160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0819 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0819  Galactokinase  100 
 
 		 403 aa  837    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.847114  normal  0.0773074 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1201  Galactokinase  42.89 
 
 		 410 aa  305  8.000000000000001e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0388  Galactokinase  39.9 
 
 		 427 aa  284  2.0000000000000002e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06460  galactokinase  41.3 
 
 		 439 aa  275  1.0000000000000001e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3653  galactokinase  39.72 
 
 		 434 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2237  galactokinase  33.51 
 
 		 415 aa  194  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002662  galactokinase  29.52 
 
 		 386 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03327  galactokinase  28.57 
 
 		 386 aa  129  7.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1464  galactokinase  30.63 
 
 		 394 aa  124  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10348  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3249  galactokinase  30.08 
 
 		 387 aa  122  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1677  galactokinase  30.42 
 
 		 400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114591 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  27.06 
 
 		 380 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  30.33 
 
 		 391 aa  119  7.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  28.92 
 
 		 389 aa  119  9e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2017  galactokinase  28.96 
 
 		 387 aa  119  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126452  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  28.88 
 
 		 385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1291  galactokinase  29.57 
 
 		 383 aa  118  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.68588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2085  galactokinase  28.38 
 
 		 385 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0811  galactokinase  27.79 
 
 		 382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  27.79 
 
 		 382 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  28.61 
 
 		 372 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  27.79 
 
 		 382 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  27.79 
 
 		 382 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  27.95 
 
 		 382 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  27.79 
 
 		 382 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  27.95 
 
 		 382 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  28.76 
 
 		 387 aa  113  6e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3238  galactokinase  28.01 
 
 		 397 aa  113  6e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.217049  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2888  galactokinase  28.81 
 
 		 383 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  27.95 
 
 		 382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0939  galactokinase  27.22 
 
 		 389 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0577  galactokinase  27.15 
 
 		 384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0969  galactokinase  29.89 
 
 		 392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.003784  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0838  galactokinase  27.13 
 
 		 382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0869  galactokinase  27.67 
 
 		 382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0901  galactokinase  27.13 
 
 		 382 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0810  galactokinase  27.67 
 
 		 382 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20660  galactokinase  29.29 
 
 		 404 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1701  galactokinase  27.46 
 
 		 398 aa  110  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2857  galactokinase  27.65 
 
 		 383 aa  109  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1411  galactokinase  27.65 
 
 		 383 aa  109  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2945  galactokinase  27.65 
 
 		 383 aa  109  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00232  galactokinase  26.94 
 
 		 379 aa  107  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0647  galactokinase  27.3 
 
 		 389 aa  107  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00202468  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  26.49 
 
 		 386 aa  107  5e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1633  galactokinase  26.67 
 
 		 384 aa  105  1e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  30.48 
 
 		 391 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1197  galactokinase  26.8 
 
 		 405 aa  105  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.765458  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  26.61 
 
 		 387 aa  104  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  26.03 
 
 		 403 aa  103  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1248  galactokinase  27.15 
 
 		 382 aa  103  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1171  galactokinase  28.18 
 
 		 383 aa  104  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1073  galactokinase  28.31 
 
 		 385 aa  103  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.848986  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1313  galactokinase  27.25 
 
 		 390 aa  103  8e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.20548  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1097  galactokinase  28.13 
 
 		 385 aa  102  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0010459  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2212  galactokinase  26.9 
 
 		 399 aa  100  4e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.180846  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1516  galactokinase  25.45 
 
 		 385 aa  100  5e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3336  galactokinase  29.51 
 
 		 409 aa  99.4  9e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.325513  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1562  galactokinase  28.03 
 
 		 350 aa  99  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1777  galactokinase  25.07 
 
 		 392 aa  99.4  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0415  galactokinase  27.11 
 
 		 355 aa  99  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1632  galactokinase  24.75 
 
 		 394 aa  99  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0536  galactokinase  26.51 
 
 		 396 aa  99  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1628  galactokinase  28.03 
 
 		 350 aa  99  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  29.89 
 
 		 369 aa  98.2  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1326  galactokinase  29.28 
 
 		 387 aa  98.6  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  26.17 
 
 		 395 aa  97.8  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7279  galactokinase  27.71 
 
 		 418 aa  97.8  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2952  galactokinase  29.48 
 
 		 387 aa  97.4  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4020  galactokinase  26.98 
 
 		 388 aa  97.8  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000198069 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3662  galactokinase  28 
 
 		 412 aa  97.1  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0296405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  26.4 
 
 		 383 aa  96.7  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0304  galactokinase  25 
 
 		 392 aa  96.3  8e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  27.22 
 
 		 393 aa  95.5  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  28.3 
 
 		 359 aa  95.9  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  27.62 
 
 		 414 aa  95.9  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1114  galactokinase  28.49 
 
 		 386 aa  95.1  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0652  galactokinase  25.71 
 
 		 388 aa  94.7  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.430663  hitchhiker  0.00000383534 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2085  galactokinase  24.47 
 
 		 394 aa  94  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0830  galactokinase  26.51 
 
 		 386 aa  92.4  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0480015  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1191  galactokinase  30.04 
 
 		 373 aa  91.7  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1466  galactokinase  28.92 
 
 		 388 aa  90.9  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4056  galactokinase  27.53 
 
 		 403 aa  90.9  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.37616  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3271  galactokinase  26.97 
 
 		 388 aa  90.9  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6391  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0892  galactokinase  28.61 
 
 		 391 aa  90.1  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0958973 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  27.68 
 
 		 349 aa  90.1  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210895 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0578  galactokinase  24.68 
 
 		 388 aa  90.1  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3668  galactokinase  27.12 
 
 		 380 aa  89.7  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4206  galactokinase  30 
 
 		 376 aa  89.4  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2244  galactokinase  25.82 
 
 		 399 aa  88.2  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1552  galactokinase  24.68 
 
 		 387 aa  87.8  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  29.07 
 
 		 349 aa  87.8  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3026  galactokinase  27.15 
 
 		 389 aa  87.8  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2607  galactokinase  27.03 
 
 		 399 aa  86.7  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00377614  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  24.42 
 
 		 387 aa  86.7  7e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0425  galactokinase  27.75 
 
 		 351 aa  85.9  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64864  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1233  galactokinase  29.14 
 
 		 395 aa  86.3  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000254056 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0502  galactokinase  27.53 
 
 		 384 aa  85.5  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.592539  normal  0.852074 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0355  galactokinase  26.89 
 
 		 389 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0414  galactokinase  27.17 
 
 		 381 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>