81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5597 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5597  GHMP kinase  100 
 
 
326 aa  671    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0788  GHMP kinase  47.71 
 
 
328 aa  289  4e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0147  GHMP kinase  45.43 
 
 
325 aa  281  9e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0206  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase, putative  45.85 
 
 
325 aa  280  3e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4245  GHMP kinase  45.54 
 
 
328 aa  277  2e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.469148 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0617  GHMP kinase  38.96 
 
 
333 aa  241  1e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.170003  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0793  GHMP kinase  41.9 
 
 
331 aa  229  7e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3977  GHMP kinase  42.64 
 
 
327 aa  223  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1662  GHMP kinase  38.91 
 
 
326 aa  222  6e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.501068  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1635  GHMP kinase  38.91 
 
 
326 aa  222  6e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5465  GHMP kinase  42.11 
 
 
326 aa  219  6e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4922  GHMP kinase  39.36 
 
 
359 aa  212  4.9999999999999996e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.272679  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0153  GHMP kinase  40.61 
 
 
347 aa  209  6e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0447  GHMP kinase  40.53 
 
 
347 aa  186  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4217  GHMP kinase  41.67 
 
 
347 aa  181  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1227  GHMP kinase  32.33 
 
 
333 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464209  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3115  GHMP kinase  33.44 
 
 
339 aa  157  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0236  GHMP kinase  35.65 
 
 
350 aa  150  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0720  GHMP kinase  33.72 
 
 
341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2174  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  31.08 
 
 
346 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3278  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  31.08 
 
 
346 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3243  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  31.08 
 
 
346 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.455647  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1068  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  31.08 
 
 
346 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2296  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  31.08 
 
 
346 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0532  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  31.08 
 
 
346 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22033  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3292  WcbL  31.08 
 
 
346 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1742  GHMP kinase  30.75 
 
 
343 aa  142  9.999999999999999e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.2795 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10116  D-alpha-D-heptose-7-phosphate kinase hddA  33.12 
 
 
386 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0374  GHMP kinase  31.86 
 
 
343 aa  130  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.638274  normal  0.807327 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1610  capsular biosynthesis sugar kinase, putative  28.35 
 
 
339 aa  120  3e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.594755  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1374  GHMP kinase  33.12 
 
 
337 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1759  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  28.04 
 
 
339 aa  116  3.9999999999999997e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.44471  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1424  capsular biosynthesis sugar kinase, putative  27.44 
 
 
339 aa  116  5e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.878412  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3581  GHMP kinase  34.06 
 
 
345 aa  115  8.999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3600  GHMP kinase  32.11 
 
 
349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3668  GHMP kinase  31.29 
 
 
336 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3592  GHMP kinase  26.07 
 
 
354 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.437274  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1336  hypothetical protein  26.37 
 
 
327 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.296421  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0952  GHMP kinase  27.69 
 
 
354 aa  100  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.70731  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2647  GHMP kinase  29.41 
 
 
293 aa  94  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2431  GHMP kinase  25.23 
 
 
343 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.696498  normal  0.378909 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0439  mevalonate kinase  28.37 
 
 
328 aa  63.9  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2604  mevalonate kinase  25.64 
 
 
327 aa  64.3  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.395275  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0681  mevalonate kinase  26.12 
 
 
290 aa  59.3  0.00000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1710  GHMP kinase  25.89 
 
 
350 aa  59.3  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2135  mevalonate kinase  24.59 
 
 
314 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0316  GHMP kinase  25.85 
 
 
359 aa  55.5  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0454  mevalonate kinase  21.95 
 
 
310 aa  54.7  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  26.21 
 
 
349 aa  53.5  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4315  mevalonate kinase  22.32 
 
 
313 aa  53.5  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  25.3 
 
 
389 aa  51.2  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2395  mevalonate kinase  24.08 
 
 
303 aa  51.2  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000672574  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  23.14 
 
 
403 aa  50.4  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1100  mevalonate kinase  24.44 
 
 
306 aa  50.4  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.979552  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1829  mevalonate kinase  26.61 
 
 
338 aa  50.4  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2002  mevalonate kinase  30.65 
 
 
356 aa  49.7  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.360358  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  22.19 
 
 
383 aa  48.9  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2376  mevalonate kinase  25.55 
 
 
289 aa  48.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0579  GHMP kinase  22.89 
 
 
361 aa  48.5  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000495739  decreased coverage  0.000433765 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2541  mevalonate kinase  27.78 
 
 
328 aa  47.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1835  mevalonate kinase  25.34 
 
 
310 aa  48.1  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.782527 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0819  Galactokinase  26.67 
 
 
403 aa  48.1  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.847114  normal  0.0773074 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  25.95 
 
 
414 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0891  mevalonate kinase  27.69 
 
 
322 aa  47.8  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1114  GHMP kinase  21.04 
 
 
382 aa  47.4  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  23.69 
 
 
387 aa  47  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1033  mevalonate kinase  22.69 
 
 
322 aa  46.6  0.0006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  22.93 
 
 
405 aa  46.6  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  24.6 
 
 
359 aa  46.2  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0721  mevalonate kinase  23.18 
 
 
313 aa  45.8  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00059401  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0620  phosphomevalonate kinase  23.18 
 
 
313 aa  45.8  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.373049  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1516  galactokinase  22.58 
 
 
385 aa  44.7  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0476  mevalonate kinase  25.52 
 
 
321 aa  45.1  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1201  Galactokinase  25.25 
 
 
410 aa  43.5  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1464  galactokinase  24.81 
 
 
394 aa  43.5  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10348  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31076  predicted protein  48.89 
 
 
488 aa  43.1  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0997  galactokinase  27.41 
 
 
362 aa  43.1  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00864415  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0776  galactokinase  25.62 
 
 
355 aa  42.7  0.008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14830  homoserine kinase  25.1 
 
 
297 aa  42.7  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17524  normal  0.116843 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2213  mevalonate kinase  41.82 
 
 
289 aa  42.7  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1000  GHMP kinase domain protein  26.91 
 
 
370 aa  42.4  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00600942  normal  0.518194 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>