33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0456 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0456  phosphomevalonate kinase  100 
 
 
329 aa  661    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1387  phosphomevalonate kinase  33.23 
 
 
339 aa  166  5.9999999999999996e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1035  phosphomevalonate kinase  27.09 
 
 
380 aa  103  4e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0913  phosphomevalonate kinase  26.75 
 
 
375 aa  97.1  3e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000929735  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0721  mevalonate kinase  27.8 
 
 
313 aa  77.4  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00059401  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0620  phosphomevalonate kinase  27.8 
 
 
313 aa  77.4  0.0000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.373049  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0630  phosphomevalonate kinase  23.14 
 
 
358 aa  66.2  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0615  phosphomevalonate kinase  23.14 
 
 
358 aa  66.2  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1100  mevalonate kinase  24.2 
 
 
306 aa  64.7  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.979552  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0240  phosphomevalonate kinase  29.57 
 
 
358 aa  63.2  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1102  phosphomevalonate kinase  31.5 
 
 
249 aa  62.8  0.000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.029164  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0600  phosphomevalonate kinase  26.24 
 
 
331 aa  60.5  0.00000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1122  GHMP kinase  25.71 
 
 
288 aa  54.3  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0314  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  27.8 
 
 
779 aa  50.8  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0544804 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1324  phosphomevalonate kinase  24.59 
 
 
330 aa  50.8  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0258  mevalonate kinase  28.57 
 
 
317 aa  49.7  0.00007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0722  putative phopshomevalonate kinase  25.7 
 
 
340 aa  49.7  0.00007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190894  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0580  mevalonate kinase  28.8 
 
 
317 aa  49.3  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.761954  normal  0.0461716 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0621  mevalonate kinase  25.39 
 
 
340 aa  48.5  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132017  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1599  mevalonate kinase  27.1 
 
 
315 aa  47.8  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.309754  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0646  mevalonate kinase  33.33 
 
 
319 aa  47  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.199793  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0454  mevalonate kinase  24.67 
 
 
310 aa  47  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1733  GHMP kinase  26 
 
 
295 aa  46.2  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1418  homoserine kinase  33.75 
 
 
304 aa  46.6  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.011674  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1391  homoserine kinase  33.75 
 
 
304 aa  46.6  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00775199  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4315  mevalonate kinase  23.92 
 
 
313 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1421  mevalonate kinase  26.7 
 
 
301 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.238571  hitchhiker  0.00767711 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1338  mevalonate kinase  26.11 
 
 
317 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.332068  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0476  mevalonate kinase  25.97 
 
 
321 aa  44.3  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1602  mevalonate kinase  24.1 
 
 
316 aa  43.9  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0123084  normal  0.126865 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1358  mevalonate kinase  23.16 
 
 
314 aa  44.3  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1732  GHMP kinase  26.39 
 
 
349 aa  43.5  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0891  mevalonate kinase  22.81 
 
 
322 aa  42.7  0.009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>