190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1420 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_1420  cysteine desulfuration protein SufE  100 
 
 
144 aa  295  1e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0902464  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01363  Cysteine desulfurase SufE subunit  55.38 
 
 
136 aa  152  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.837457  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002692  sulfur acceptor protein SufE for iron-sulfur cluster assembly  52.27 
 
 
142 aa  148  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3157  Fe-S metabolism associated SufE  47.59 
 
 
152 aa  146  8e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03291  hypothetical protein  50.37 
 
 
142 aa  145  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0689  conserved hypothetical protein, SufE-related protein  42.55 
 
 
145 aa  137  3.9999999999999997e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0170145  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1350  Fe-S metabolism associated SufE  57.78 
 
 
141 aa  134  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.590476  unclonable  0.00000000000311985 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1897  hypothetical protein  44.06 
 
 
144 aa  133  7.000000000000001e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2685  Fe-S metabolism associated SufE  49.25 
 
 
141 aa  133  8e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1176  Fe-S metabolism associated SufE  48.03 
 
 
141 aa  131  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04475  hypothetical protein  46.03 
 
 
141 aa  130  7.999999999999999e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0574  hypothetical protein  47.76 
 
 
141 aa  129  9e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0575  hypothetical protein  47.76 
 
 
141 aa  129  9e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1885  Fe-S metabolism associated SufE  48.8 
 
 
136 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0116695  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3351  Fe-S metabolism associated SufE  47.62 
 
 
148 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0938  Fe-S metabolism associated SufE  44.8 
 
 
139 aa  126  1.0000000000000001e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00125991  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3475  cysteine desulfuration protein SufE  44.03 
 
 
141 aa  125  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00677521  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0875  Fe-S metabolism associated SufE  47.69 
 
 
144 aa  124  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0629601  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1302  hypothetical protein  45.86 
 
 
139 aa  123  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1672  Fe-S metabolism associated SufE  44.12 
 
 
142 aa  123  7e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.398454 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2026  Fe-S metabolism associated SufE  43.31 
 
 
147 aa  123  9e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.908248  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0615  Fe-S metabolism associated SufE  45.8 
 
 
140 aa  123  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.606248  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1625  Fe-S metabolism associated SufE  44.09 
 
 
147 aa  122  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00154018  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4099  Fe-S metabolism associated SufE  46.09 
 
 
135 aa  120  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0853  Fe-S metabolism associated SufE  43.45 
 
 
145 aa  120  7e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3036  Fe-S metabolism associated SufE  42.4 
 
 
147 aa  120  9e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.011002 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3084  Fe-S metabolism associated SufE  42.47 
 
 
150 aa  119  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0119204 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2211  putative selenocysteine lyase  44.09 
 
 
569 aa  118  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.686434  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0896  Fe-S metabolism associated SufE  42.06 
 
 
139 aa  118  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0608769  normal  0.19145 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1199  Fe-S metabolism associated SufE  44.85 
 
 
145 aa  118  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3043  putative sufE-like protein  42.75 
 
 
141 aa  118  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0858  Fe-S metabolism associated SufE  40.85 
 
 
146 aa  118  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1472  cysteine desulfuration protein SufE  43.75 
 
 
140 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1069  Fe-S metabolism associated SufE  43.08 
 
 
164 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.801847  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5783  Fe-S metabolism associated SufE  39.52 
 
 
142 aa  117  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.131653  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1973  SufE protein  44.62 
 
 
142 aa  117  6e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0681  Fe-S metabolism associated SufE  44.62 
 
 
142 aa  117  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0882  Fe-S metabolism associated SufE  44.09 
 
 
140 aa  116  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000850545  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0424  cysteine desulfuration protein SufE  42.31 
 
 
135 aa  116  9e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.617411  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1404  Fe-S metabolism associated SufE  42.22 
 
 
140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1641  Fe-S metabolism associated SufE  42.19 
 
 
141 aa  114  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.234613  normal  0.31626 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1008  Fe-S metabolism associated SufE  44.44 
 
 
140 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000255666  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2158  hypothetical protein  43.65 
 
 
141 aa  114  3.9999999999999997e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0766  Fe-S metabolism associated SufE  50 
 
 
148 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0877  Fe-S metabolism associated SufE  42.86 
 
 
141 aa  114  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.264737  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2061  Fe-S metabolism associated SufE  41.67 
 
 
142 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0974  sufE protein  44.44 
 
 
141 aa  114  6e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0228427  normal  0.828222 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0734  Fe-S metabolism associated SufE  42.15 
 
