111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1742 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1742  GHMP kinase  100 
 
 
343 aa  699    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.2795 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3115  GHMP kinase  53.98 
 
 
339 aa  348  6e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0720  GHMP kinase  54.73 
 
 
341 aa  346  3e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2296  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  51.03 
 
 
346 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3292  WcbL  51.03 
 
 
346 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0532  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  51.03 
 
 
346 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22033  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1068  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  51.03 
 
 
346 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3243  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  51.03 
 
 
346 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.455647  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3278  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  51.03 
 
 
346 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2174  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  51.03 
 
 
346 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1424  capsular biosynthesis sugar kinase, putative  50.59 
 
 
339 aa  325  8.000000000000001e-88  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.878412  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1759  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  50.59 
 
 
339 aa  323  2e-87  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.44471  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1610  capsular biosynthesis sugar kinase, putative  50.29 
 
 
339 aa  322  5e-87  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.594755  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10116  D-alpha-D-heptose-7-phosphate kinase hddA  43.4 
 
 
386 aa  250  2e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0236  GHMP kinase  41.64 
 
 
350 aa  226  6e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3668  GHMP kinase  34.08 
 
 
336 aa  169  6e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0374  GHMP kinase  34.48 
 
 
343 aa  166  5e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.638274  normal  0.807327 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3581  GHMP kinase  34.99 
 
 
345 aa  163  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1374  GHMP kinase  35.07 
 
 
337 aa  163  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0153  GHMP kinase  34.15 
 
 
347 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0147  GHMP kinase  34.27 
 
 
325 aa  141  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0447  GHMP kinase  32.61 
 
 
347 aa  138  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0206  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase, putative  33.24 
 
 
325 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4217  GHMP kinase  31.87 
 
 
347 aa  132  9e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0788  GHMP kinase  31.49 
 
 
328 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0617  GHMP kinase  29.88 
 
 
333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.170003  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1635  GHMP kinase  29.73 
 
 
326 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1662  GHMP kinase  29.73 
 
 
326 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.501068  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0793  GHMP kinase  32.27 
 
 
331 aa  124  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3977  GHMP kinase  30.97 
 
 
327 aa  123  5e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4245  GHMP kinase  31.11 
 
 
328 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.469148 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4922  GHMP kinase  31.8 
 
 
359 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.272679  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5597  GHMP kinase  31.27 
 
 
326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1227  GHMP kinase  29.63 
 
 
333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464209  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5465  GHMP kinase  31.29 
 
 
326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3592  GHMP kinase  26.01 
 
 
354 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.437274  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0952  GHMP kinase  26.63 
 
 
354 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.70731  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2647  GHMP kinase  28.7 
 
 
293 aa  104  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3600  GHMP kinase  29.34 
 
 
349 aa  88.2  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0532  galactokinase  28.31 
 
 
351 aa  76.6  0.0000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.560664  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0776  galactokinase  27.05 
 
 
355 aa  72  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2431  GHMP kinase  24.48 
 
 
343 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.696498  normal  0.378909 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1114  GHMP kinase  26.79 
 
 
382 aa  66.2  0.0000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  24.52 
 
 
403 aa  65.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0579  GHMP kinase  37.04 
 
 
361 aa  64.3  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000495739  decreased coverage  0.000433765 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  26.83 
 
 
395 aa  60.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  22.48 
 
 
380 aa  59.7  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0316  GHMP kinase  26.94 
 
 
359 aa  59.3  0.00000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  21.86 
 
 
383 aa  58.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1336  hypothetical protein  23.27 
 
 
327 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.296421  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4315  mevalonate kinase  23.56 
 
 
313 aa  57.4  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2212  galactokinase  24.55 
 
 
399 aa  57.4  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.180846  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0425  galactokinase  25.38 
 
 
351 aa  57  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64864  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2604  mevalonate kinase  24.4 
 
 
327 aa  56.2  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.395275  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0454  mevalonate kinase  23.29 
 
 
310 aa  55.1  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0681  mevalonate kinase  27.36 
 
 
290 aa  55.1  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  21.96 
 
 
386 aa  53.5  0.000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1736  mevalonate kinase  24.06 
 
 
316 aa  53.1  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1829  mevalonate kinase  24.11 
 
 
338 aa  52.4  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2002  mevalonate kinase  27.19 
 
 
356 aa  52.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.360358  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0476  mevalonate kinase  28.64 
 
 
321 aa  51.6  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1562  galactokinase  23.98 
 
 
350 aa  51.2  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1628  galactokinase  23.98 
 
 
350 aa  51.2  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  26.06 
 
 
387 aa  51.6  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  24.43 
 
 
389 aa  50.8  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  24.12 
 
 
359 aa  50.4  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2085  galactokinase  20.49 
 
 
394 aa  50.4  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0439  mevalonate kinase  24.23 
 
 
328 aa  50.4  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0891  mevalonate kinase  25.51 
 
 
322 aa  49.7  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2395  mevalonate kinase  25.21 
 
 
303 aa  49.7  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000672574  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  23.24 
 
 
387 aa  49.7  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3018  galactokinase  21.88 
 
 
361 aa  49.7  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1552  galactokinase  22.52 
 
 
387 aa  48.9  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  22.78 
 
 
349 aa  48.9  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3238  galactokinase  23.91 
 
 
397 aa  48.5  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.217049  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1466  galactokinase  30.36 
 
 
388 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  25 
 
 
385 aa  48.5  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0657  galactokinase  21.79 
 
 
387 aa  48.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1100  mevalonate kinase  21.67 
 
 
306 aa  48.5  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.979552  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  21.43 
 
 
387 aa  48.1  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2135  mevalonate kinase  21.55 
 
 
314 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3409  mevalonate kinase  28.25 
 
 
347 aa  47.4  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1313  galactokinase  22.26 
 
 
390 aa  47  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.20548  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1701  galactokinase  23.75 
 
 
398 aa  46.2  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4110  galactokinase  24.62 
 
 
356 aa  46.2  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2045  mevalonate kinase  27.54 
 
 
330 aa  46.6  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  20.92 
 
 
414 aa  46.6  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10631  galactokinase  20.54 
 
 
363 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00193784  normal  0.94952 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0646  mevalonate kinase  34.62 
 
 
319 aa  45.8  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.199793  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  22.89 
 
 
391 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4019  galactokinase  27.65 
 
 
357 aa  45.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1033  mevalonate kinase  24.76 
 
 
322 aa  44.7  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0258  mevalonate kinase  34.62 
 
 
317 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  23.51 
 
 
391 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  22.55 
 
 
349 aa  45.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.210895 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1710  GHMP kinase  26.4 
 
 
350 aa  44.3  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3249  galactokinase  20.92 
 
 
387 aa  44.7  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0708  mevalonate kinase  23.65 
 
 
297 aa  44.3  0.003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3653  galactokinase  26.94 
 
 
434 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1114  galactokinase  23.43 
 
 
386 aa  43.9  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>