192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0997 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_0997  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  291  3e-78  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0974  sufE protein  42.86 
 
 
141 aa  123  8.000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0228427  normal  0.828222 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5783  Fe-S metabolism associated SufE  39.85 
 
 
142 aa  119  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.131653  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2026  Fe-S metabolism associated SufE  45.31 
 
 
147 aa  116  7.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.908248  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0163  Fe-S metabolism associated SufE  38.13 
 
 
147 aa  110  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000342799  unclonable  8.26296e-16 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04475  hypothetical protein  36.09 
 
 
141 aa  107  6e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0938  Fe-S metabolism associated SufE  39.06 
 
 
139 aa  107  8.000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00125991  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3036  Fe-S metabolism associated SufE  39.39 
 
 
147 aa  106  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.011002 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1176  Fe-S metabolism associated SufE  35.34 
 
 
141 aa  106  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3351  Fe-S metabolism associated SufE  35.61 
 
 
148 aa  104  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_002950  PG2158  hypothetical protein  36.36 
 
 
141 aa  102  1e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3084  Fe-S metabolism associated SufE  41.67 
 
 
150 aa  99  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0119204 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0896  Fe-S metabolism associated SufE  39.52 
 
 
139 aa  98.2  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0608769  normal  0.19145 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00356  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  40.46 
 
 
145 aa  96.7  9e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.118758  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1625  Fe-S metabolism associated SufE  35.88 
 
 
147 aa  94  6e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00154018  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0882  Fe-S metabolism associated SufE  37.5 
 
 
140 aa  88.2  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000850545  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0310  hypothetical protein  37.1 
 
 
146 aa  86.7  9e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.507041  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0280  Fe-S metabolism associated SufE  37.7 
 
 
146 aa  86.3  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1008  Fe-S metabolism associated SufE  37.01 
 
 
140 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000255666  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1302  hypothetical protein  34.59 
 
 
139 aa  86.3  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1662  Fe-S metabolism associated SufE  36.57 
 
 
138 aa  85.5  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1753  Fe-S metabolism associated SufE  38.89 
 
 
139 aa  85.5  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2732  Fe-S metabolism associated SufE  38.98 
 
 
150 aa  85.9  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1404  Fe-S metabolism associated SufE  34.38 
 
 
140 aa  85.5  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0424  cysteine desulfuration protein SufE  33.07 
 
 
135 aa  85.1  3e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.617411  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1420  cysteine desulfuration protein SufE  32.56 
 
 
144 aa  84.7  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0902464  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1885  Fe-S metabolism associated SufE  35.66 
 
 
136 aa  82.8  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0116695  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1472  cysteine desulfuration protein SufE  32.56 
 
 
140 aa  83.2  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4443  Fe-S metabolism associated SufE  36.22 
 
 
140 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168146  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5125  Fe-S metabolism associated SufE  32.54 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3475  cysteine desulfuration protein SufE  32.31 
 
 
141 aa  82  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00677521  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1672  Fe-S metabolism associated SufE  34.33 
 
 
142 aa  82.4  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.398454 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1236  Fe-S metabolism associated SufE  34.11 
 
 
141 aa  82  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0210251 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3157  Fe-S metabolism associated SufE  31.88 
 
 
152 aa  81.6  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1840  Fe-S metabolism associated SufE  32.28 
 
 
137 aa  81.6  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.757057  normal  0.0307633 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2685  Fe-S metabolism associated SufE  33.85 
 
 
141 aa  81.3  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1912  Fe-S metabolism associated SufE  29.55 
 
 
144 aa  81.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0615  Fe-S metabolism associated SufE  32.82 
 
 
140 aa  80.9  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.606248  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5927  hypothetical protein  34.4 
 
 
151 aa  80.5  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1199  Fe-S metabolism associated SufE  30.95 
 
 
145 aa  80.5  0.000000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4178  Fe-S metabolism associated SufE  34.65 
 
 
142 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259445  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0725  Fe-S metabolism associated SufE  33.33 
 
 
145 aa  80.1  0.000000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0574  hypothetical protein  34.92 
 
 
141 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0575  hypothetical protein  34.92 
 
 
141 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0877  Fe-S metabolism associated SufE  32.56 
 
 
141 aa  80.1  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.264737  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0215  Fe-S metabolism associated SufE  33.07 
 
