178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_11431 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_11431  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  285  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.266355  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1063  hypothetical protein  82.73 
 
 		 139 aa  229  6e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11571  hypothetical protein  84.21 
 
 		 138 aa  226  1e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11581  hypothetical protein  79.86 
 
 		 139 aa  221  3e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.561776  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15351  hypothetical protein  59.2 
 
 		 154 aa  161  3e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0701  hypothetical protein  58.4 
 
 		 154 aa  159  1e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11391  hypothetical protein  60.61 
 
 		 175 aa  159  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.947878 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0705  SufE protein  56.25 
 
 		 147 aa  154  3e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1956  SufE protein  54.96 
 
 		 140 aa  151  2e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08891  hypothetical protein  53.49 
 
 		 153 aa  152  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0867  Fe-S metabolism associated SufE  52.76 
 
 		 146 aa  138  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0893  Fe-S metabolism associated SufE  52.76 
 
 		 146 aa  138  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0743449  normal  0.462935 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3953  Fe-S metabolism associated SufE  50 
 
 		 146 aa  137  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3224  Fe-S metabolism associated SufE  50.79 
 
 		 144 aa  132  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1912  Fe-S metabolism associated SufE  48.84 
 
 		 144 aa  132  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5125  Fe-S metabolism associated SufE  49.21 
 
 		 144 aa  129  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4443  Fe-S metabolism associated SufE  51.22 
 
 		 140 aa  127  7.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2026  Fe-S metabolism associated SufE  35.25 
 
 		 147 aa  97.1  8e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.908248  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_7639  predicted protein  42.62 
 
 		 124 aa  94.4  4e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3036  Fe-S metabolism associated SufE  42.73 
 
 		 147 aa  93.6  8e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.011002 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04475  hypothetical protein  36.29 
 
 		 141 aa  91.7  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2158  hypothetical protein  34.4 
 
 		 141 aa  89.4  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_95454  conserved protein probably involved in Fe-S center assembly  44.44 
 
 		 109 aa  88.6  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0938  Fe-S metabolism associated SufE  34.13 
 
 		 139 aa  87  9e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00125991  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3351  Fe-S metabolism associated SufE  39.81 
 
 		 148 aa  85.1  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1625  Fe-S metabolism associated SufE  32.35 
 
 		 147 aa  84  6e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00154018  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1199  Fe-S metabolism associated SufE  32.73 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1885  Fe-S metabolism associated SufE  34.55 
 
 		 136 aa  79  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0116695  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0974  sufE protein  34.19 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0228427  normal  0.828222 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1176  Fe-S metabolism associated SufE  33.05 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0877  Fe-S metabolism associated SufE  35.9 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.264737  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1420  cysteine desulfuration protein SufE  31.58 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0902464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3084  Fe-S metabolism associated SufE  31.97 
 
 		 150 aa  73.9  0.0000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0119204 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2184  cysteine desufuration protein SufE  34.78 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000219554  hitchhiker  0.00000283333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5783  Fe-S metabolism associated SufE  33.93 
 
 		 142 aa  72  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.131653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1746  cysteine desufuration protein SufE  33.33 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133663  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3043  putative sufE-like protein  32.5 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2061  Fe-S metabolism associated SufE  32.23 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1753  Fe-S metabolism associated SufE  33.64 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01363  Cysteine desulfurase SufE subunit  30.89 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.837457  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2589  cysteine desufuration protein SufE  35.92 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.403656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1852  cysteine desufuration protein SufE  35.92 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000534736  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5927  hypothetical protein  35.14 
 
 		 151 aa  67  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2685  Fe-S metabolism associated SufE  33.33 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0725  Fe-S metabolism associated SufE  31.78 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1765  cysteine desufuration protein SufE  34.21 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000206434  hitchhiker  0.0000210323 
 
 
-
 
NC_004310  BR0574  hypothetical protein  32.46 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1777  Fe-S metabolism associated SufE  28.93 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0862185  normal  0.039925 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1472  cysteine desulfuration protein SufE  29.27 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3157  Fe-S metabolism associated SufE  31.62 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0575  hypothetical protein  32.46 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2393  cysteine desufuration protein SufE  36.89 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000216673  hitchhiker  0.0000615703 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1895  cysteine desufuration protein SufE  35.92 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000720615  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01648  cysteine desufuration protein SufE  35.92 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000768854  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1963  Fe-S metabolism associated SufE  35.92 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000464178  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1942  Fe-S metabolism associated SufE  29.75 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0211559  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01638  hypothetical protein  35.92 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000509918  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0896  Fe-S metabolism associated SufE  25.74 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0608769  normal  0.19145 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4099  Fe-S metabolism associated SufE  28.32 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1517  cysteine desufuration protein SufE  35.92 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000018022  hitchhiker  0.000000327732 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1897  hypothetical protein  30 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1952  cysteine desufuration protein SufE  35.92 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000146804  unclonable  0.00000000819474 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1404  Fe-S metabolism associated SufE  32.06 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1760  cysteine desufuration protein SufE  35.92 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000168999  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2445  cysteine desufuration protein SufE  34.17 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.032262  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0853  Fe-S metabolism associated SufE  29.17 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0766  Fe-S metabolism associated SufE  30.33 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1091  Fe-S metabolism associated SufE  25.98 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0615  Fe-S metabolism associated SufE  32.5 
 
 		 140 aa  62  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.606248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4443  Fe-S metabolism associated SufE  33.04 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168146  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0875  Fe-S metabolism associated SufE  30.08 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0629601  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1880  cysteine desufuration protein SufE  34.95 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000195157  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2747  cysteine desufuration protein SufE  33.33 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00745111  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1302  hypothetical protein  33.05 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1236  Fe-S metabolism associated SufE  30.15 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0210251 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3508  Fe-S metabolism associated SufE  31.58 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0742  Fe-S metabolism associated SufE  31.58 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3576  Fe-S metabolism associated SufE  31.58 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0163  Fe-S metabolism associated SufE  32.17 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000342799  unclonable  8.26296e-16 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0424  cysteine desulfuration protein SufE  29.77 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.617411  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3699  Fe-S metabolism associated SufE  31.58 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.486429 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4178  Fe-S metabolism associated SufE  32.76 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259445  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1487  cysteine desufuration protein SufE  32.14 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0255513  hitchhiker  0.000000000108827 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1506  cysteine desufuration protein SufE  32.14 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000138977 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1968  cysteine desufuration protein SufE  32.14 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0109106  hitchhiker  0.0000000878422 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0839  Fe-S metabolism associated SufE  33.33 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3475  cysteine desulfuration protein SufE  30.43 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00677521  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1797  cysteine desufuration protein SufE  32.14 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000335199  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1471  cysteine desufuration protein SufE  32.14 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00486624  normal  0.0737338 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3517  Fe-S metabolism associated SufE  28.1 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0960536  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0469  Fe-S metabolism associated SufE  26.56 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.19684 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0734  Fe-S metabolism associated SufE  33.33 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1672  Fe-S metabolism associated SufE  30.17 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.398454 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2223  Fe-S metabolism associated SufE  31.43 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.416471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3132  Fe-S metabolism associated SufE  27.68 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2732  Fe-S metabolism associated SufE  27.83 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0310  hypothetical protein  28.18 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.507041  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0997  hypothetical protein  28.69 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0280  Fe-S metabolism associated SufE  29.13 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2625  Fe-S metabolism associated SufE  31.19 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0386264  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>