More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A0003 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B0003  homoserine kinase  99.68 
 
 		 309 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.119068  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0003  homoserine kinase  99.68 
 
 		 309 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.45853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0003  homoserine kinase  99.68 
 
 		 309 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.611229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0003  homoserine kinase  100 
 
 		 309 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0003  homoserine kinase  99.68 
 
 		 309 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00003  homoserine kinase  93.18 
 
 		 310 aa  597  1e-170  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.646398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3593  homoserine kinase  93.51 
 
 		 310 aa  599  1e-170  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3652  homoserine kinase  93.18 
 
 		 310 aa  597  1e-170  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00003  hypothetical protein  93.18 
 
 		 310 aa  597  1e-170  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.716854  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0002  homoserine kinase  93.18 
 
 		 310 aa  597  1e-170  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.475933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0002  homoserine kinase  93.18 
 
 		 310 aa  597  1e-170  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0003  homoserine kinase  93.18 
 
 		 310 aa  597  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0004  homoserine kinase  93.18 
 
 		 310 aa  597  1e-170  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0004  homoserine kinase  92.86 
 
 		 310 aa  596  1e-169  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0565  homoserine kinase  89 
 
 		 309 aa  579  1e-164  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0573  homoserine kinase  79.94 
 
 		 309 aa  526  1e-148  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3667  homoserine kinase  79.61 
 
 		 309 aa  521  1e-147  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.478541  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3862  homoserine kinase  79.29 
 
 		 309 aa  520  1e-147  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0723691  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0534  homoserine kinase  78.96 
 
 		 309 aa  520  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.883707  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0684  homoserine kinase  77.99 
 
 		 309 aa  516  1.0000000000000001e-145  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0440126  normal  0.0506936 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3475  homoserine kinase  76.7 
 
 		 309 aa  510  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0807  homoserine kinase  76.7 
 
 		 309 aa  510  1e-144  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.522624 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3603  homoserine kinase  76.7 
 
 		 309 aa  510  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.966452  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004456  homoserine kinase  69.33 
 
 		 323 aa  454  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00940  homoserine kinase  68.69 
 
 		 323 aa  451  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1942  homoserine kinase  69.33 
 
 		 318 aa  442  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.17619  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2555  homoserine kinase  67.09 
 
 		 318 aa  429  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1213  homoserine kinase  61.98 
 
 		 314 aa  409  1e-113  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.241016  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1276  homoserine kinase  58.15 
 
 		 318 aa  360  1e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0906  homoserine kinase  56.96 
 
 		 314 aa  341  9e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1176  homoserine kinase  54.25 
 
 		 312 aa  341  9e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2905  homoserine kinase  54.55 
 
 		 319 aa  340  1e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1080  homoserine kinase  56.17 
 
 		 316 aa  340  2e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.708816  normal  0.284936 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1271  homoserine kinase  53.9 
 
 		 311 aa  339  4e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0252184 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3579  homoserine kinase  52.4 
 
 		 331 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1305  homoserine kinase  53.94 
 
 		 320 aa  335  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1228  homoserine kinase  53.94 
 
 		 320 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0499672  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2734  homoserine kinase  53.94 
 
 		 320 aa  335  7e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1272  homoserine kinase  53.63 
 
 		 320 aa  333  2e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.140701  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1210  homoserine kinase  55.34 
 
 		 312 aa  333  2e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1139  homoserine kinase  55.34 
 
 		 312 aa  333  3e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4290  homoserine kinase  52.55 
 
 		 328 aa  332  4e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1140  homoserine kinase  55.34 
 
 		 312 aa  332  4e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0308198  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3414  homoserine kinase  55.34 
 
 		 312 aa  331  8e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3085  homoserine kinase  53.46 
 
 		 321 aa  331  8e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.479885  hitchhiker  0.00212807 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03327  homoserine kinase  52.26 
 
