198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3953 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3953  Fe-S metabolism associated SufE  100 
 
 		 146 aa  302  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0867  Fe-S metabolism associated SufE  82.88 
 
 		 146 aa  254  4e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0893  Fe-S metabolism associated SufE  82.88 
 
 		 146 aa  254  4e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0743449  normal  0.462935 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4443  Fe-S metabolism associated SufE  79.39 
 
 		 140 aa  214  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3224  Fe-S metabolism associated SufE  67.61 
 
 		 144 aa  208  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5125  Fe-S metabolism associated SufE  66.2 
 
 		 144 aa  200  4e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1912  Fe-S metabolism associated SufE  56.74 
 
 		 144 aa  177  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0705  SufE protein  52.76 
 
 		 147 aa  151  2e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1956  SufE protein  53.17 
 
 		 140 aa  150  4e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08891  hypothetical protein  51.59 
 
 		 153 aa  146  9e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11391  hypothetical protein  52.38 
 
 		 175 aa  143  8.000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.947878 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11571  hypothetical protein  52.31 
 
 		 138 aa  142  1e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11581  hypothetical protein  52.31 
 
 		 139 aa  142  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.561776  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1063  hypothetical protein  51.54 
 
 		 139 aa  141  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11431  hypothetical protein  50 
 
 		 141 aa  137  7e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.266355  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0701  hypothetical protein  48.82 
 
 		 154 aa  131  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15351  hypothetical protein  49.61 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_7639  predicted protein  48.33 
 
 		 124 aa  118  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2026  Fe-S metabolism associated SufE  37.8 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.908248  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2158  hypothetical protein  38.93 
 
 		 141 aa  104  4e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1625  Fe-S metabolism associated SufE  39.84 
 
 		 147 aa  101  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00154018  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3036  Fe-S metabolism associated SufE  38.06 
 
 		 147 aa  101  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.011002 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04475  hypothetical protein  34.56 
 
 		 141 aa  99  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_95454  conserved protein probably involved in Fe-S center assembly  48.31 
 
 		 109 aa  97.8  4e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1334  Fe-S metabolism associated SufE  33.85 
 
 		 135 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1091  Fe-S metabolism associated SufE  34.09 
 
 		 134 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3043  putative sufE-like protein  35.61 
 
 		 141 aa  92.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0313  Fe-S metabolism associated SufE  35.21 
 
 		 152 aa  92.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0231969 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1176  Fe-S metabolism associated SufE  34.38 
 
 		 141 aa  92  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2445  cysteine desufuration protein SufE  35.07 
 
 		 138 aa  90.5  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.032262  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0877  Fe-S metabolism associated SufE  35.34 
 
 		 141 aa  90.9  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.264737  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5927  hypothetical protein  35.94 
 
 		 151 aa  90.5  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2061  Fe-S metabolism associated SufE  35.34 
 
 		 142 aa  90.1  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1526  sufE protein  33.59 
 
 		 135 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3517  Fe-S metabolism associated SufE  34.85 
 
 		 142 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0960536  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1942  Fe-S metabolism associated SufE  36.09 
 
 		 143 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0211559  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3351  Fe-S metabolism associated SufE  31.78 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1404  Fe-S metabolism associated SufE  36.15 
 
 		 140 aa  88.2  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1852  cysteine desufuration protein SufE  36.15 
 
 		 140 aa  87.4  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000534736  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2589  cysteine desufuration protein SufE  36.15 
 
 		 140 aa  87.4  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.403656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1199  Fe-S metabolism associated SufE  32.54 
 
 		 145 aa  87.4  6e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1777  Fe-S metabolism associated SufE  34.09 
 
 		 164 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0862185  normal  0.039925 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5783  Fe-S metabolism associated SufE  34.11 
 
 		 142 aa  87  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.131653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1746  cysteine desufuration protein SufE  35.38 
 
 		 140 aa  87  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133663  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2747  cysteine desufuration protein SufE  33.58 
 
 		 138 aa  86.7  9e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00745111  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1420  cysteine desulfuration protein SufE  34.53 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0902464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0896  Fe-S metabolism associated SufE  31.3 
 
 		 139 aa  86.7  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0608769  normal  0.19145 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0938  Fe-S metabolism associated SufE  36.59 
 
