More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1213 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1213  homoserine kinase  100 
 
 		 314 aa  647    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.241016  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004456  homoserine kinase  62.66 
 
 		 323 aa  427  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00940  homoserine kinase  62.21 
 
 		 323 aa  422  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3667  homoserine kinase  61.98 
 
 		 309 aa  415  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.478541  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0684  homoserine kinase  61.98 
 
 		 309 aa  414  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0440126  normal  0.0506936 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3862  homoserine kinase  61.98 
 
 		 309 aa  415  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0723691  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1942  homoserine kinase  62.99 
 
 		 318 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.17619  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3603  homoserine kinase  61.98 
 
 		 309 aa  412  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.966452  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0807  homoserine kinase  61.98 
 
 		 309 aa  412  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.522624 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0534  homoserine kinase  61.34 
 
 		 309 aa  414  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.883707  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2555  homoserine kinase  61.69 
 
 		 318 aa  414  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3475  homoserine kinase  61.98 
 
 		 309 aa  412  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00003  homoserine kinase  62.3 
 
 		 310 aa  408  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.646398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3593  homoserine kinase  62.3 
 
 		 310 aa  409  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0002  homoserine kinase  62.3 
 
 		 310 aa  408  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.475933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0003  homoserine kinase  62.3 
 
 		 310 aa  408  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0003  homoserine kinase  61.98 
 
 		 309 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.119068  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0004  homoserine kinase  62.3 
 
 		 310 aa  409  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0003  homoserine kinase  61.98 
 
 		 309 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.611229  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00003  hypothetical protein  62.3 
 
 		 310 aa  408  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.716854  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0573  homoserine kinase  61.41 
 
 		 309 aa  409  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3652  homoserine kinase  62.3 
 
 		 310 aa  408  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0003  homoserine kinase  61.98 
 
 		 309 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.45853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0003  homoserine kinase  61.98 
 
 		 309 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0002  homoserine kinase  62.3 
 
 		 310 aa  408  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0003  homoserine kinase  61.98 
 
 		 309 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0004  homoserine kinase  62.3 
 
 		 310 aa  408  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0565  homoserine kinase  61.98 
 
 		 309 aa  405  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1276  homoserine kinase  56.31 
 
 		 318 aa  344  1e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3579  homoserine kinase  50.63 
 
 		 331 aa  329  3e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0906  homoserine kinase  52.9 
 
 		 314 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1176  homoserine kinase  51.77 
 
 		 312 aa  326  3e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2905  homoserine kinase  50.96 
 
 		 319 aa  326  3e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1272  homoserine kinase  51.75 
 
 		 320 aa  325  5e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.140701  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1210  homoserine kinase  51.61 
 
 		 312 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1271  homoserine kinase  50 
 
 		 311 aa  324  1e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0252184 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1067  homoserine kinase  52.58 
 
 		 311 aa  324  1e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3414  homoserine kinase  51.94 
 
 		 312 aa  323  2e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1305  homoserine kinase  51.43 
 
 		 320 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4290  homoserine kinase  50.78 
 
 		 328 aa  322  4e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1228  homoserine kinase  51.11 
 
 		 320 aa  322  6e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0499672  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1139  homoserine kinase  50.97 
 
 		 312 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1140  homoserine kinase  50.65 
 
 		 312 aa  319  5e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0308198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2734  homoserine kinase  50.79 
 
 		 320 aa  318  7e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1080  homoserine kinase  50 
 
 		 316 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.708816  normal  0.284936 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3085  homoserine kinase  50.32 
 
 		 321 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.479885  hitchhiker  0.00212807 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2739  homoserine kinase  48.14 
 
 		 328 aa  310  2e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11354  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03327  homoserine kinase  52.6 
 
 		 315 aa  310  2e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0074  homoserine kinase  34.6 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.281834 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6218  homoserine kinase  35.45 
 
