192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1625 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1625  Fe-S metabolism associated SufE  100 
 
 		 147 aa  309  9e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00154018  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1885  Fe-S metabolism associated SufE  59.84 
 
 		 136 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0116695  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3036  Fe-S metabolism associated SufE  46.32 
 
 		 147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.011002 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1199  Fe-S metabolism associated SufE  50 
 
 		 145 aa  141  3e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2026  Fe-S metabolism associated SufE  51.97 
 
 		 147 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.908248  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00356  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  46.32 
 
 		 145 aa  133  7.000000000000001e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.118758  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0896  Fe-S metabolism associated SufE  50.39 
 
 		 139 aa  131  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0608769  normal  0.19145 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0938  Fe-S metabolism associated SufE  45.8 
 
 		 139 aa  131  3e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00125991  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5783  Fe-S metabolism associated SufE  44.85 
 
 		 142 aa  131  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.131653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3351  Fe-S metabolism associated SufE  44.12 
 
 		 148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1302  hypothetical protein  44.7 
 
 		 139 aa  127  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3084  Fe-S metabolism associated SufE  41.91 
 
 		 150 aa  126  8.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0119204 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0725  Fe-S metabolism associated SufE  44.7 
 
 		 145 aa  126  9.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0974  sufE protein  44.78 
 
 		 141 aa  125  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0228427  normal  0.828222 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1176  Fe-S metabolism associated SufE  42.34 
 
 		 141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2732  Fe-S metabolism associated SufE  46.76 
 
 		 150 aa  124  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04475  hypothetical protein  41.35 
 
 		 141 aa  124  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0310  hypothetical protein  45.19 
 
 		 146 aa  124  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.507041  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0280  Fe-S metabolism associated SufE  45 
 
 		 146 aa  124  5e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2158  hypothetical protein  44.36 
 
 		 141 aa  122  2e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1420  cysteine desulfuration protein SufE  44.09 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0902464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0615  Fe-S metabolism associated SufE  42.42 
 
 		 140 aa  121  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.606248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3517  Fe-S metabolism associated SufE  43.61 
 
 		 142 aa  116  9e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0960536  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3157  Fe-S metabolism associated SufE  44.7 
 
 		 152 aa  115  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3475  cysteine desulfuration protein SufE  44.62 
 
 		 141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00677521  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2061  Fe-S metabolism associated SufE  44.62 
 
 		 142 aa  114  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1942  Fe-S metabolism associated SufE  42.11 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0211559  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1472  cysteine desulfuration protein SufE  42.19 
 
 		 140 aa  111  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0882  Fe-S metabolism associated SufE  39.1 
 
 		 140 aa  110  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000850545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3043  putative sufE-like protein  44.62 
 
 		 141 aa  110  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0877  Fe-S metabolism associated SufE  41.91 
 
 		 141 aa  110  8.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.264737  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_004310  BR0574  hypothetical protein  41.73 
 
 		 141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0163  Fe-S metabolism associated SufE  37.59 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000342799  unclonable  8.26296e-16 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0575  hypothetical protein  41.73 
 
 		 141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2445  cysteine desufuration protein SufE  41.09 
 
 		 138 aa  108  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.032262  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5927  hypothetical protein  40.8 
 
 		 151 aa  108  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1404  Fe-S metabolism associated SufE  42.52 
 
 		 140 aa  107  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1008  Fe-S metabolism associated SufE  39.52 
 
 		 140 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000255666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1777  Fe-S metabolism associated SufE  42.75 
 
 		 164 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0862185  normal  0.039925 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002692  sulfur acceptor protein SufE for iron-sulfur cluster assembly  40.16 
 
 		 142 aa  106  9.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2747  cysteine desufuration protein SufE  40.31 
 
 		 138 aa  106  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00745111  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03291  hypothetical protein  38.4 
 
 		 142 aa  105  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1491  Fe-S metabolism associated SufE  42.75 
 
 		 139 aa  105  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2685  Fe-S metabolism associated SufE  40.16 
 
 		 141 aa  103  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0469  Fe-S metabolism associated SufE  37.98 
 
 		 142 aa  103  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.19684 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4443  Fe-S metabolism associated SufE  36.92 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168146  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4443  Fe-S metabolism associated SufE  39.68 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3953  Fe-S metabolism associated SufE  39.84 
 
 		 146 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1672  Fe-S metabolism associated SufE  36.36 
 
 		 142 aa  101  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.398454 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1699  cysteine desufuration protein SufE  38.4 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000746018  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0435  Fe-S metabolism associated SufE  37.98 
 
 		 142 aa  101  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.666183 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0424  cysteine desulfuration protein SufE  37.04 
 
 		 135 aa  100  5e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.617411  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01363  Cysteine desulfurase SufE subunit  39.23 
 