 
150 aa  114  6e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1777  Fe-S metabolism associated SufE  41.67 
 
 
164 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0862185  normal  0.039925 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3070  Fe-S metabolism associated SufE  43.08 
 
 
142 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3182  Fe-S metabolism associated SufE  41.46 
 
 
151 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3223  hypothetical protein  38.85 
 
 
146 aa  112  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000637476  normal  0.384907 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1049  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  38.85 
 
 
146 aa  112  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0725  Fe-S metabolism associated SufE  45.97 
 
 
145 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3517  Fe-S metabolism associated SufE  40.44 
 
 
142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0960536  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1840  Fe-S metabolism associated SufE  47.24 
 
 
137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.757057  normal  0.0307633 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00356  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  41.67 
 
 
145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.118758  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1942  Fe-S metabolism associated SufE  40.46 
 
 
143 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0211559  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1765  cysteine desufuration protein SufE  41.73 
 
 
138 aa  111  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000206434  hitchhiker  0.0000210323 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0997  Fe-S metabolism associated protein  38.13 
 
 
146 aa  111  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00392215  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3059  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  41.61 
 
 
147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00674257  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02662  predicted Fe-S metabolism protein  41.79 
 
 
147 aa  110  5e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0877  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  41.79 
 
 
147 aa  110  5e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.721288  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02623  hypothetical protein  41.79 
 
 
147 aa  110  5e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0901  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  41.79 
 
 
147 aa  110  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0752  Fe-S metabolism associated SufE  41.22 
 
 
147 aa  110  5e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1491  Fe-S metabolism associated SufE  39.69 
 
 
139 aa  110  5e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4076  cysteine desulfuration protein CsdE  41.79 
 
 
147 aa  110  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0951499  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2952  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  40.88 
 
 
147 aa  110  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0280562  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2955  cysteine desulfuration protein CsdE  41.79 
 
 
147 aa  110  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000740943  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2223  Fe-S metabolism associated SufE  41.54 
 
 
142 aa  110  6e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.416471  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4443  Fe-S metabolism associated SufE  39.37 
 
 
140 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168146  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3117  cysteine desulfuration protein CsdE  40.88 
 
 
147 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000246129  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1334  Fe-S metabolism associated SufE  35.94 
 
 
135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2625  Fe-S metabolism associated SufE  43.75 
 
 
142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0386264  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0310  hypothetical protein  43.55 
 
 
146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.507041  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3132  Fe-S metabolism associated SufE  40.71 
 
 
147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0280  Fe-S metabolism associated SufE  44.35 
 
 
146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5927  hypothetical protein  41.86 
 
 
151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3699  Fe-S metabolism associated SufE  43.44 
 
 
148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.486429 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3576  Fe-S metabolism associated SufE  43.44 
 
 
148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0835  Fe-S metabolism associated SufE  43.2 
 
 
147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1699  cysteine desufuration protein SufE  38.93 
 
 
148 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000746018  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2445  cysteine desufuration protein SufE  38.46 
 
 
138 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.032262  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2747  cysteine desufuration protein SufE  37.69 
 
 
138 aa  106  8.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00745111  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2589  cysteine desufuration protein SufE  37.9 
 
 
140 aa  106  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.403656  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2732  Fe-S metabolism associated SufE  44.63 
 
 
150 aa  106  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0807  Fe-S metabolism associated SufE  44.14 
 
 
147 aa  106  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1662  Fe-S metabolism associated SufE  41.41 
 
 
138 aa  106  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1852  cysteine desufuration protein SufE  37.9 
 
 
140 aa  106  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000534736  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3257  Fe-S metabolism associated SufE  38.03 
 
 
148 aa  106  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1526  sufE protein  36.92 
 
 
135 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1753  Fe-S metabolism associated SufE  44.74 
 
 
139 aa  105  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3508  Fe-S metabolism associated SufE  42.31 
 
 
148 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0839  Fe-S metabolism associated SufE  44.35 
 
 
148 aa  105  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1746  cysteine desufuration protein SufE  37.9 
 
 
140 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133663  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2184  cysteine desufuration protein SufE  39.37 
 
 
137 aa  105  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000219554  hitchhiker  0.00000283333 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3808  Fe-S metabolism associated SufE  38.3 
 
 
144 aa  104  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000105316  hitchhiker  0.000000411108 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0597  Fe-S metabolism associated SufE  39.37 
 
 
133 aa  103  7e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.149472  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1471  cysteine desufuration protein SufE  37.8 
 
 
138 aa  103  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00486624  normal  0.0737338 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>