 		 139 aa  86.3  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00125991  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16920  hypothetical protein  31.62 
 
 		 140 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.106423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0718  Fe-S metabolism associated SufE  32.39 
 
 		 150 aa  85.5  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0436027  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2300  Fe-S metabolism associated SufE  33.09 
 
 		 146 aa  84.7  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1885  Fe-S metabolism associated SufE  33.86 
 
 		 136 aa  84.3  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0116695  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1471  hypothetical protein  31.34 
 
 		 140 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03291  hypothetical protein  36.43 
 
 		 142 aa  84.3  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0974  sufE protein  34.11 
 
 		 141 aa  84  7e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0228427  normal  0.828222 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0435  Fe-S metabolism associated SufE  34.31 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.666183 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0875  Fe-S metabolism associated SufE  32.59 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0629601  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1302  hypothetical protein  33.59 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1897  hypothetical protein  34.88 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0469  Fe-S metabolism associated SufE  34.31 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.19684 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3084  Fe-S metabolism associated SufE  34.21 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0119204 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00356  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  30.5 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.118758  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0163  Fe-S metabolism associated SufE  33.33 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000342799  unclonable  8.26296e-16 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3157  Fe-S metabolism associated SufE  34.65 
 
 		 152 aa  81.3  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1641  Fe-S metabolism associated SufE  35.11 
 
 		 141 aa  80.9  0.000000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.234613  normal  0.31626 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1472  cysteine desulfuration protein SufE  33.07 
 
 		 140 aa  80.1  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3475  cysteine desulfuration protein SufE  34.35 
 
 		 141 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00677521  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2685  Fe-S metabolism associated SufE  32.06 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002692  sulfur acceptor protein SufE for iron-sulfur cluster assembly  35.48 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1765  cysteine desufuration protein SufE  33.59 
 
 		 138 aa  79.3  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000206434  hitchhiker  0.0000210323 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0997  Fe-S metabolism associated protein  32.8 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00392215  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3223  hypothetical protein  32.8 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000637476  normal  0.384907 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1049  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  32.8 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01648  cysteine desufuration protein SufE  34.15 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000768854  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0310  hypothetical protein  29.75 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.507041  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1963  Fe-S metabolism associated SufE  34.15 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000464178  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1952  cysteine desufuration protein SufE  34.15 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000146804  unclonable  0.00000000819474 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2223  Fe-S metabolism associated SufE  32.56 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.416471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01363  Cysteine desulfurase SufE subunit  31.78 
 
 		 136 aa  77.8  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.837457  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1517  cysteine desufuration protein SufE  34.15 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000018022  hitchhiker  0.000000327732 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0424  cysteine desulfuration protein SufE  31.54 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.617411  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01638  hypothetical protein  34.15 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000509918  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1760  cysteine desufuration protein SufE  34.15 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000168999  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1487  cysteine desufuration protein SufE  32.06 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0255513  hitchhiker  0.000000000108827 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1968  cysteine desufuration protein SufE  32.06 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0109106  hitchhiker  0.0000000878422 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1491  Fe-S metabolism associated SufE  33.08 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1506  cysteine desufuration protein SufE  32.06 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000138977 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2732  Fe-S metabolism associated SufE  32.46 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1797  cysteine desufuration protein SufE  32.06 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000335199  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1471  cysteine desufuration protein SufE  32.06 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00486624  normal  0.0737338 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2393  cysteine desufuration protein SufE  33.33 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000216673  hitchhiker  0.0000615703 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4178  Fe-S metabolism associated SufE  34.56 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259445  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0280  Fe-S metabolism associated SufE  29.75 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0882  Fe-S metabolism associated SufE  32.33 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000850545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1672  Fe-S metabolism associated SufE  33.83 
 
 		 142 aa  76.6  0.00000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.398454 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1699  cysteine desufuration protein SufE  32.82 
 
 		 148 aa  77  0.00000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000746018  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1895  cysteine desufuration protein SufE  34.15 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000720615  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1880  cysteine desufuration protein SufE  33.33 
 
 		 138 aa  76.6  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000195157  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0575  hypothetical protein  31.3 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4196  Fe-S metabolism associated SufE  34.09 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.583299  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>