 
136 aa  78.6  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4099  Fe-S metabolism associated SufE  30.23 
 
 
135 aa  78.6  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2944  Fe-S metabolism associated SufE  34.65 
 
 
149 aa  77  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.970825  normal  0.017638 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1491  Fe-S metabolism associated SufE  33.33 
 
 
139 aa  76.6  0.00000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0469  Fe-S metabolism associated SufE  31.16 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.19684 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1069  Fe-S metabolism associated SufE  29.63 
 
 
164 aa  76.3  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.801847  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3070  Fe-S metabolism associated SufE  32.82 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0924  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  37.96 
 
 
151 aa  76.6  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0457641  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1973  SufE protein  32.06 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0681  Fe-S metabolism associated SufE  32.06 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3224  Fe-S metabolism associated SufE  30.16 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1777  Fe-S metabolism associated SufE  34.11 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0862185  normal  0.039925 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1164  Fe-S metabolism associated SufE  31.2 
 
 
137 aa  74.7  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.656319  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3953  Fe-S metabolism associated SufE  27.69 
 
 
146 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0875  Fe-S metabolism associated SufE  28.68 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0629601  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1641  Fe-S metabolism associated SufE  31.01 
 
 
141 aa  73.9  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.234613  normal  0.31626 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0734  Fe-S metabolism associated SufE  36.84 
 
 
150 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03291  hypothetical protein  34.59 
 
 
142 aa  73.6  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_7639  predicted protein  33.04 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3380  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  37.04 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.669606  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3517  Fe-S metabolism associated SufE  31.82 
 
 
142 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0960536  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2625  Fe-S metabolism associated SufE  33.33 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0386264  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002692  sulfur acceptor protein SufE for iron-sulfur cluster assembly  34.11 
 
 
142 aa  72  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3043  putative sufE-like protein  33.08 
 
 
141 aa  72  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0435  Fe-S metabolism associated SufE  30.43 
 
 
142 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.666183 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3181  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  31.48 
 
 
147 aa  72  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.680141  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1942  Fe-S metabolism associated SufE  30.3 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0211559  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4957  Fe-S metabolism associated SufE  31.78 
 
 
142 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000286277 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3257  Fe-S metabolism associated SufE  32.14 
 
 
148 aa  71.2  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01363  Cysteine desulfurase SufE subunit  29.01 
 
 
136 aa  70.9  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.837457  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0893  Fe-S metabolism associated SufE  28.89 
 
 
146 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0743449  normal  0.462935 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0867  Fe-S metabolism associated SufE  28.89 
 
 
146 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0597  Fe-S metabolism associated SufE  30.71 
 
 
133 aa  70.5  0.000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.149472  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1334  Fe-S metabolism associated SufE  31.25 
 
 
135 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2223  Fe-S metabolism associated SufE  31.25 
 
 
142 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.416471  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2061  Fe-S metabolism associated SufE  30.3 
 
 
142 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08891  hypothetical protein  30.36 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1699  cysteine desufuration protein SufE  30.63 
 
 
148 aa  68.6  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000746018  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4443  Fe-S metabolism associated SufE  26.87 
 
 
140 aa  67.8  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1668  Fe-S metabolism associated SufE  31.06 
 
 
137 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0853  Fe-S metabolism associated SufE  34.29 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2445  cysteine desufuration protein SufE  31.36 
 
 
138 aa  67  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.032262  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2747  cysteine desufuration protein SufE  32.2 
 
 
138 aa  67.4  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00745111  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1091  Fe-S metabolism associated SufE  29.37 
 
 
134 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0506  Fe-S metabolism associated SufE  28.57 
 
 
137 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0176221 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1526  sufE protein  30 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4781  Fe-S metabolism associated SufE  29.55 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1897  hypothetical protein  31.82 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2184  cysteine desufuration protein SufE  32.08 
 
 
137 aa  65.1  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000219554  hitchhiker  0.00000283333 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1049  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  27.93 
 
 
146 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3223  hypothetical protein  27.93 
 
 
146 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000637476  normal  0.384907 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3132  Fe-S metabolism associated SufE  34.65 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0997  Fe-S metabolism associated protein  27.93 
 
 
146 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00392215  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0461  cysteine desufuration protein SufE  34.09 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.197192  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_95454  conserved protein probably involved in Fe-S center assembly  32 
 
 
109 aa  63.9  0.0000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>