95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0147 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0147  GHMP kinase  100 
 
 		 325 aa  665    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0206  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase, putative  89.85 
 
 		 325 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0788  GHMP kinase  57.8 
 
 		 328 aa  329  5.0000000000000004e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4245  GHMP kinase  48.46 
 
 		 328 aa  293  4e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.469148 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5597  GHMP kinase  45.43 
 
 		 326 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0617  GHMP kinase  40.37 
 
 		 333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.170003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3977  GHMP kinase  47.09 
 
 		 327 aa  241  9e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5465  GHMP kinase  45.06 
 
 		 326 aa  236  3e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4922  GHMP kinase  43.03 
 
 		 359 aa  226  5.0000000000000005e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.272679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1662  GHMP kinase  37.5 
 
 		 326 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.501068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1635  GHMP kinase  37.5 
 
 		 326 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0793  GHMP kinase  40.72 
 
 		 331 aa  199  5e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1227  GHMP kinase  38.18 
 
 		 333 aa  189  5e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4217  GHMP kinase  40.83 
 
 		 347 aa  178  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0447  GHMP kinase  40.24 
 
 		 347 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0153  GHMP kinase  39.7 
 
 		 347 aa  177  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3115  GHMP kinase  34.6 
 
 		 339 aa  147  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1742  GHMP kinase  34.27 
 
 		 343 aa  146  6e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.2795 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0720  GHMP kinase  34.98 
 
 		 341 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0236  GHMP kinase  32.4 
 
 		 350 aa  139  7e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3292  WcbL  31.31 
 
 		 346 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0532  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  31.31 
 
 		 346 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22033  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2296  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  31.31 
 
 		 346 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1068  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  31.31 
 
 		 346 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2174  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  31.31 
 
 		 346 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3278  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  31.31 
 
 		 346 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3243  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  31.31 
 
 		 346 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.455647  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1610  capsular biosynthesis sugar kinase, putative  31.83 
 
 		 339 aa  136  6.0000000000000005e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.594755  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1424  capsular biosynthesis sugar kinase, putative  31.25 
 
 		 339 aa  134  3e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.878412  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1759  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  31.83 
 
 		 339 aa  134  3e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.44471  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0374  GHMP kinase  34.08 
 
 		 343 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.638274  normal  0.807327 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10116  D-alpha-D-heptose-7-phosphate kinase hddA  32.59 
 
 		 386 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3600  GHMP kinase  33.84 
 
 		 349 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1336  hypothetical protein  28.66 
 
 		 327 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.296421  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2647  GHMP kinase  31.32 
 
 		 293 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3581  GHMP kinase  33.76 
 
 		 345 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1374  GHMP kinase  32.48 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3668  GHMP kinase  31.82 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2431  GHMP kinase  23.45 
 
 		 343 aa  87  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.696498  normal  0.378909 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3592  GHMP kinase  27.08 
 
 		 354 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.437274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0952  GHMP kinase  26.52 
 
 		 354 aa  76.3  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.70731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0891  mevalonate kinase  26.23 
 
 		 322 aa  63.2  0.000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0316  GHMP kinase  25.94 
 
 		 359 aa  62.8  0.000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0681  mevalonate kinase  24.05 
 
 		 290 aa  62  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0439  mevalonate kinase  25.42 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2604  mevalonate kinase  27.13 
 
 		 327 aa  61.6  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.395275  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  23.99 
 
 		 403 aa  60.1  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1114  GHMP kinase  24.9 
 
 		 382 aa  59.3  0.00000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0776  galactokinase  26.53 
 
 		 355 aa  57  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  26.09 
 
 		 372 aa  56.2  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1233  galactokinase  26.6 
 
 		 395 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000254056 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2002  mevalonate kinase  32.38 
 
 		 356 aa  53.9  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.360358  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1829  mevalonate kinase  23.1 
 
 		 338 aa  53.1  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0579  GHMP kinase  23.6 
 
 		 361 aa  53.1  0.000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000495739  decreased coverage  0.000433765 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4315  mevalonate kinase  25.69 
 
 		 313 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  23.46 
 
 		 380 aa  50.8  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1161  galactokinase  26.06 
 
 		 401 aa  49.3  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.415843  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1677  galactokinase  23.65 
 
 		 400 aa  48.9  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114591 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1835  mevalonate kinase  27.11 
 
 		 310 aa  48.9  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.782527 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2857  galactokinase  28.07 
 
 		 383 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2395  mevalonate kinase  24.39 
 
 		 303 aa  47.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000672574  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  27.38 
 
 		 391 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2945  galactokinase  28.07 
 
 		 383 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1411  galactokinase  28.07 
 
 		 383 aa  48.5  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1201  Galactokinase  25.95 
 
 		 410 aa  47.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3018  galactokinase  24.76 
 
 		 361 aa  47  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00232  galactokinase  23.78 
 
 		 379 aa  47  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44406  predicted protein  27.63 
 
 		 1782 aa  47.4  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0950443  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1100  mevalonate kinase  25.45 
 
 		 306 aa  46.2  0.0007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.979552  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1385  mevalonate kinase  23.32 
 
 		 310 aa  46.2  0.0007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1736  mevalonate kinase  24.77 
 
 		 316 aa  46.2  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0476  mevalonate kinase  27.23 
 
 		 321 aa  46.2  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0657  galactokinase  22.69 
 
 		 387 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  23.37 
 
 		 389 aa  45.4  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1097  galactokinase  25 
 
 		 385 aa  45.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0010459  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1710  GHMP kinase  22.86 
 
 		 350 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  27.27 
 
 		 414 aa  45.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2135  mevalonate kinase  24.11 
 
 		 314 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1000  GHMP kinase domain protein  25.21 
 
 		 370 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00600942  normal  0.518194 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  23.11 
 
 		 349 aa  44.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210895 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  24.17 
 
 		 385 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1464  galactokinase  23.88 
 
 		 394 aa  44.3  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10348  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0819  Galactokinase  26.37 
 
 		 403 aa  43.9  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.847114  normal  0.0773074 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0454  mevalonate kinase  25.12 
 
 		 310 aa  43.5  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1628  galactokinase  24.04 
 
 		 350 aa  43.5  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2890  mevalonate kinase  24.73 
 
 		 289 aa  43.5  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00676748  normal  0.719721 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0892  galactokinase  21.6 
 
 		 391 aa  43.5  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0958973 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1562  galactokinase  24.04 
 
 		 350 aa  43.5  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4056  galactokinase  26.15 
 
 		 403 aa  43.1  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.37616  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2376  mevalonate kinase  25.78 
 
 		 289 aa  43.1  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0415  galactokinase  22.42 
 
 		 355 aa  43.1  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2213  mevalonate kinase  34.92 
 
 		 289 aa  42.7  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0969  galactokinase  25.52 
 
 		 392 aa  42.7  0.008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.003784  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1421  mevalonate kinase  34.72 
 
 		 301 aa  42.7  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.238571  hitchhiker  0.00767711 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1466  galactokinase  25.96 
 
 		 388 aa  42.4  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>