37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0240 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0240  phosphomevalonate kinase  100 
 
 		 358 aa  741    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0615  phosphomevalonate kinase  79.33 
 
 		 358 aa  601  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0630  phosphomevalonate kinase  79.33 
 
 		 358 aa  601  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0913  phosphomevalonate kinase  41.85 
 
 		 375 aa  299  4e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000929735  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1035  phosphomevalonate kinase  40.73 
 
 		 380 aa  276  5e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0314  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  35.71 
 
 		 779 aa  211  2e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0544804 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0600  phosphomevalonate kinase  31.14 
 
 		 331 aa  150  3e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1324  phosphomevalonate kinase  30.57 
 
 		 330 aa  139  7e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1387  phosphomevalonate kinase  27.5 
 
 		 339 aa  135  9.999999999999999e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1102  phosphomevalonate kinase  29.32 
 
 		 249 aa  90.9  4e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.029164  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1575  phosphomevalonate kinase  27.47 
 
 		 322 aa  77  0.0000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00534382 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0722  putative phopshomevalonate kinase  25.21 
 
 		 340 aa  72.8  0.000000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190894  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0621  mevalonate kinase  24.93 
 
 		 340 aa  70.9  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132017  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0315  mevalonate kinase  24.92 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0721  mevalonate kinase  22.89 
 
 		 313 aa  66.2  0.0000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00059401  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0620  phosphomevalonate kinase  22.89 
 
 		 313 aa  66.2  0.0000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.373049  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0258  mevalonate kinase  29.06 
 
 		 317 aa  63.5  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1358  mevalonate kinase  31.46 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0456  phosphomevalonate kinase  29.57 
 
 		 329 aa  63.2  0.000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1338  mevalonate kinase  29.56 
 
 		 317 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.332068  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0476  mevalonate kinase  24.34 
 
 		 321 aa  62.4  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1602  mevalonate kinase  29.51 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0123084  normal  0.126865 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1829  mevalonate kinase  23.66 
 
 		 338 aa  58.2  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2604  mevalonate kinase  20.97 
 
 		 327 aa  58.2  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.395275  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0580  mevalonate kinase  29.06 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.761954  normal  0.0461716 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0782  GHMP kinase  26.94 
 
 		 323 aa  55.8  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0646  mevalonate kinase  24.49 
 
 		 319 aa  55.5  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.199793  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52257  Phosphomevalonate kinase  23.63 
 
 		 452 aa  54.7  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.435528  normal  0.126938 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1421  mevalonate kinase  22.92 
 
 		 301 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.238571  hitchhiker  0.00767711 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0966  mevalonate kinase  21.65 
 
 		 336 aa  51.6  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.104962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1562  galactokinase  26.47 
 
 		 350 aa  51.2  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1628  galactokinase  26.47 
 
 		 350 aa  51.2  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1122  GHMP kinase  23.69 
 
 		 288 aa  50.4  0.00004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0439  mevalonate kinase  21.45 
 
 		 328 aa  48.9  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1100  mevalonate kinase  22.87 
 
 		 306 aa  47.8  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.979552  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2135  mevalonate kinase  22.96 
 
 		 314 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0891  mevalonate kinase  21.87 
 
 		 322 aa  42.7  0.009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>