178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0974 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0974  sufE protein  100 
 
 		 141 aa  289  9e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0228427  normal  0.828222 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5783  Fe-S metabolism associated SufE  59.29 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.131653  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2158  hypothetical protein  56.2 
 
 		 141 aa  174  3e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04475  hypothetical protein  54.68 
 
 		 141 aa  169  9e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3036  Fe-S metabolism associated SufE  57.78 
 
 		 147 aa  168  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.011002 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0938  Fe-S metabolism associated SufE  59.54 
 
 		 139 aa  167  7e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00125991  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2026  Fe-S metabolism associated SufE  52.24 
 
 		 147 aa  159  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.908248  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1176  Fe-S metabolism associated SufE  50 
 
 		 141 aa  158  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3351  Fe-S metabolism associated SufE  51.45 
 
 		 148 aa  157  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0163  Fe-S metabolism associated SufE  47.55 
 
 		 147 aa  130  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000342799  unclonable  8.26296e-16 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1625  Fe-S metabolism associated SufE  44.78 
 
 		 147 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00154018  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0615  Fe-S metabolism associated SufE  45.38 
 
 		 140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.606248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0997  hypothetical protein  42.86 
 
 		 140 aa  123  8.000000000000001e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3084  Fe-S metabolism associated SufE  42.75 
 
 		 150 aa  120  7e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0119204 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1885  Fe-S metabolism associated SufE  40.16 
 
 		 136 aa  120  8e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0116695  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00356  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  41.41 
 
 		 145 aa  119  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.118758  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1753  Fe-S metabolism associated SufE  47.37 
 
 		 139 aa  119  9.999999999999999e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1302  hypothetical protein  42.75 
 
 		 139 aa  118  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0280  Fe-S metabolism associated SufE  43.9 
 
 		 146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0896  Fe-S metabolism associated SufE  39.42 
 
 		 139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0608769  normal  0.19145 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4099  Fe-S metabolism associated SufE  38.28 
 
 		 135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0310  hypothetical protein  43.8 
 
 		 146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.507041  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0882  Fe-S metabolism associated SufE  45.38 
 
 		 140 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000850545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1420  cysteine desulfuration protein SufE  44.44 
 
 		 144 aa  114  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0902464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2732  Fe-S metabolism associated SufE  42.15 
 
 		 150 aa  112  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01363  Cysteine desulfurase SufE subunit  40.31 
 
 		 136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.837457  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1008  Fe-S metabolism associated SufE  46.03 
 
 		 140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000255666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1404  Fe-S metabolism associated SufE  41.09 
 
 		 140 aa  111  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0875  Fe-S metabolism associated SufE  38.81 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0629601  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1199  Fe-S metabolism associated SufE  36.96 
 
 		 145 aa  106  9.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1942  Fe-S metabolism associated SufE  40.29 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0211559  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3157  Fe-S metabolism associated SufE  40 
 
 		 152 aa  104  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1777  Fe-S metabolism associated SufE  38.93 
 
 		 164 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0862185  normal  0.039925 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5927  hypothetical protein  38.21 
 
 		 151 aa  103  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3475  cysteine desulfuration protein SufE  38.93 
 
 		 141 aa  103  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00677521  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2445  cysteine desufuration protein SufE  36.5 
 
 		 138 aa  102  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.032262  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2747  cysteine desufuration protein SufE  36.5 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00745111  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1641  Fe-S metabolism associated SufE  41.41 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.234613  normal  0.31626 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3070  Fe-S metabolism associated SufE  36.22 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2061  Fe-S metabolism associated SufE  37.96 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3517  Fe-S metabolism associated SufE  39.57 
 
 		 142 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0960536  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0725  Fe-S metabolism associated SufE  39.32 
 
 		 145 aa  101  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1236  Fe-S metabolism associated SufE  37.78 
 
 		 141 aa  101  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0210251 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2685  Fe-S metabolism associated SufE  38.76 
 
 		 141 aa  101  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1491  Fe-S metabolism associated SufE  37.9 
 
 		 139 aa  100  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3043  putative sufE-like protein  38.97 
 
 		 141 aa  100  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0574  hypothetical protein  38.76 
 
 		 141 aa  100  7e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0575  hypothetical protein  38.76 
 
 		 141 aa  100  7e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1672  Fe-S metabolism associated SufE  40.46 
 
 		 142 aa  100  9e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.398454 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1973  SufE protein  33.86 
 
 		 142 aa  99.8  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1472  cysteine desulfuration protein SufE  35.16 
 
 		 140 aa  99.8  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0681  Fe-S metabolism associated SufE  33.86 
 
 		 142 aa  99.8  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1765  cysteine desufuration protein SufE  38.28 
 
 		 138 aa  99.8  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000206434  hitchhiker  0.0000210323 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0877  Fe-S metabolism associated SufE  37.59 
 