 		 136 aa  100  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.837457  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1236  Fe-S metabolism associated SufE  36.88 
 
 		 141 aa  100  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0210251 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1662  Fe-S metabolism associated SufE  42.11 
 
 		 138 aa  100  7e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1753  Fe-S metabolism associated SufE  40.71 
 
 		 139 aa  99.8  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0689  conserved hypothetical protein, SufE-related protein  41.44 
 
 		 145 aa  98.6  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0170145  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1897  hypothetical protein  38.03 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2184  cysteine desufuration protein SufE  41.6 
 
 		 137 aa  99  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000219554  hitchhiker  0.00000283333 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1765  cysteine desufuration protein SufE  38.4 
 
 		 138 aa  98.2  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000206434  hitchhiker  0.0000210323 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2223  Fe-S metabolism associated SufE  39.67 
 
 		 142 aa  97.8  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.416471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1487  cysteine desufuration protein SufE  39.2 
 
 		 138 aa  97.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0255513  hitchhiker  0.000000000108827 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1797  cysteine desufuration protein SufE  39.2 
 
 		 138 aa  97.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000335199  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1506  cysteine desufuration protein SufE  39.2 
 
 		 138 aa  97.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000138977 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1968  cysteine desufuration protein SufE  39.2 
 
 		 138 aa  97.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0109106  hitchhiker  0.0000000878422 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1471  cysteine desufuration protein SufE  39.2 
 
 		 138 aa  97.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00486624  normal  0.0737338 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1746  cysteine desufuration protein SufE  38.93 
 
 		 140 aa  97.8  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133663  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4957  Fe-S metabolism associated SufE  38.28 
 
 		 142 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000286277 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2589  cysteine desufuration protein SufE  38.71 
 
 		 140 aa  96.3  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.403656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1852  cysteine desufuration protein SufE  38.71 
 
 		 140 aa  96.3  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000534736  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01648  cysteine desufuration protein SufE  40.17 
 
 		 138 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000768854  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1963  Fe-S metabolism associated SufE  40.17 
 
 		 138 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000464178  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0893  Fe-S metabolism associated SufE  37.1 
 
 		 146 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0743449  normal  0.462935 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1840  Fe-S metabolism associated SufE  36.03 
 
 		 137 aa  95.5  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.757057  normal  0.0307633 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1952  cysteine desufuration protein SufE  40.17 
 
 		 138 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000146804  unclonable  0.00000000819474 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0867  Fe-S metabolism associated SufE  37.1 
 
 		 146 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1517  cysteine desufuration protein SufE  40.17 
 
 		 138 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000018022  hitchhiker  0.000000327732 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01638  hypothetical protein  40.17 
 
 		 138 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000509918  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2393  cysteine desufuration protein SufE  39.32 
 
 		 138 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000216673  hitchhiker  0.0000615703 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1760  cysteine desufuration protein SufE  40.17 
 
 		 138 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000168999  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0875  Fe-S metabolism associated SufE  33.59 
 
 		 144 aa  94.7  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0629601  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1880  cysteine desufuration protein SufE  39.32 
 
 		 138 aa  94.4  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000195157  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2625  Fe-S metabolism associated SufE  38.66 
 
 		 142 aa  94.7  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0386264  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0997  hypothetical protein  35.88 
 
 		 140 aa  94  6e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4099  Fe-S metabolism associated SufE  37.8 
 
 		 135 aa  94  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1641  Fe-S metabolism associated SufE  34.65 
 
 		 141 aa  94  7e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.234613  normal  0.31626 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4178  Fe-S metabolism associated SufE  35.11 
 
 		 142 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259445  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0506  Fe-S metabolism associated SufE  33.86 
 
 		 137 aa  93.2  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0176221 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3380  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  39.52 
 
 		 151 aa  92.8  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.669606  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1895  cysteine desufuration protein SufE  39.32 
 
 		 138 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000720615  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0853  Fe-S metabolism associated SufE  34.13 
 
 		 145 aa  93.2  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3070  Fe-S metabolism associated SufE  38.81 
 
 		 142 aa  92.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0997  Fe-S metabolism associated protein  36.51 
 
 		 146 aa  92  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00392215  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0924  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  39.52 
 
 		 151 aa  91.7  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0457641  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1973  SufE protein  37.8 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0461  cysteine desufuration protein SufE  39.52 
 
 		 144 aa  91.7  3e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.197192  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0681  Fe-S metabolism associated SufE  37.8 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1334  Fe-S metabolism associated SufE  36.75 
 
 		 135 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1049  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  36.51 
 
 		 146 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3223  hypothetical protein  36.51 
 
 		 146 aa  91.3  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000637476  normal  0.384907 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>