90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1602 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1602  mevalonate kinase  100 
 
 		 316 aa  638    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0123084  normal  0.126865 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1358  mevalonate kinase  54.05 
 
 		 314 aa  323  2e-87  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0467  mevalonate kinase  34.71 
 
 		 314 aa  149  5e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.250256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1599  mevalonate kinase  35.56 
 
 		 315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.309754  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2604  mevalonate kinase  32.46 
 
 		 327 aa  143  3e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.395275  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0966  mevalonate kinase  36.17 
 
 		 336 aa  140  3e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.104962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1653  mevalonate kinase  34.84 
 
 		 314 aa  135  8e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0891  mevalonate kinase  33.33 
 
 		 322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2395  mevalonate kinase  33.57 
 
 		 303 aa  127  3e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000672574  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1835  mevalonate kinase  33.33 
 
 		 310 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.782527 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1829  mevalonate kinase  31.09 
 
 		 338 aa  123  4e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0439  mevalonate kinase  31.4 
 
 		 328 aa  119  4.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0476  mevalonate kinase  33.9 
 
 		 321 aa  119  9e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1100  mevalonate kinase  31.62 
 
 		 306 aa  116  5e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.979552  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2045  mevalonate kinase  31.88 
 
 		 330 aa  113  5e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0681  mevalonate kinase  33.57 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0580  mevalonate kinase  30.46 
 
 		 317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.761954  normal  0.0461716 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1385  mevalonate kinase  29.33 
 
 		 310 aa  110  4.0000000000000004e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0258  mevalonate kinase  30.13 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1421  mevalonate kinase  30.19 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.238571  hitchhiker  0.00767711 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1338  mevalonate kinase  30.59 
 
 		 317 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.332068  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2541  mevalonate kinase  31.36 
 
 		 328 aa  98.6  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4315  mevalonate kinase  29.23 
 
 		 313 aa  97.8  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2376  mevalonate kinase  31.25 
 
 		 289 aa  96.3  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1736  mevalonate kinase  28.87 
 
 		 316 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0721  mevalonate kinase  26.86 
 
 		 313 aa  92.8  6e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00059401  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0620  phosphomevalonate kinase  26.86 
 
 		 313 aa  92.8  6e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.373049  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0454  mevalonate kinase  28.62 
 
 		 310 aa  90.9  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2135  mevalonate kinase  26.37 
 
 		 314 aa  89.4  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2213  mevalonate kinase  31.67 
 
 		 289 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0646  mevalonate kinase  28.36 
 
 		 319 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.199793  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0598  mevalonate kinase  29.54 
 
 		 286 aa  82.4  0.000000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0315  mevalonate kinase  27.34 
 
 		 313 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0628  mevalonate kinase  30.71 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0613  mevalonate kinase  30.71 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1323  mevalonate kinase  27.3 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.516434  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2002  mevalonate kinase  27.12 
 
 		 356 aa  79.3  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.360358  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0775  mevalonate kinase  28.09 
 
 		 356 aa  79.3  0.00000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1812  mevalonate kinase  33.57 
 
 		 289 aa  77.8  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1733  GHMP kinase  24.91 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1124  mevalonate kinase  26.71 
 
 		 276 aa  75.1  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1033  mevalonate kinase  26.44 
 
 		 322 aa  73.6  0.000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0915  mevalonate kinase  27.21 
 
 		 316 aa  72.4  0.000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00806632  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0722  putative phopshomevalonate kinase  25.22 
 
 		 340 aa  71.6  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190894  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0913  phosphomevalonate kinase  25 
 
 		 375 aa  70.1  0.00000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000929735  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1326  mevalonate kinase, putative  29.23 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0418302  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0621  mevalonate kinase  24.63 
 
 		 340 aa  68.9  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132017  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2461  mevalonate kinase  24.14 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0240  phosphomevalonate kinase  24.53 
 
 		 358 aa  64.3  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1732  GHMP kinase  22.36 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0579  GHMP kinase  26.09 
 
 		 361 aa  63.2  0.000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000495739  decreased coverage  0.000433765 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3409  mevalonate kinase  24.66 
 
 		 347 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40742  mevalonate kinase  25.43 
 
 		 432 aa  61.2  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0150941 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0708  mevalonate kinase  23.38 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2647  GHMP kinase  25.13 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  27.23 
 
 		 414 aa  57.4  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1628  galactokinase  24.84 
 
 		 350 aa  57.8  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1562  galactokinase  24.84 
 
 		 350 aa  57.8  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0316  GHMP kinase  24.29 
 
 		 359 aa  55.8  0.0000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0238  mevalonate kinase  26.74 
 
 		 306 aa  55.5  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03869  mevalonate kinase (AFU_orthologue; AFUA_4G07780)  22.29 
 
 		 735 aa  53.5  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.105428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  25.31 
 
 		 385 aa  53.5  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1035  phosphomevalonate kinase  22.42 
 
 		 380 aa  52.8  0.000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0615  phosphomevalonate kinase  25.99 
 
 		 358 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0630  phosphomevalonate kinase  25.99 
 
 		 358 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2481  galactokinase  25.91 
 
 		 348 aa  50.8  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.883324  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1387  phosphomevalonate kinase  24.31 
 
 		 339 aa  50.4  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0578  galactokinase  23.16 
 
 		 388 aa  50.4  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0447  GHMP kinase  24.77 
 
 		 347 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1633  galactokinase  25 
 
 		 384 aa  48.5  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0314  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  24.15 
 
 		 779 aa  49.3  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0544804 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0536  galactokinase  23.77 
 
 		 396 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0415  galactokinase  23.08 
 
 		 355 aa  47.4  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  23.17 
 
 		 372 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3115  GHMP kinase  22.16 
 
 		 339 aa  47.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3026  galactokinase  41.79 
 
 		 389 aa  47.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0617  GHMP kinase  26.15 
 
 		 333 aa  47  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.170003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  24.23 
 
 		 387 aa  47  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0374  GHMP kinase  25 
 
 		 343 aa  45.8  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.638274  normal  0.807327 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1575  phosphomevalonate kinase  24.07 
 
 		 322 aa  45.4  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00534382 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  22.05 
 
 		 349 aa  45.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210895 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3668  GHMP kinase  24.32 
 
 		 336 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0720  GHMP kinase  27.16 
 
 		 341 aa  44.3  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4217  GHMP kinase  27.91 
 
 		 347 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2960  galactokinase  44.64 
 
 		 407 aa  44.3  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0133618  decreased coverage  0.000169773 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53929  mevalonate kinase  42.86 
 
 		 490 aa  43.5  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.323174  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0456  phosphomevalonate kinase  22.34 
 
 		 329 aa  43.5  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  25.44 
 
 		 349 aa  43.1  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1552  galactokinase  23.62 
 
 		 387 aa  43.1  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3592  GHMP kinase  24.77 
 
 		 354 aa  42.7  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.437274  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>