46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1733 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1733  GHMP kinase  100 
 
 		 295 aa  605  9.999999999999999e-173  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0620  phosphomevalonate kinase  34 
 
 		 313 aa  176  3e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.373049  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0721  mevalonate kinase  34 
 
 		 313 aa  176  3e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00059401  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2395  mevalonate kinase  31.84 
 
 		 303 aa  97.4  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000672574  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1421  mevalonate kinase  31.02 
 
 		 301 aa  95.9  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.238571  hitchhiker  0.00767711 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1835  mevalonate kinase  25 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.782527 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1358  mevalonate kinase  25.3 
 
 		 314 aa  79  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0315  mevalonate kinase  25.62 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0681  mevalonate kinase  28.47 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0722  putative phopshomevalonate kinase  24.14 
 
 		 340 aa  71.2  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190894  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1602  mevalonate kinase  24.41 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0123084  normal  0.126865 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0476  mevalonate kinase  24.11 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2135  mevalonate kinase  24.38 
 
 		 314 aa  69.7  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0621  mevalonate kinase  24.14 
 
 		 340 aa  69.3  0.00000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132017  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0966  mevalonate kinase  25.56 
 
 		 336 aa  68.9  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.104962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1100  mevalonate kinase  24.45 
 
 		 306 aa  67  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.979552  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0891  mevalonate kinase  24.73 
 
 		 322 aa  66.2  0.0000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1736  mevalonate kinase  24.05 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0915  mevalonate kinase  28.21 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00806632  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2376  mevalonate kinase  29.04 
 
 		 289 aa  62.4  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2045  mevalonate kinase  21.77 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0439  mevalonate kinase  23.51 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40742  mevalonate kinase  23.3 
 
 		 432 aa  60.8  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0150941 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1829  mevalonate kinase  21.52 
 
 		 338 aa  59.3  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4315  mevalonate kinase  23.83 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2213  mevalonate kinase  28.42 
 
 		 289 aa  55.5  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1599  mevalonate kinase  25.45 
 
 		 315 aa  55.5  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.309754  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0467  mevalonate kinase  23.39 
 
 		 314 aa  55.1  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.250256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2541  mevalonate kinase  23.63 
 
 		 328 aa  55.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1124  mevalonate kinase  23.7 
 
 		 276 aa  52.8  0.000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1653  mevalonate kinase  23.55 
 
 		 314 aa  52.4  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2461  mevalonate kinase  23.79 
 
 		 314 aa  52.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2604  mevalonate kinase  21.43 
 
 		 327 aa  51.6  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.395275  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0598  mevalonate kinase  26.84 
 
 		 286 aa  50.1  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0913  phosphomevalonate kinase  25.31 
 
 		 375 aa  49.7  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000929735  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53929  mevalonate kinase  27.49 
 
 		 490 aa  47.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.323174  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0646  mevalonate kinase  26.54 
 
 		 319 aa  46.2  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.199793  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0258  mevalonate kinase  23.5 
 
 		 317 aa  46.2  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0580  mevalonate kinase  25.62 
 
 		 317 aa  45.8  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.761954  normal  0.0461716 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0454  mevalonate kinase  24.91 
 
 		 310 aa  45.8  0.0008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1338  mevalonate kinase  21.72 
 
 		 317 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.332068  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1812  mevalonate kinase  26.35 
 
 		 289 aa  43.9  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1035  phosphomevalonate kinase  23.95 
 
 		 380 aa  43.5  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0456  phosphomevalonate kinase  24.14 
 
 		 329 aa  42.7  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3409  mevalonate kinase  19.58 
 
 		 347 aa  42.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1323  mevalonate kinase  24.42 
 
 		 309 aa  42.7  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.516434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>