29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3255 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3255  pantothenate kinase  100 
 
 
310 aa  637    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.343417 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1186  pantothenate kinase  52.14 
 
 
293 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1433  GHMP kinase  42.9 
 
 
305 aa  204  1e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2679  GHMP kinase  41.8 
 
 
277 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1073  GHMP kinase  39.45 
 
 
279 aa  174  9.999999999999999e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2722  GHMP kinase  38.98 
 
 
293 aa  170  2e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3219  GHMP kinase  38.43 
 
 
279 aa  157  3e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.858637  normal  0.612882 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1396  GHMP kinase  36.36 
 
 
290 aa  153  4e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0512  GHMP kinase  36.13 
 
 
291 aa  149  4e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1240  pantothenate kinase  36 
 
 
291 aa  149  5e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0620  GHMP kinase  37.07 
 
 
274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1385  GHMP kinase  34.72 
 
 
281 aa  140  3e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.372372  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0495  GHMP kinase  37.41 
 
 
312 aa  139  4.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.476081 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0613  GHMP kinase  35.06 
 
 
273 aa  120  3e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1718  GHMP kinase  28.87 
 
 
303 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0509682 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0831  GHMP kinase  29.39 
 
 
289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.680732  normal  0.0934854 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0921  pantothenate kinase  29.76 
 
 
278 aa  116  5e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.610677  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1666  GHMP kinase  30.96 
 
 
288 aa  100  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.024132  normal  0.466144 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1235  GHMP kinase  32.23 
 
 
280 aa  97.8  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.13949  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1051  GHMP kinase  33.8 
 
 
296 aa  90.9  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.265413  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1785  GHMP kinase  28.81 
 
 
291 aa  85.5  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.564621 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1883  GHMP kinase  29.89 
 
 
288 aa  83.2  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0192168  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2002  hypothetical protein  27.2 
 
 
257 aa  79  0.00000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0613  pantothenate kinase  25.7 
 
 
247 aa  73.2  0.000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.821788 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0204  GHMP kinase  25.32 
 
 
270 aa  73.2  0.000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0312  hypothetical protein  26.11 
 
 
255 aa  69.3  0.00000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.11575  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0382  pantothenate kinase  27.6 
 
 
278 aa  68.6  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0437123 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1364  hypothetical protein  25.99 
 
 
258 aa  65.5  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00000668335  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1033  mevalonate kinase  27.57 
 
 
322 aa  47  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>