22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1102 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1102  phosphomevalonate kinase  100 
 
 
249 aa  505  9.999999999999999e-143  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.029164  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0913  phosphomevalonate kinase  32.12 
 
 
375 aa  100  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000929735  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1035  phosphomevalonate kinase  30.52 
 
 
380 aa  93.2  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0240  phosphomevalonate kinase  29.32 
 
 
358 aa  90.9  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0630  phosphomevalonate kinase  28.92 
 
 
358 aa  89.7  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0615  phosphomevalonate kinase  28.92 
 
 
358 aa  89.7  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0314  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  30.55 
 
 
779 aa  87.8  2e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0544804 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0600  phosphomevalonate kinase  26.67 
 
 
331 aa  80.5  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0620  phosphomevalonate kinase  27.7 
 
 
313 aa  67  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.373049  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0721  mevalonate kinase  27.7 
 
 
313 aa  67  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00059401  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0315  mevalonate kinase  25.77 
 
 
313 aa  63.9  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1387  phosphomevalonate kinase  24.32 
 
 
339 aa  62.8  0.000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0782  GHMP kinase  27.75 
 
 
323 aa  55.8  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1575  phosphomevalonate kinase  26.91 
 
 
322 aa  55.8  0.0000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  decreased coverage  0.00534382 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1100  mevalonate kinase  26.6 
 
 
306 aa  55.5  0.0000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.979552  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0456  phosphomevalonate kinase  31.5 
 
 
329 aa  55.5  0.0000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0476  mevalonate kinase  28.1 
 
 
321 aa  55.1  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1324  phosphomevalonate kinase  26.67 
 
 
330 aa  53.1  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2890  mevalonate kinase  26.81 
 
 
289 aa  47.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00676748  normal  0.719721 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1122  GHMP kinase  26.39 
 
 
288 aa  46.6  0.0004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0681  mevalonate kinase  25.48 
 
 
290 aa  45.8  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2213  mevalonate kinase  24.6 
 
 
289 aa  43.1  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>