12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_52257 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_52257  Phosphomevalonate kinase  100 
 
 		 452 aa  938    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.435528  normal  0.126938 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02311  phosphomevalonate kinase (AFU_orthologue; AFUA_5G10680)  36.49 
 
 		 480 aa  218  2e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000000089901  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00100  expressed protein  29.34 
 
 		 560 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0913  phosphomevalonate kinase  27.51 
 
 		 375 aa  77  0.0000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000929735  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1575  phosphomevalonate kinase  27.49 
 
 		 322 aa  71.2  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00534382 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0782  GHMP kinase  51.39 
 
 		 323 aa  67  0.0000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0240  phosphomevalonate kinase  23.63 
 
 		 358 aa  54.7  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1387  phosphomevalonate kinase  26.22 
 
 		 339 aa  54.7  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0615  phosphomevalonate kinase  21.67 
 
 		 358 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0630  phosphomevalonate kinase  21.67 
 
 		 358 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1035  phosphomevalonate kinase  23.36 
 
 		 380 aa  47  0.0008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0314  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  24.46 
 
 		 779 aa  44.7  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0544804 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>