145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1668 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1668  Fe-S metabolism associated SufE  100 
 
 		 137 aa  271  3e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4781  Fe-S metabolism associated SufE  91.79 
 
 		 136 aa  243  9e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1290  Fe-S metabolism associated SufE  85.82 
 
 		 138 aa  226  6e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1307  Fe-S metabolism associated SufE  85.82 
 
 		 138 aa  226  6e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200805  normal  0.160903 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1326  Fe-S metabolism associated SufE  85.82 
 
 		 138 aa  226  6e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13313  hypothetical protein  80.15 
 
 		 143 aa  215  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1033  Fe-S metabolism associated SufE  70.37 
 
 		 144 aa  180  6e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1834  Fe-S metabolism associated SufE  66.67 
 
 		 149 aa  178  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.715701  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1665  Fe-S metabolism associated SufE  55.32 
 
 		 153 aa  140  8e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.336696  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10710  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  55.32 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00761563  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03580  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  51.43 
 
 		 150 aa  134  5e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1658  Fe-S metabolism associated SufE  51.05 
 
 		 155 aa  134  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000451516 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2207  Fe-S metabolism associated SufE  46.04 
 
 		 156 aa  133  9e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2651  Fe-S metabolism associated SufE  51.08 
 
 		 151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3080  Fe-S metabolism associated SufE  47.83 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0512259 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0911  Fe-S metabolism associated SufE  49.26 
 
 		 148 aa  122  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.539194  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1339  Fe-S metabolism associated SufE  44.53 
 
 		 145 aa  121  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.195194 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2300  Fe-S metabolism associated SufE  44.53 
 
 		 146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0025  Fe-S metabolism associated SufE  48.15 
 
 		 139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0021  Fe-S metabolism associated SufE  46.81 
 
 		 142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16610  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  45.99 
 
 		 167 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0718  Fe-S metabolism associated SufE  41.48 
 
 		 150 aa  110  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0436027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0313  Fe-S metabolism associated SufE  40 
 
 		 152 aa  104  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0231969 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0984  Fe-S metabolism associated SufE  42.28 
 
 		 145 aa  93.2  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.976198  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2220  Fe-S metabolism associated SufE  42.11 
 
 		 146 aa  87  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00317725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1885  Fe-S metabolism associated SufE  34.4 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0116695  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0997  hypothetical protein  31.06 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3351  Fe-S metabolism associated SufE  32.54 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04475  hypothetical protein  27.61 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2685  Fe-S metabolism associated SufE  31.58 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3475  cysteine desulfuration protein SufE  34.06 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00677521  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0163  Fe-S metabolism associated SufE  31.78 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000342799  unclonable  8.26296e-16 
 
 
-
 
NC_004310  BR0574  hypothetical protein  31.3 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0575  hypothetical protein  31.3 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3084  Fe-S metabolism associated SufE  33.04 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0119204 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1334  Fe-S metabolism associated SufE  33.08 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0938  Fe-S metabolism associated SufE  30.4 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00125991  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1091  Fe-S metabolism associated SufE  30.08 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2026  Fe-S metabolism associated SufE  33.04 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.908248  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1625  Fe-S metabolism associated SufE  26.98 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00154018  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1176  Fe-S metabolism associated SufE  29.91 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4443  Fe-S metabolism associated SufE  33.83 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168146  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002692  sulfur acceptor protein SufE for iron-sulfur cluster assembly  27.13 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1526  sufE protein  29.63 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1420  cysteine desulfuration protein SufE  29.32 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0902464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3157  Fe-S metabolism associated SufE  29.66 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_7639  predicted protein  33.04 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03291  hypothetical protein  28.68 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1699  cysteine desufuration protein SufE  28.78 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000746018  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3036  Fe-S metabolism associated SufE  26.67 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.011002 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0689  conserved hypothetical protein, SufE-related protein  26.15 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0170145  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4178  Fe-S metabolism associated SufE  31.3 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259445  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1302  hypothetical protein  26.15 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1777  Fe-S metabolism associated SufE  31.09 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0862185  normal  0.039925 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4443  Fe-S metabolism associated SufE  23.88 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0424  cysteine desulfuration protein SufE  25.76 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.617411  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3953  Fe-S metabolism associated SufE  24.44 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1897  hypothetical protein  27.59 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1641  Fe-S metabolism associated SufE  29.77 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.234613  normal  0.31626 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0896  Fe-S metabolism associated SufE  29.31 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0608769  normal  0.19145 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0233  Fe-S metabolism associated SufE  25.81 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3257  Fe-S metabolism associated SufE  29.66 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16920  hypothetical protein  30.3 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.106423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1471  hypothetical protein  31.82 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5927  hypothetical protein  29.92 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3117  cysteine desulfuration protein CsdE  28.83 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000246129  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2061  Fe-S metabolism associated SufE  30.51 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02662  predicted Fe-S metabolism protein  28.57 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0877  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  28.57 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.721288  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1672  Fe-S metabolism associated SufE  29.01 
 
 		 142 aa  51.6  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.398454 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02623  hypothetical protein  28.57 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4076  cysteine desulfuration protein CsdE  28.57 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0951499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2955  cysteine desulfuration protein CsdE  28.57 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000740943  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0766  Fe-S metabolism associated SufE  31.43 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1912  Fe-S metabolism associated SufE  25.55 
 
 		 144 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0901  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  28.57 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3059  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  28.57 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00674257  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2952  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  28.83 
 
 		 147 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0280562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3043  putative sufE-like protein  29.31 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3311  chain A, Northeast Structural Genomic Consortium Target Er75  28.57 
 
 		 147 aa  50.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5783  Fe-S metabolism associated SufE  26.77 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.131653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3211  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  28.57 
 
 		 147 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.416029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3196  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  28.57 
 
 		 147 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.78287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3131  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  28.57 
 
 		 147 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0738734  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3148  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  28.57 
 
 		 147 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0875  Fe-S metabolism associated SufE  25.93 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0629601  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1491  Fe-S metabolism associated SufE  31.01 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2778  hypothetical protein  29.23 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0597  Fe-S metabolism associated SufE  25.37 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.149472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39110  Fe-S metabolism associated SufE  31.58 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000905619  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00356  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  27.13 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.118758  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3517  Fe-S metabolism associated SufE  27.97 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0960536  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0807  Fe-S metabolism associated SufE  29.36 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0734  Fe-S metabolism associated SufE  28.81 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0839  Fe-S metabolism associated SufE  26.67 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1404  Fe-S metabolism associated SufE  27.48 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0249  Fe-S metabolism associated SufE  35.29 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1942  Fe-S metabolism associated SufE  28.33 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0211559  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0853  Fe-S metabolism associated SufE  30.77 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0280  Fe-S metabolism associated SufE  27.59 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>