97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0617 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0617  GHMP kinase  100 
 
 
333 aa  689    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.170003  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0793  GHMP kinase  51.83 
 
 
331 aa  329  4e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4922  GHMP kinase  46.47 
 
 
359 aa  280  3e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.272679  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1662  GHMP kinase  44.92 
 
 
326 aa  265  8e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.501068  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1635  GHMP kinase  44.92 
 
 
326 aa  265  8e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1227  GHMP kinase  41.16 
 
 
333 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464209  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0206  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase, putative  39.88 
 
 
325 aa  218  1e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0788  GHMP kinase  39.51 
 
 
328 aa  216  4e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0147  GHMP kinase  40.37 
 
 
325 aa  216  5e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4245  GHMP kinase  37.04 
 
 
328 aa  196  4.0000000000000005e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.469148 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5597  GHMP kinase  38.96 
 
 
326 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5465  GHMP kinase  37.84 
 
 
326 aa  178  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3977  GHMP kinase  37.61 
 
 
327 aa  177  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0153  GHMP kinase  35.67 
 
 
347 aa  149  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1610  capsular biosynthesis sugar kinase, putative  31.56 
 
 
339 aa  136  6.0000000000000005e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.594755  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1424  capsular biosynthesis sugar kinase, putative  31.25 
 
 
339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.878412  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1759  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  31.56 
 
 
339 aa  133  3.9999999999999996e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.44471  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0236  GHMP kinase  33.84 
 
 
350 aa  130  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0447  GHMP kinase  32.46 
 
 
347 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3292  WcbL  30.59 
 
 
346 aa  122  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0532  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  30.59 
 
 
346 aa  122  7e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22033  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2296  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  30.59 
 
 
346 aa  122  7e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1068  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  30.59 
 
 
346 aa  122  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3243  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  30.59 
 
 
346 aa  122  7e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.455647  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3278  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  30.59 
 
 
346 aa  122  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2174  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  30.59 
 
 
346 aa  122  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4217  GHMP kinase  32.46 
 
 
347 aa  122  8e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0374  GHMP kinase  33.44 
 
 
343 aa  119  6e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.638274  normal  0.807327 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3115  GHMP kinase  28.75 
 
 
339 aa  119  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0720  GHMP kinase  32.62 
 
 
341 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3668  GHMP kinase  34.18 
 
 
336 aa  115  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10116  D-alpha-D-heptose-7-phosphate kinase hddA  31.06 
 
 
386 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1742  GHMP kinase  29.88 
 
 
343 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.2795 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3581  GHMP kinase  33.44 
 
 
345 aa  106  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3600  GHMP kinase  29.3 
 
 
349 aa  105  9e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1374  GHMP kinase  33.44 
 
 
337 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1336  hypothetical protein  28.16 
 
 
327 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.296421  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3592  GHMP kinase  28.05 
 
 
354 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.437274  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0952  GHMP kinase  26.62 
 
 
354 aa  82.8  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.70731  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2647  GHMP kinase  27.42 
 
 
293 aa  80.1  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2431  GHMP kinase  23.75 
 
 
343 aa  63.5  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.696498  normal  0.378909 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2135  mevalonate kinase  27.2 
 
 
314 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1710  GHMP kinase  24.15 
 
 
350 aa  59.7  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  22.29 
 
 
383 aa  59.3  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  24.11 
 
 
369 aa  57.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0721  mevalonate kinase  26.58 
 
 
313 aa  54.7  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00059401  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0681  mevalonate kinase  24.63 
 
 
290 aa  55.1  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2395  mevalonate kinase  24.5 
 
 
303 aa  54.7  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000672574  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0620  phosphomevalonate kinase  26.58 
 
 
313 aa  54.7  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.373049  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  21.43 
 
 
380 aa  55.1  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10631  galactokinase  25.41 
 
 
363 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00193784  normal  0.94952 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0415  galactokinase  24.43 
 
 
355 aa  53.1  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  23.84 
 
 
403 aa  53.1  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1097  galactokinase  20.93 
 
 
385 aa  52.8  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0010459  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  24.93 
 
 
391 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0891  mevalonate kinase  26.2 
 
 
322 aa  52.4  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4315  mevalonate kinase  24.34 
 
 
313 aa  51.2  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1562  galactokinase  24.87 
 
 
350 aa  50.4  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1628  galactokinase  24.87 
 
 
350 aa  50.4  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0425  galactokinase  23.71 
 
 
351 aa  50.1  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64864  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  24.05 
 
 
391 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  23.03 
 
 
349 aa  50.1  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.210895 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0579  GHMP kinase  22.35 
 
 
361 aa  50.1  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000495739  decreased coverage  0.000433765 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1100  mevalonate kinase  25.44 
 
 
306 aa  49.3  0.00008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.979552  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1171  galactokinase  24.23 
 
 
383 aa  49.3  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0476  mevalonate kinase  25.12 
 
 
321 aa  48.9  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0776  galactokinase  24.03 
 
 
355 aa  48.5  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  22.29 
 
 
414 aa  48.9  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2309  homoserine kinase  25.87 
 
 
308 aa  48.1  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  21.74 
 
 
387 aa  47.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1114  GHMP kinase  21.32 
 
 
382 aa  48.5  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1633  galactokinase  21.98 
 
 
384 aa  47.4  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0316  GHMP kinase  22.25 
 
 
359 aa  47  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2857  galactokinase  24.12 
 
 
383 aa  45.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2945  galactokinase  24.12 
 
 
383 aa  45.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0536  galactokinase  22.49 
 
 
396 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1411  galactokinase  24.12 
 
 
383 aa  45.8  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1829  mevalonate kinase  24.79 
 
 
338 aa  45.1  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2085  galactokinase  22.71 
 
 
394 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  23.7 
 
 
372 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3249  galactokinase  23.86 
 
 
387 aa  45.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0454  mevalonate kinase  24.9 
 
 
310 aa  45.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7279  galactokinase  23.53 
 
 
418 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2085  galactokinase  21.51 
 
 
385 aa  44.3  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351225  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  25.61 
 
 
405 aa  43.9  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1114  galactokinase  22.35 
 
 
386 aa  43.9  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2212  galactokinase  26.87 
 
 
399 aa  43.9  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.180846  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2002  mevalonate kinase  34.15 
 
 
356 aa  43.9  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.360358  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04957  galactokinase (AFU_orthologue; AFUA_3G10300)  32.04 
 
 
524 aa  43.9  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1736  mevalonate kinase  25.11 
 
 
316 aa  43.1  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1677  galactokinase  22.86 
 
 
400 aa  43.1  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114591 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2890  mevalonate kinase  23.5 
 
 
289 aa  43.1  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00676748  normal  0.719721 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0532  galactokinase  23.08 
 
 
351 aa  43.1  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.560664  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14830  homoserine kinase  23.39 
 
 
297 aa  42.7  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17524  normal  0.116843 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1701  galactokinase  26.2 
 
 
398 aa  42.7  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3717  galactokinase  23.24 
 
 
376 aa  42.7  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0664685  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2604  mevalonate kinase  25.81 
 
 
327 aa  42.7  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.395275  normal  0.323877 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>