 		 141 aa  99.8  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.264737  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1840  Fe-S metabolism associated SufE  35.38 
 
 		 137 aa  99.4  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.757057  normal  0.0307633 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0461  cysteine desufuration protein SufE  38.46 
 
 		 144 aa  98.2  3e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.197192  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2184  cysteine desufuration protein SufE  35.11 
 
 		 137 aa  98.6  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000219554  hitchhiker  0.00000283333 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4443  Fe-S metabolism associated SufE  32.56 
 
 		 140 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168146  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2223  Fe-S metabolism associated SufE  37.59 
 
 		 142 aa  97.1  7e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.416471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03291  hypothetical protein  38.98 
 
 		 142 aa  97.1  8e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0424  cysteine desulfuration protein SufE  34.38 
 
 		 135 aa  96.7  1e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.617411  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2625  Fe-S metabolism associated SufE  39.69 
 
 		 142 aa  95.9  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0386264  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4178  Fe-S metabolism associated SufE  35.66 
 
 		 142 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259445  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1487  cysteine desufuration protein SufE  35.16 
 
 		 138 aa  94.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0255513  hitchhiker  0.000000000108827 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1797  cysteine desufuration protein SufE  35.16 
 
 		 138 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000335199  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1968  cysteine desufuration protein SufE  35.16 
 
 		 138 aa  94.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0109106  hitchhiker  0.0000000878422 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1506  cysteine desufuration protein SufE  35.16 
 
 		 138 aa  94.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000138977 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1471  cysteine desufuration protein SufE  35.16 
 
 		 138 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00486624  normal  0.0737338 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002692  sulfur acceptor protein SufE for iron-sulfur cluster assembly  36.59 
 
 		 142 aa  94  7e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1069  Fe-S metabolism associated SufE  31.69 
 
 		 164 aa  94  7e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.801847  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1699  cysteine desufuration protein SufE  35.71 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000746018  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0597  Fe-S metabolism associated SufE  35.77 
 
 		 133 aa  92.4  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.149472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1662  Fe-S metabolism associated SufE  32.12 
 
 		 138 aa  92.4  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1350  Fe-S metabolism associated SufE  39.06 
 
 		 141 aa  92  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.590476  unclonable  0.00000000000311985 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1746  cysteine desufuration protein SufE  36.8 
 
 		 140 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133663  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1852  cysteine desufuration protein SufE  36.8 
 
 		 140 aa  90.9  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000534736  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2589  cysteine desufuration protein SufE  36.8 
 
 		 140 aa  90.9  5e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.403656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0506  Fe-S metabolism associated SufE  33.59 
 
 		 137 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0176221 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0469  Fe-S metabolism associated SufE  34.81 
 
 		 142 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.19684 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0853  Fe-S metabolism associated SufE  36.8 
 
 		 145 aa  90.1  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0435  Fe-S metabolism associated SufE  34.07 
 
 		 142 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.666183 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3508  Fe-S metabolism associated SufE  38.1 
 
 		 148 aa  87.4  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3576  Fe-S metabolism associated SufE  37.7 
 
 		 148 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3699  Fe-S metabolism associated SufE  37.7 
 
 		 148 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.486429 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1895  cysteine desufuration protein SufE  37.19 
 
 		 138 aa  87  8e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000720615  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01648  cysteine desufuration protein SufE  37.19 
 
 		 138 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000768854  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0689  conserved hypothetical protein, SufE-related protein  38.74 
 
 		 145 aa  86.3  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0170145  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1963  Fe-S metabolism associated SufE  37.19 
 
 		 138 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000464178  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1952  cysteine desufuration protein SufE  37.19 
 
 		 138 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000146804  unclonable  0.00000000819474 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1517  cysteine desufuration protein SufE  37.19 
 
 		 138 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000018022  hitchhiker  0.000000327732 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0858  Fe-S metabolism associated SufE  35.16 
 
 		 146 aa  86.7  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01638  hypothetical protein  37.19 
 
 		 138 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000509918  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1760  cysteine desufuration protein SufE  37.19 
 
 		 138 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000168999  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0705  SufE protein  30.71 
 
 		 147 aa  85.9  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4443  Fe-S metabolism associated SufE  36.15 
 
 		 140 aa  85.9  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0734  Fe-S metabolism associated SufE  36.84 
 
 		 150 aa  85.9  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0839  Fe-S metabolism associated SufE  34.15 
 
 		 148 aa  85.5  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2393  cysteine desufuration protein SufE  36.36 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000216673  hitchhiker  0.0000615703 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3182  Fe-S metabolism associated SufE  33.59 
 
 		 151 aa  85.1  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0742  Fe-S metabolism associated SufE  37.3 
 
 		 148 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>