202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1254 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1254  homoserine kinase  100 
 
 
328 aa  626  1e-178  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0775555 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2422  homoserine kinase  54.95 
 
 
316 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0885  homoserine kinase  53.05 
 
 
310 aa  249  3e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1057  homoserine kinase  51.51 
 
 
317 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175086  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19320  homoserine kinase  48.84 
 
 
304 aa  239  4e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1201  homoserine kinase  49.04 
 
 
336 aa  237  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.326603  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1788  homoserine kinase  50.35 
 
 
317 aa  234  2.0000000000000002e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.542876  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0320  homoserine kinase  47.02 
 
 
320 aa  230  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.234549 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2097  homoserine kinase  54.51 
 
 
300 aa  228  8e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000128102  normal  0.0746509 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4151  homoserine kinase  52.23 
 
 
321 aa  228  9e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.317014  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3647  homoserine kinase  52.98 
 
 
309 aa  227  3e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.529848  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3936  homoserine kinase  50.49 
 
 
316 aa  225  8e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4029  homoserine kinase  52.32 
 
 
314 aa  223  4e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116733 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2463  homoserine kinase  53.79 
 
 
310 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635742  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09890  homoserine kinase  54.21 
 
 
315 aa  217  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1300  homoserine kinase  49.27 
 
 
304 aa  209  5e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2300  homoserine kinase  45.77 
 
 
315 aa  209  6e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1650  Homoserine kinase  44.98 
 
 
336 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0491324  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1232  homoserine kinase  45.86 
 
 
330 aa  205  7e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29940  homoserine kinase  47.7 
 
 
291 aa  205  8e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.197382 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2621  homoserine kinase  46.56 
 
 
305 aa  204  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1903  homoserine kinase  51.43 
 
 
336 aa  202  8e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1746  homoserine kinase  52 
 
 
300 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0611668  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0632  homoserine kinase  48.23 
 
 
310 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.305614  decreased coverage  0.0010744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3880  homoserine kinase  45.16 
 
 
314 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2354  homoserine kinase  45.13 
 
 
324 aa  194  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000501713 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1283  homoserine kinase  47.8 
 
 
311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.335201 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3894  homoserine kinase  45.45 
 
 
314 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3968  homoserine kinase  45.45 
 
 
314 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353705  normal  0.701993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1007  homoserine kinase  48.74 
 
 
317 aa  188  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6154  homoserine kinase  44.98 
 
 
295 aa  183  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4346  homoserine kinase  45.76 
 
 
314 aa  182  6e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0197752  normal  0.0812998 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11323  homoserine kinase  44.07 
 
 
316 aa  178  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2478  homoserine kinase  39.65 
 
 
297 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.979123  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1608  Homoserine kinase  35.31 
 
 
370 aa  159  6e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2115  homoserine kinase  33.8 
 
 
300 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.185248 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2309  homoserine kinase  32.68 
 
 
308 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1166  homoserine kinase  38.13 
 
 
301 aa  150  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000188911  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0910  homoserine kinase  37.07 
 
 
311 aa  145  6e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000332858 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1074  homoserine kinase  42.29 
 
 
313 aa  142  5e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1031  homoserine kinase  35.79 
 
 
315 aa  139  3.9999999999999997e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1581  homoserine kinase  29.68 
 
 
307 aa  139  7.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1230  homoserine kinase  35.12 
 
 
355 aa  138  1e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000185797 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1240  homoserine kinase  37.46 
 
 
314 aa  138  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000301538  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1440  homoserine kinase  36.86 
 
 
306 aa  134  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.231357  normal  0.456587 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06601  homoserine kinase  31.91 
 
 
315 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18581  homoserine kinase  34.33 
 
 
316 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.566516 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06211  homoserine kinase  32.79 
 
 
315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0593  homoserine kinase  32.86 
 
 
304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0595  homoserine kinase  32.9 
 
 
315 aa  132  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1064  homoserine kinase  37.36 
 
