoserine kinase  43.07 
 
 
296 aa  176  6e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08010  homoserine kinase  37.36 
 
 
311 aa  176  7e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0100938  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1608  Homoserine kinase  35.87 
 
 
370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4346  homoserine kinase  46.95 
 
 
314 aa  171  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0197752  normal  0.0812998 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1064  homoserine kinase  38.76 
 
 
303 aa  170  3e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1230  homoserine kinase  38.07 
 
 
355 aa  170  3e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000185797 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1871  homoserine kinase  36.54 
 
 
305 aa  168  9e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1240  homoserine kinase  38.85 
 
 
314 aa  167  2e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000301538  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1897  homoserine kinase  36.22 
 
 
305 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359865  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1018  homoserine kinase  35.23 
 
 
305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0118  homoserine kinase  41.5 
 
 
303 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0595  homoserine kinase  33.65 
 
 
315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06601  homoserine kinase  34.03 
 
 
315 aa  162  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0910  homoserine kinase  35.25 
 
 
311 aa  162  9e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000332858 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1031  homoserine kinase  36.18 
 
 
315 aa  160  2e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0674  homoserine kinase  32.44 
 
 
293 aa  160  3e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0444063  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06211  homoserine kinase  33.66 
 
 
315 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3124  homoserine kinase  44.24 
 
 
310 aa  160  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0031  homoserine kinase  34.19 
 
 
315 aa  159  5e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18581  homoserine kinase  36.52 
 
 
316 aa  159  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.566516 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46461  predicted protein  39.44 
 
 
426 aa  159  7e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.5833  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06511  homoserine kinase  34.52 
 
 
315 aa  159  8e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.893933  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0932  homoserine kinase  35.18 
 
 
315 aa  157  2e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.732555  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5245  homoserine kinase  40.34 
 
 
304 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2880  homoserine kinase  34.5 
 
 
303 aa  157  3e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0703126  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1080  homoserine kinase  31.83 
 
 
304 aa  155  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.129806 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06511  homoserine kinase  33.22 
 
 
302 aa  155  7e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1318  homoserine kinase  35.9 
 
 
300 aa  154  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.607391  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2794  homoserine kinase  38.02 
 
 
302 aa  152  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0354264  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14830  homoserine kinase  39.48 
 
 
297 aa  150  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17524  normal  0.116843 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1493  homoserine kinase  29.47 
 
 
294 aa  149  4e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00125886  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1794  homoserine kinase  40.73 
 
 
284 aa  148  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.324471  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1368  homoserine kinase  29.78 
 
 
297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_10263  predicted protein  39.93 
 
 
265 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.111228  normal  0.879833 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0246  homoserine kinase  30.13 
 
 
294 aa  145  8.000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00137655  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2253  homoserine kinase  42.18 
 
 
317 aa  144  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.227732  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0883  homoserine kinase  42.15 
 
 
307 aa  144  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000117754  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2698  homoserine kinase  33.33 
 
 
300 aa  143  4e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0218075  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2050  homoserine kinase  40.65 
 
 
300 aa  142  9e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.189135  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3723  homoserine kinase  45.41 
 
 
389 aa  140  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.422816  normal  0.66686 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1495  homoserine kinase  34.46 
 
 
293 aa  139  3.9999999999999997e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.122475  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16080  homoserine kinase  35.58 
 
 
293 aa  140  3.9999999999999997e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.222088  hitchhiker  0.000000158758 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1281  homoserine kinase  33.88 
 
 
296 aa  139  7e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.045186  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10551  homoserine kinase  34.71 
 
 
303 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0375  homoserine kinase  35.57 
 
 
281 aa  138  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0392  homoserine kinase  35.57 
 
 
281 aa  137  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1023  homoserine kinase  41.92 
 
 
323 aa  137  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1391  homoserine kinase  32.03 
 
 
304 aa  136  5e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00775199  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1418  homoserine kinase  32.03 
 
 
304 aa  136  5e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.011674  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0899  homoserine kinase  33.69 
 
 
306 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.29792  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1119  homoserine kinase  31.56 
 
 
288 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0129  homoserine kinase  28.81 
 
 
292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0169  homoserine kinase  28.81 
 
 
292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00243862  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0950  homoserine kinase  40.74 
 
 
290 aa  133  3.9999999999999996e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.388606 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0147  homoserine kinase  29.51 
 
 
292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00399009  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0220  homoserine kinase  30.4 
 
 
292 aa  130  3e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000123965  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1681  homoserine kinase  29.03 
 
 
292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0164309  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08843  homoserine kinase (Eurofung)  30.77 
 
 
355 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2894  homoserine kinase  34.62 
 
 
304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.710654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>