106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_24245 on replicon NC_009357
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009357  OSTLU_24245  NCS1 family transporter: cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin  100 
 
 
2378 aa  4606    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.175257  decreased coverage  0.00602767 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1985  NCS1 nucleoside transporter family  26.04 
 
 
517 aa  144  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.671932  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2385  NCS1 nucleoside transporter family  25.84 
 
 
492 aa  144  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3590  NCS1 nucleoside transporter  28.8 
 
 
490 aa  135  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.483466 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6713  NCS1 nucleoside transporter  25.42 
 
 
502 aa  134  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.997894 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1594  NCS1 nucleoside transporter  25.42 
 
 
502 aa  132  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6237  NCS1 nucleoside transporter  25.42 
 
 
502 aa  132  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5720  NCS1 nucleoside transporter  25.21 
 
 
502 aa  129  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244182  normal  0.497544 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2863  NCS1 nucleoside transporter  25.05 
 
 
497 aa  129  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5964  NCS1 nucleoside transporter  25 
 
 
502 aa  127  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0145337  normal  0.627469 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4536  NCS1 nucleoside transporter family  26.67 
 
 
533 aa  128  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.854613  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1233  transporter transmembrane protein  26.64 
 
 
502 aa  127  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0759006  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1111  NCS1 nucleoside transporter  26.17 
 
 
494 aa  126  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.502762  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1430  NCS1 family nucleobase/cation symporter  25.37 
 
 
503 aa  126  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2688  NCS1 nucleoside transporter family  25.32 
 
 
503 aa  125  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.931856  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1533  NCS1 nucleoside transporter  25.37 
 
 
503 aa  124  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.578632  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5352  NCS1 nucleoside transporter  24.58 
 
 
502 aa  124  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.157454 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5168  NCS1 nucleoside transporter family  28.79 
 
 
524 aa  123  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.409771 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0222  NCS1 nucleoside transporter  25.44 
 
 
509 aa  122  6e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3637  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.83 
 
 
505 aa  122  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3440  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  25.05 
 
 
494 aa  122  9e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.709152  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4035  NCS1 nucleoside transporter  26.17 
 
 
496 aa  120  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1803  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  26.17 
 
 
496 aa  120  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666463  normal  0.799889 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3444  NCS1 nucleoside transporter family  24.32 
 
 
507 aa  118  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000477865  normal  0.0865773 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0338  NCS1 nucleoside transporter  25.36 
 
 
496 aa  117  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1837  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.48 
 
 
500 aa  116  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.524757  normal  0.0916284 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6657  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  24.58 
 
 
502 aa  115  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  0.0268783 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00768  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  23.63 
 
 
499 aa  111  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1756  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  25 
 
 
514 aa  109  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4056  NCS1 nucleoside transporter  22.09 
 
 
515 aa  108  8e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49824  NCS1 family transporter: cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin  26.32 
 
 
532 aa  107  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05790  putative transporter  23.81 
 
 
496 aa  104  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0546  putative transporter  24.02 
 
 
496 aa  104  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3578  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  26.89 
 
 
486 aa  103  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4150  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  25.62 
 
 
494 aa  100  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4336  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  23.2 
 
 
516 aa  97.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0269962  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4030  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  23.2 
 
 
516 aa  97.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0915622  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3494  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.2 
 
 
516 aa  97.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000614437 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2101  NCS1 nucleoside transporter family  23.69 
 
 
500 aa  97.4  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0075  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.38 
 
 
485 aa  96.7  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.82012  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3875  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.69 
 
 
510 aa  95.5  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.245681  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2039  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  22.43 
 
 
516 aa  94.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0859563  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0582  putative permease  27.74 
 
 
575 aa  94.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1280  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.88 
 
 
483 aa  94.4  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06230  putative permease  27.32 
 
 
575 aa  94.4  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.037417 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3636  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.23 
 
 
510 aa  94  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.542262  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4265  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.46 
 
 
503 aa  93.2  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.864327 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2703  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.12 
 
