25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0782 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0782  GHMP kinase  100 
 
 
323 aa  648    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1575  phosphomevalonate kinase  53.58 
 
 
322 aa  344  1e-93  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  decreased coverage  0.00534382 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0913  phosphomevalonate kinase  27 
 
 
375 aa  77.8  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000929735  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1035  phosphomevalonate kinase  27.42 
 
 
380 aa  74.3  0.000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0315  mevalonate kinase  27.65 
 
 
313 aa  67.4  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52257  Phosphomevalonate kinase  51.39 
 
 
452 aa  67  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.435528  normal  0.126938 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0707  putative phosphomevalonate kinase  30 
 
 
317 aa  60.5  0.00000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00100  expressed protein  34.75 
 
 
560 aa  59.3  0.00000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0630  phosphomevalonate kinase  26.26 
 
 
358 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0615  phosphomevalonate kinase  26.26 
 
 
358 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02311  phosphomevalonate kinase (AFU_orthologue; AFUA_5G10680)  43.42 
 
 
480 aa  58.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000000089901  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1102  phosphomevalonate kinase  27.75 
 
 
249 aa  55.8  0.0000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.029164  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0240  phosphomevalonate kinase  26.94 
 
 
358 aa  55.8  0.0000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1387  phosphomevalonate kinase  23.7 
 
 
339 aa  52.8  0.000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0620  phosphomevalonate kinase  22.74 
 
 
313 aa  51.2  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.373049  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0721  mevalonate kinase  22.74 
 
 
313 aa  51.2  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00059401  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0681  mevalonate kinase  25.4 
 
 
290 aa  50.4  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0314  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  23.61 
 
 
779 aa  48.9  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0544804 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0476  mevalonate kinase  23.28 
 
 
321 aa  47.8  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1033  mevalonate kinase  24.58 
 
 
322 aa  47.8  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2395  mevalonate kinase  25 
 
 
303 aa  45.8  0.0009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000672574  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3668  GHMP kinase  28.49 
 
 
336 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0439  mevalonate kinase  22.74 
 
 
328 aa  43.1  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0467  mevalonate kinase  21.56 
 
 
314 aa  42.7  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.250256  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2604  mevalonate kinase  23.36 
 
 
327 aa  42.7  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.395275  normal  0.323877 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>