114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0153 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0153  GHMP kinase  100 
 
 
347 aa  718    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0447  GHMP kinase  40.41 
 
 
347 aa  218  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4217  GHMP kinase  39.64 
 
 
347 aa  212  9e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5597  GHMP kinase  40.61 
 
 
326 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0788  GHMP kinase  39.52 
 
 
328 aa  199  5e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4245  GHMP kinase  38.81 
 
 
328 aa  194  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.469148 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3977  GHMP kinase  38.62 
 
 
327 aa  186  4e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0617  GHMP kinase  35.67 
 
 
333 aa  184  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.170003  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0147  GHMP kinase  39.7 
 
 
325 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0793  GHMP kinase  38.44 
 
 
331 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0206  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase, putative  39.7 
 
 
325 aa  182  6e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0720  GHMP kinase  34.53 
 
 
341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3668  GHMP kinase  36.12 
 
 
336 aa  173  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5465  GHMP kinase  37.5 
 
 
326 aa  172  7.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3115  GHMP kinase  32.73 
 
 
339 aa  169  5e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0236  GHMP kinase  35.84 
 
 
350 aa  169  6e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1635  GHMP kinase  36.19 
 
 
326 aa  169  9e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1662  GHMP kinase  36.19 
 
 
326 aa  169  9e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.501068  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2296  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  35.14 
 
 
346 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3292  WcbL  35.14 
 
 
346 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0532  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  35.14 
 
 
346 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22033  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1068  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  35.14 
 
 
346 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3243  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  35.14 
 
 
346 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.455647  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3278  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  35.14 
 
 
346 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2174  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  35.14 
 
 
346 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4922  GHMP kinase  34.11 
 
 
359 aa  160  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.272679  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1742  GHMP kinase  34.15 
 
 
343 aa  160  3e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.2795 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1610  capsular biosynthesis sugar kinase, putative  32.24 
 
 
339 aa  152  5.9999999999999996e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.594755  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1374  GHMP kinase  34.66 
 
 
337 aa  152  8e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1424  capsular biosynthesis sugar kinase, putative  32.24 
 
 
339 aa  150  2e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.878412  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3581  GHMP kinase  34.46 
 
 
345 aa  150  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0374  GHMP kinase  34.95 
 
 
343 aa  149  7e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.638274  normal  0.807327 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1759  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  32.24 
 
 
339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.44471  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1227  GHMP kinase  27.95 
 
 
333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464209  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10116  D-alpha-D-heptose-7-phosphate kinase hddA  34.91 
 
 
386 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3600  GHMP kinase  31.07 
 
 
349 aa  109  6e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2431  GHMP kinase  23.51 
 
 
343 aa  83.2  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.696498  normal  0.378909 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1336  hypothetical protein  27.18 
 
 
327 aa  82  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.296421  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2647  GHMP kinase  26.22 
 
 
293 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3592  GHMP kinase  27.09 
 
 
354 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.437274  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0952  GHMP kinase  29.27 
 
 
354 aa  73.9  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.70731  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0776  galactokinase  26.95 
 
 
355 aa  70.9  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0316  GHMP kinase  25.78 
 
 
359 aa  69.7  0.00000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  24.78 
 
 
380 aa  67.8  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0681  mevalonate kinase  24.07 
 
 
290 aa  67.4  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0454  mevalonate kinase  26.13 
 
 
310 aa  64.3  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  26.03 
 
 
349 aa  63.9  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1114  GHMP kinase  27.03 
 
 
382 aa  62  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0579  GHMP kinase  26.67 
 
 
361 aa  60.8  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000495739  decreased coverage  0.000433765 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2604  mevalonate kinase  25 
 
 
327 aa  61.2  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.395275  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0467  mevalonate kinase  27.88 
 
 
314 aa  60.8  0.00000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.250256  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1562  galactokinase  24.85 
 
 
350 aa  59.7  0.00000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1628  galactokinase  24.85 
 
 
350 aa  59.7  0.00000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  24.92 
 
 
369 aa  59.3  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  25.22 
 
 
359 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10631  galactokinase  24.59 
 
 
363 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00193784  normal  0.94952 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  21.61 
 
 
403 aa  57.4  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2376  mevalonate kinase  24.79 
 
 
289 aa  55.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0439  mevalonate kinase  24.52 
 
 
328 aa  55.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0532  galactokinase  26.47 
 
 
351 aa  54.7  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.560664  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0891  mevalonate kinase  24.48 
 
 
322 aa  52.4  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7279  galactokinase  24.42 
 
 
418 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0577  galactokinase  28.4 
 
 
384 aa  50.8  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1201  Galactokinase  29.79 
 
 
410 aa  50.8  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1385  mevalonate kinase  29.27 
 
 
310 aa  50.1  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2213  mevalonate kinase  23.6 
 
 
289 aa  50.1  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0414  galactokinase  25.19 
 
 
381 aa  49.7  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  24.4 
 
 
372 aa  49.7  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1736  mevalonate kinase  24.68 
 
 
316 aa  49.3  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  24.37 
 
 
385 aa  49.3  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0892  galactokinase  23.31 
 
 
391 aa  49.3  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0958973 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2002  mevalonate kinase  24.82 
 
 
356 aa  48.9  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.360358  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0969  galactokinase  27.59 
 
 
392 aa  48.9  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.003784  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1829  mevalonate kinase  25.12 
 
 
338 aa  49.3  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2135  mevalonate kinase  25 
 
 
314 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1233  galactokinase  28.64 
 
 
395 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000254056 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  21.59 
 
 
383 aa  48.5  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1464  galactokinase  25.77 
 
 
394 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10348  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4020  galactokinase  24.78 
 
 
388 aa  47.8  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000198069 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1653  mevalonate kinase  25.51 
 
 
314 aa  47.8  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1161  galactokinase  26.11 
 
 
401 aa  47.4  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.415843  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1794  homoserine kinase  24.68 
 
 
284 aa  47  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.324471  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  23.95 
 
 
391 aa  46.6  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1710  GHMP kinase  24.31 
 
 
350 aa  46.6  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3238  galactokinase  22.99 
 
 
397 aa  46.6  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.217049  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2890  mevalonate kinase  23.12 
 
 
289 aa  46.2  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00676748  normal  0.719721 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2152  galactokinase  25.91 
 
 
358 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0997  galactokinase  24.9 
 
 
362 aa  46.2  0.0009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00864415  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1701  galactokinase  25.31 
 
 
398 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1100  mevalonate kinase  24.89 
 
 
306 aa  45.8  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.979552  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1677  galactokinase  22.54 
 
 
400 aa  45.4  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114591 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  24.15 
 
 
389 aa  45.4  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40817  predicted protein  23.48 
 
 
382 aa  45.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1602  mevalonate kinase  26.54 
 
 
316 aa  44.7  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0123084  normal  0.126865 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0415  galactokinase  37.14 
 
 
355 aa  44.7  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  25.32 
 
 
349 aa  45.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.210895 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4110  galactokinase  22.74 
 
 
356 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3018  galactokinase  23.36 
 
 
361 aa  45.1  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3653  galactokinase  23.58 
 
 
434 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2481  galactokinase  23.42 
 
 
348 aa  43.9  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.883324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>