 		 315 aa  318  5e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1067  homoserine kinase  51.95 
 
 		 311 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2739  homoserine kinase  50.31 
 
 		 328 aa  317  2e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11354  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0074  homoserine kinase  34.3 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.281834 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1897  homoserine kinase  33.65 
 
 		 305 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2478  homoserine kinase  32.91 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.979123  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1871  homoserine kinase  33.23 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6218  homoserine kinase  34.71 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.559552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3151  homoserine kinase  34.41 
 
 		 309 aa  143  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1440  homoserine kinase  33.81 
 
 		 306 aa  142  5e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.231357  normal  0.456587 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1018  homoserine kinase  30.72 
 
 		 305 aa  139  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5245  homoserine kinase  34.01 
 
 		 304 aa  139  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1166  homoserine kinase  34.69 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000188911  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3803  homoserine kinase  34.38 
 
 		 311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2794  homoserine kinase  32.96 
 
 		 302 aa  134  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0354264  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2115  homoserine kinase  30.48 
 
 		 300 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.185248 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1080  homoserine kinase  31.23 
 
 		 304 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.129806 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0296  homoserine kinase  33.75 
 
 		 320 aa  129  8.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.193938 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1986  homoserine kinase  31.79 
 
 		 320 aa  122  7e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1318  homoserine kinase  30.57 
 
 		 300 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.607391  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2545  homoserine kinase  31.29 
 
 		 320 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0629954  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1031  homoserine kinase  33.09 
 
 		 315 aa  120  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2253  homoserine kinase  32.9 
 
 		 317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.227732  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0899  homoserine kinase  29.93 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.29792  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2880  homoserine kinase  30.94 
 
 		 303 aa  120  3.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0703126  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07415  homoserine kinase  29.87 
 
 		 308 aa  119  7.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2698  homoserine kinase  29.3 
 
 		 300 aa  119  7.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0218075  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1424  homoserine kinase  34.33 
 
 		 322 aa  119  9e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1357  homoserine kinase  34.33 
 
 		 322 aa  119  9e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14830  homoserine kinase  30.56 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17524  normal  0.116843 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0910  homoserine kinase  31.01 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000332858 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0261  homoserine kinase  32.55 
 
 		 320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.836867  normal  0.0420212 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0932  homoserine kinase  33.82 
 
 		 315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.732555  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1240  homoserine kinase  30.96 
 
 		 314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000301538  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2333  homoserine kinase  30.91 
 
 		 320 aa  117  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2302  homoserine kinase  34.93 
 
 		 293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.591143  normal  0.310319 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1305  homoserine kinase  31.99 
 
 		 296 aa  115  6e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1581  homoserine kinase  29.35 
 
 		 307 aa  115  6.9999999999999995e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1064  homoserine kinase  28.68 
 
 		 303 aa  115  8.999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06211  homoserine kinase  30.03 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2706  homoserine kinase  31.56 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.690361  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2309  homoserine kinase  27.94 
 
 		 308 aa  114  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1251  homoserine kinase  33.7 
 
 		 296 aa  114  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.823907  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0041  homoserine kinase  27.68 
 
 		 307 aa  112  5e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06511  homoserine kinase  32.51 
 
 		 315 aa  112  6e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.893933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0595  homoserine kinase  29.79 
 
 		 315 aa  112  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0031  homoserine kinase  32.16 
 
 		 315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1262  homoserine kinase  32.37 
 
 		 325 aa  110  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.467921  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2574  homoserine kinase  30.74 
 
 		 306 aa  110  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2894  homoserine kinase  28.77 
 
 		 304 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.710654  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3310  homoserine kinase  33.33 
 
 		 293 aa  109  7.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06601  homoserine kinase  29.45 
 
 		 315 aa  109  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0139  homoserine kinase  31.21 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1644  homoserine kinase  31.39 
 
 		 291 aa  108  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06511  homoserine kinase  29.51 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>