54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0913 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0913  phosphomevalonate kinase  100 
 
 		 375 aa  779    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000929735  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1035  phosphomevalonate kinase  52.25 
 
 		 380 aa  382  1e-105  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0615  phosphomevalonate kinase  41.57 
 
 		 358 aa  307  2.0000000000000002e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0630  phosphomevalonate kinase  41.57 
 
 		 358 aa  307  2.0000000000000002e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0240  phosphomevalonate kinase  41.85 
 
 		 358 aa  299  4e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0314  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  36.82 
 
 		 779 aa  231  2e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0544804 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1387  phosphomevalonate kinase  31.93 
 
 		 339 aa  141  1.9999999999999998e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0600  phosphomevalonate kinase  29.31 
 
 		 331 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1324  phosphomevalonate kinase  28.29 
 
 		 330 aa  130  3e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1102  phosphomevalonate kinase  32.12 
 
 		 249 aa  100  4e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.029164  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0456  phosphomevalonate kinase  27.36 
 
 		 329 aa  93.2  7e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1575  phosphomevalonate kinase  28.74 
 
 		 322 aa  91.7  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00534382 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0620  phosphomevalonate kinase  26.71 
 
 		 313 aa  88.2  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.373049  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0721  mevalonate kinase  26.71 
 
 		 313 aa  88.2  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00059401  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1122  GHMP kinase  25.86 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0580  mevalonate kinase  25.47 
 
 		 317 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.761954  normal  0.0461716 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0315  mevalonate kinase  24.29 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0258  mevalonate kinase  24.54 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0782  GHMP kinase  27 
 
 		 323 aa  77.8  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52257  Phosphomevalonate kinase  27.51 
 
 		 452 aa  77  0.0000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.435528  normal  0.126938 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1829  mevalonate kinase  25.51 
 
 		 338 aa  77  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0476  mevalonate kinase  26.63 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0966  mevalonate kinase  25.17 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.104962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1338  mevalonate kinase  24.24 
 
 		 317 aa  70.5  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.332068  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0681  mevalonate kinase  27.27 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1421  mevalonate kinase  26.19 
 
 		 301 aa  67  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.238571  hitchhiker  0.00767711 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2045  mevalonate kinase  26.72 
 
 		 330 aa  66.6  0.0000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2395  mevalonate kinase  28.07 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000672574  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1100  mevalonate kinase  26.32 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.979552  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0646  mevalonate kinase  25.76 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.199793  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1602  mevalonate kinase  24.57 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0123084  normal  0.126865 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2604  mevalonate kinase  23.85 
 
 		 327 aa  59.7  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.395275  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0439  mevalonate kinase  25.89 
 
 		 328 aa  59.3  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0467  mevalonate kinase  25.29 
 
 		 314 aa  57  0.0000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.250256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0722  putative phopshomevalonate kinase  22.19 
 
 		 340 aa  56.6  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190894  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1358  mevalonate kinase  22.76 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0621  mevalonate kinase  21.92 
 
 		 340 aa  55.1  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132017  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2541  mevalonate kinase  25.75 
 
 		 328 aa  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1599  mevalonate kinase  25.22 
 
 		 315 aa  51.2  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.309754  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1733  GHMP kinase  25.31 
 
 		 295 aa  49.7  0.00008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0707  putative phosphomevalonate kinase  25.41 
 
 		 317 aa  48.9  0.0001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1418  homoserine kinase  24.75 
 
 		 304 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.011674  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1391  homoserine kinase  24.75 
 
 		 304 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00775199  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1732  GHMP kinase  22.67 
 
 		 349 aa  48.1  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1033  mevalonate kinase  23.56 
 
 		 322 aa  48.5  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02311  phosphomevalonate kinase (AFU_orthologue; AFUA_5G10680)  23.64 
 
 		 480 aa  46.6  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000000089901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1653  mevalonate kinase  24.53 
 
 		 314 aa  46.6  0.0007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0775  mevalonate kinase  22.13 
 
 		 356 aa  46.6  0.0008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0891  mevalonate kinase  25.38 
 
 		 322 aa  46.2  0.0009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2213  mevalonate kinase  24.26 
 
 		 289 aa  45.8  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2002  mevalonate kinase  26.03 
 
 		 356 aa  43.9  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.360358  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40742  mevalonate kinase  22.25 
 
 		 432 aa  43.9  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0150941 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1835  mevalonate kinase  25 
 
 		 310 aa  43.5  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.782527 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1073  galactokinase  25.2 
 
 		 385 aa  43.1  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.848986  normal  0.026776 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>