 		 311 aa  153  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.559552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1440  homoserine kinase  33.8 
 
 		 306 aa  150  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.231357  normal  0.456587 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1871  homoserine kinase  31.11 
 
 		 305 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1897  homoserine kinase  31.11 
 
 		 305 aa  139  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3151  homoserine kinase  33.02 
 
 		 309 aa  138  8.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2794  homoserine kinase  31.73 
 
 		 302 aa  135  8e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0354264  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2478  homoserine kinase  33.09 
 
 		 297 aa  133  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.979123  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2698  homoserine kinase  30.55 
 
 		 300 aa  134  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0218075  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1581  homoserine kinase  30.25 
 
 		 307 aa  131  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0261  homoserine kinase  33.54 
 
 		 320 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.836867  normal  0.0420212 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1018  homoserine kinase  29.69 
 
 		 305 aa  129  6e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2545  homoserine kinase  31.19 
 
 		 320 aa  127  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0629954  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1986  homoserine kinase  32.82 
 
 		 320 aa  125  8.000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1166  homoserine kinase  33.45 
 
 		 301 aa  125  9e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000188911  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2115  homoserine kinase  32.01 
 
 		 300 aa  125  9e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.185248 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0910  homoserine kinase  29 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000332858 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07415  homoserine kinase  33.68 
 
 		 308 aa  125  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2880  homoserine kinase  30.17 
 
 		 303 aa  125  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0703126  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0899  homoserine kinase  30.14 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.29792  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5245  homoserine kinase  33.57 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1262  homoserine kinase  32.91 
 
 		 325 aa  123  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.467921  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0296  homoserine kinase  32.26 
 
 		 320 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.193938 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0139  homoserine kinase  34.07 
 
 		 320 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1240  homoserine kinase  31.48 
 
 		 314 aa  120  3e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000301538  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3803  homoserine kinase  31.96 
 
 		 311 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2253  homoserine kinase  31.16 
 
 		 317 aa  119  7e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.227732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06211  homoserine kinase  31.43 
 
 		 315 aa  119  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1305  homoserine kinase  33.57 
 
 		 296 aa  118  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1080  homoserine kinase  30.47 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.129806 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2706  homoserine kinase  32.81 
 
 		 320 aa  117  3e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.690361  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0932  homoserine kinase  32.53 
 
 		 315 aa  117  3.9999999999999997e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.732555  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06511  homoserine kinase  32.06 
 
 		 315 aa  116  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.893933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0031  homoserine kinase  32.01 
 
 		 315 aa  116  5e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0595  homoserine kinase  31.32 
 
 		 315 aa  116  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1064  homoserine kinase  28.57 
 
 		 303 aa  116  5e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1031  homoserine kinase  32.51 
 
 		 315 aa  116  6e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2333  homoserine kinase  30.91 
 
 		 320 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06511  homoserine kinase  31.87 
 
 		 302 aa  115  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1368  homoserine kinase  27.81 
 
 		 297 aa  115  7.999999999999999e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06601  homoserine kinase  31.16 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1318  homoserine kinase  32.01 
 
 		 300 aa  114  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.607391  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18581  homoserine kinase  30.96 
 
 		 316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.566516 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10551  homoserine kinase  33.21 
 
 		 303 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1357  homoserine kinase  30.8 
 
 		 322 aa  109  7.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1424  homoserine kinase  30.8 
 
 		 322 aa  109  7.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0883  homoserine kinase  29.21 
 
 		 307 aa  108  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000117754  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1281  homoserine kinase  25.48 
 
 		 296 aa  108  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.045186  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0833  homoserine kinase  31.69 
 
 		 312 aa  106  5e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3355  homoserine kinase  28.62 
 
 		 297 aa  105  9e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000409306  hitchhiker  0.0000000000000103928 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08010  homoserine kinase  29.02 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0100938  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1972  homoserine kinase  28.83 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0856158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>