14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1122 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1122  GHMP kinase  100 
 
 		 288 aa  564  1e-160  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0913  phosphomevalonate kinase  25.86 
 
 		 375 aa  93.6  3e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000929735  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1035  phosphomevalonate kinase  24.7 
 
 		 380 aa  78.6  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1324  phosphomevalonate kinase  27.78 
 
 		 330 aa  76.6  0.0000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0600  phosphomevalonate kinase  24.17 
 
 		 331 aa  75.9  0.0000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0615  phosphomevalonate kinase  24.32 
 
 		 358 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0630  phosphomevalonate kinase  24.32 
 
 		 358 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0314  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  24.54 
 
 		 779 aa  68.6  0.0000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0544804 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0240  phosphomevalonate kinase  23.69 
 
 		 358 aa  62.4  0.000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0456  phosphomevalonate kinase  28.33 
 
 		 329 aa  53.9  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1102  phosphomevalonate kinase  28.37 
 
 		 249 aa  53.9  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.029164  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1733  GHMP kinase  23.2 
 
 		 295 aa  44.3  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1387  phosphomevalonate kinase  28.16 
 
 		 339 aa  42.7  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1575  phosphomevalonate kinase  24.17 
 
 		 322 aa  42.7  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00534382 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>