185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3723 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3723  homoserine kinase  100 
 
 		 389 aa  739    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.422816  normal  0.66686 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1007  homoserine kinase  63.11 
 
 		 317 aa  345  7e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1201  homoserine kinase  47.91 
 
 		 336 aa  251  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.326603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1650  Homoserine kinase  44.88 
 
 		 336 aa  239  8e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0491324  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0885  homoserine kinase  44.35 
 
 		 310 aa  238  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3647  homoserine kinase  45.61 
 
 		 309 aa  219  7.999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.529848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2422  homoserine kinase  40.76 
 
 		 316 aa  218  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4029  homoserine kinase  44.48 
 
 		 314 aa  216  5e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116733 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1057  homoserine kinase  43.32 
 
 		 317 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175086  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0320  homoserine kinase  41.3 
 
 		 320 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.234549 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4151  homoserine kinase  40.58 
 
 		 321 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.317014  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1746  homoserine kinase  44.35 
 
 		 300 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0611668  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3936  homoserine kinase  43.18 
 
 		 316 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29940  homoserine kinase  42.09 
 
 		 291 aa  199  5e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.197382 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1300  homoserine kinase  41.43 
 
 		 304 aa  195  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19320  homoserine kinase  42.06 
 
 		 304 aa  194  2e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0632  homoserine kinase  43.1 
 
 		 310 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.305614  decreased coverage  0.0010744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3880  homoserine kinase  43.19 
 
 		 314 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1283  homoserine kinase  40.85 
 
 		 311 aa  178  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.335201 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1788  homoserine kinase  37.06 
 
 		 317 aa  176  5e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.542876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2463  homoserine kinase  42.27 
 
 		 310 aa  175  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635742  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2300  homoserine kinase  40.86 
 
 		 315 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6154  homoserine kinase  41.85 
 
 		 295 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3894  homoserine kinase  42.48 
 
 		 314 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3968  homoserine kinase  42.48 
 
 		 314 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353705  normal  0.701993 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09890  homoserine kinase  39.13 
 
 		 315 aa  169  5e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11323  homoserine kinase  41 
 
 		 316 aa  168  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1166  homoserine kinase  33.23 
 
 		 301 aa  166  5e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000188911  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1960  homoserine kinase  32.42 
 
 		 307 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000160344  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2309  homoserine kinase  31.49 
 
 		 308 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2097  homoserine kinase  39.94 
 
 		 300 aa  162  9e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000128102  normal  0.0746509 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2115  homoserine kinase  35.19 
 
 		 300 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.185248 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1074  homoserine kinase  40.85 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1581  homoserine kinase  29.13 
 
 		 307 aa  156  5.0000000000000005e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1064  homoserine kinase  30.9 
 
 		 303 aa  156  7e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1305  homoserine kinase  34.66 
 
 		 296 aa  152  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0593  homoserine kinase  29.55 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_10263  predicted protein  33.54 
 
 		 265 aa  145  2e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.111228  normal  0.879833 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2478  homoserine kinase  33.52 
 
 		 297 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.979123  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1240  homoserine kinase  32.83 
 
 		 314 aa  139  6e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000301538  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46461  predicted protein  31.8 
 
 		 426 aa  133  5e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.5833  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1368  homoserine kinase  26.61 
 
 		 297 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1871  homoserine kinase  29.81 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5245  homoserine kinase  33.96 
 
 		 304 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1608  Homoserine kinase  33.17 
 
 		 370 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08010  homoserine kinase  29.38 
 
 		 311 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0100938  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0595  homoserine kinase  29.97 
 
 		 315 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2621  homoserine kinase  42.05 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1897  homoserine kinase  29.53 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06211  homoserine kinase  29.36 
 
 		 315 aa  125  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14830  homoserine kinase  34.54 
 
 		 297 aa  123  5e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17524  normal  0.116843 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0246  homoserine kinase  27.2 
 
 		 294 aa  123  6e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00137655  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1440  homoserine kinase  32.61 
 
 		 306 aa  122  7e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.231357  normal  0.456587 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06601  homoserine kinase  28.96 
 
 		 315 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1794  homoserine kinase  34.44 
 
 		 284 aa  122  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.324471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1318  homoserine kinase  31.13 
 
 		 300 aa  120  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.607391  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1495  homoserine kinase  29.32 
 
 		 293 aa  120  3.9999999999999996e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.122475  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1232  homoserine kinase  70.33 
 
 		 330 aa  120  4.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2698  homoserine kinase  27.5 
 
 		 300 aa  119  7e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0218075  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2720  homoserine kinase  31.3 
 
 		 304 aa  119  7.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.46169  normal  0.699908 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0596  homoserine kinase  26.14 
 
 		 293 aa  117  5e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2253  homoserine kinase  32.91 
 
 		 317 aa  116  7.999999999999999e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.227732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06511  homoserine kinase  28.21 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18581  homoserine kinase  29.66 
 
 		 316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.566516 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0118  homoserine kinase  36.51 
 
 		 303 aa  113  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2075  homoserine kinase  28.69 
 
 		 297 aa  113  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000541431  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0129  homoserine kinase  27.24 
 
 		 292 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0169  homoserine kinase  27.24 
 
 		 292 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00243862  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2794  homoserine kinase  31.23 
 
 		 302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0354264  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2053  homoserine kinase  28.13 
 
 		 297 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0296035  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1972  homoserine kinase  28.65 
 
 		 297 aa  110  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0856158  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0031  homoserine kinase  29.36 
 
 		 315 aa  110  5e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06511  homoserine kinase  29.66 
 
 		 315 aa  110  6e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.893933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1230  homoserine kinase  30.33 
 
 		 355 aa  108  1e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000185797 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2354  homoserine kinase  37.95 
 
 		 324 aa  108  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000501713 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1493  homoserine kinase  24.65 
 
 		 294 aa  108  2e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00125886  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0883  homoserine kinase  32.89 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000117754  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1835  homoserine kinase  28.25 
 
 		 297 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.439683  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0220  homoserine kinase  24.43 
 
 		 292 aa  107  4e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000123965  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0932  homoserine kinase  29.88 
 
 		 315 aa  106  6e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.732555  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0147  homoserine kinase  27.59 
 
 		 292 aa  106  6e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00399009  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1031  homoserine kinase  29.57 
 
 		 315 aa  106  9e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1074  homoserine kinase  31.69 
 
 		 287 aa  106  9e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000054772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0375  homoserine kinase  29.11 
 
 		 281 aa  105  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2004  homoserine kinase  28.41 
 
 		 297 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.268179999999999e-43 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1801  homoserine kinase  28.41 
 
 		 297 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0151771  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2880  homoserine kinase  29.01 
 
 		 303 aa  104  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0703126  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1827  homoserine kinase  27.93 
 
 		 297 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.115577  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1970  homoserine kinase  27.93 
 
 		 297 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.358252  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2050  homoserine kinase  33.04 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.189135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1080  homoserine kinase  25.27 
 
 		 304 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.129806 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1254  homoserine kinase  38.1 
 
 		 328 aa  103  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0775555 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1018  homoserine kinase  27.81 
 
 		 305 aa  103  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0507  homoserine kinase  30.31 
 
 		 286 aa  103  7e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1119  homoserine kinase  26.74 
 
 		 288 aa  102  9e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0392  homoserine kinase  28.8 
 
 		 281 aa  102  9e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1023  homoserine kinase  34.95 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1281  homoserine kinase  28.01 
 
 		 296 aa  102  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.045186  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3039  homoserine kinase  31.12 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1784  homoserine kinase  27.3 
 
 		 297 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>