 
303 aa  132  6.999999999999999e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0932  homoserine kinase  34.78 
 
 
315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.732555  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1960  homoserine kinase  33.46 
 
 
307 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000160344  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_10263  predicted protein  37.82 
 
 
265 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.111228  normal  0.879833 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0674  homoserine kinase  31.38 
 
 
293 aa  130  3e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0444063  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06511  homoserine kinase  32.44 
 
 
302 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0031  homoserine kinase  33.33 
 
 
315 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1318  homoserine kinase  34.72 
 
 
300 aa  129  5.0000000000000004e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.607391  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06511  homoserine kinase  33.33 
 
 
315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.893933  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08040  homoserine kinase  57.14 
 
 
162 aa  128  1.0000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14830  homoserine kinase  40.32 
 
 
297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17524  normal  0.116843 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5245  homoserine kinase  37.45 
 
 
304 aa  126  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1018  homoserine kinase  31.42 
 
 
305 aa  125  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08010  homoserine kinase  28.57 
 
 
311 aa  124  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0100938  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3124  homoserine kinase  40.93 
 
 
310 aa  123  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3355  homoserine kinase  33.44 
 
 
297 aa  123  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000409306  hitchhiker  0.0000000000000103928 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2880  homoserine kinase  33.1 
 
 
303 aa  123  5e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0703126  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1827  homoserine kinase  33.11 
 
 
297 aa  122  7e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.115577  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1784  homoserine kinase  33.11 
 
 
297 aa  122  7e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1970  homoserine kinase  33.11 
 
 
297 aa  122  7e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.358252  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2698  homoserine kinase  31.54 
 
 
300 aa  122  7e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0218075  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1801  homoserine kinase  33.11 
 
 
297 aa  122  8e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0151771  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2004  homoserine kinase  33.11 
 
 
297 aa  122  8e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.268179999999999e-43 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2053  homoserine kinase  33.11 
 
 
297 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0296035  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2075  homoserine kinase  32.79 
 
 
297 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000541431  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46461  predicted protein  34.77 
 
 
426 aa  121  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.5833  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1897  homoserine kinase  34.53 
 
 
305 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359865  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1871  homoserine kinase  34.53 
 
 
305 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0118  homoserine kinase  37.37 
 
 
303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1835  homoserine kinase  33.11 
 
 
297 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.439683  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0220  homoserine kinase  30.18 
 
 
292 aa  120  3e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000123965  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1305  homoserine kinase  35.36 
 
 
296 aa  120  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2253  homoserine kinase  35.08 
 
 
317 aa  120  3.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.227732  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85224  homoserine kinase  29.33 
 
 
353 aa  119  7e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.481244  normal  0.37391 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0129  homoserine kinase  28.86 
 
 
292 aa  119  7.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0169  homoserine kinase  28.86 
 
 
292 aa  119  7.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00243862  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0147  homoserine kinase  29.34 
 
 
292 aa  119  7.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00399009  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1368  homoserine kinase  27.27 
 
 
297 aa  119  7.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0246  homoserine kinase  28.87 
 
 
294 aa  117  3e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00137655  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1493  homoserine kinase  27.54 
 
 
294 aa  117  3e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00125886  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1495  homoserine kinase  30.39 
 
 
293 aa  117  3.9999999999999997e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.122475  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1972  homoserine kinase  33.11 
 
 
297 aa  116  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0856158  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1794  homoserine kinase  37.76 
 
 
284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.324471  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1681  homoserine kinase  27.42 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0164309  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0899  homoserine kinase  30.47 
 
 
306 aa  114  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.29792  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02930  homoserine kinase, putative  30.24 
 
 
357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.614766  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2794  homoserine kinase  32.84 
 
 
302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0354264  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1498  homoserine kinase  32.91 
 
 
297 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121661  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1479  homoserine kinase  33.02 
 
 
315 aa  109  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1391  homoserine kinase  29.63 
 
 
304 aa  109  8.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00775199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>