 
492 aa  92.8  7e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4309  NCS1 nucleoside transporter  24.66 
 
 
510 aa  91.7  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747865  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0843  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.56 
 
 
488 aa  91.3  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0335  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  23.7 
 
 
483 aa  91.7  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1558  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  24.44 
 
 
510 aa  91.3  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462684  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3170  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  23.66 
 
 
536 aa  90.5  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185762  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3430  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  23.39 
 
 
520 aa  90.5  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3194  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.23 
 
 
522 aa  89.4  8e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3413  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.43 
 
 
569 aa  88.6  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1431  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  22.32 
 
 
486 aa  88.6  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4033  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  22.34 
 
 
497 aa  87.4  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1918  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  22.91 
 
 
503 aa  86.3  0.000000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.991169 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2834  NCS1 nucleoside transporter  21.45 
 
 
482 aa  86.3  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0968  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  23.52 
 
 
489 aa  86.3  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.553781  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0400  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.87 
 
 
483 aa  84  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0904039 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2210  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  22.05 
 
 
502 aa  82.8  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2087  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.89 
 
 
485 aa  81.3  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.611219 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1778  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.58 
 
 
506 aa  80.5  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04152  conserved hypothetical protein  23.75 
 
 
483 aa  79.7  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.983602 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02550  conserved hypothetical protein  23.63 
 
 
557 aa  79.7  0.0000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.169602  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08416  conserved hypothetical protein  24.16 
 
 
527 aa  78.6  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0333  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.37 
 
 
451 aa  76.3  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4869  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  20.43 
 
 
518 aa  76.3  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4958  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  20.43 
 
 
518 aa  76.3  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1836  NCS1 nucleoside transporter family protein  25.69 
 
 
487 aa  76.3  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.729443  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3935  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  20.32 
 
 
497 aa  76.3  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461112  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5237  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  20.43 
 
 
543 aa  75.9  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.111402  normal  0.975867 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5371  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.81 
 
 
484 aa  75.5  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.583261  normal  0.663394 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0405  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  25.19 
 
 
452 aa  75.1  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0202053  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1908  NCS1 nucleoside transporter family protein  25.44 
 
 
487 aa  73.6  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.535002  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1389  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.18 
 
 
530 aa  73.6  0.00000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.461228  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5091  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.62 
 
 
483 aa  73.2  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415087  normal  0.0197454 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0932  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  19.91 
 
 
517 aa  73.2  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1098  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  19.43 
 
 
514 aa  73.2  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.286175  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4599  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  22 
 
 
490 aa  72  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0866  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  21.63 
 
 
494 aa  72.4  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  40.78 
 
 
926 aa  71.6  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0076  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.13 
 
 
449 aa  70.1  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00450378  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3531  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  20.94 
 
 
483 aa  69.7  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0729525 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00460  allantoin permease, putative  21.56 
 
 
546 aa  68.6  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5845  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  19.73 
 
 
499 aa  68.2  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149577 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1110  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  20.9 
 
 
494 aa  67.4  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.852121  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2516  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  22.98 
 
 
479 aa  67.8  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.751632  normal  0.0734451 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1871  cytosine/purine/uracil/thiamine/allantoin permease family protein  20.32 
 
 
483 aa  66.6  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3810  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  20.62 
 
 
497 aa  66.6  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2027  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  21.6 
 
 
515 aa  65.9  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4829  hypothetical protein  25.65 
 
 
5185 aa  60.1  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.27186 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2063  pathogenicity protein, putative  34.93 
 
 
630 aa  59.7  0.0000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0230  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  22.54 
 
 
486 aa  57.8  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.239977 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3319  lytic transglycosylase, catalytic  40.76 
 
 
718 aa  55.5  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0472  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.51 
 
 
478 aa  55.1  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2759  3D domain-containing protein  51.59 
 
 
575 aa  54.7  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00579221  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3005  hypothetical protein  44.65 
 
 
570 aa  53.1  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0520915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>