191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3351 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3351  Fe-S metabolism associated SufE  100 
 
 		 148 aa  306  9e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0938  Fe-S metabolism associated SufE  63.16 
 
 		 139 aa  187  4e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00125991  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04475  hypothetical protein  57.66 
 
 		 141 aa  186  1e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1176  Fe-S metabolism associated SufE  58.16 
 
 		 141 aa  186  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5783  Fe-S metabolism associated SufE  56.83 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.131653  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2158  hypothetical protein  48.53 
 
 		 141 aa  159  1e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0974  sufE protein  51.45 
 
 		 141 aa  157  3e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0228427  normal  0.828222 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2026  Fe-S metabolism associated SufE  48.57 
 
 		 147 aa  157  6e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.908248  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3036  Fe-S metabolism associated SufE  52.59 
 
 		 147 aa  153  6e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.011002 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1885  Fe-S metabolism associated SufE  43.8 
 
 		 136 aa  135  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0116695  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1753  Fe-S metabolism associated SufE  52.63 
 
 		 139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1420  cysteine desulfuration protein SufE  47.62 
 
 		 144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0902464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1625  Fe-S metabolism associated SufE  44.12 
 
 		 147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00154018  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0163  Fe-S metabolism associated SufE  40.14 
 
 		 147 aa  124  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000342799  unclonable  8.26296e-16 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0896  Fe-S metabolism associated SufE  44.36 
 
 		 139 aa  121  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0608769  normal  0.19145 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1404  Fe-S metabolism associated SufE  44.09 
 
 		 140 aa  120  8e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0725  Fe-S metabolism associated SufE  43.31 
 
 		 145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00356  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  42.19 
 
 		 145 aa  117  7e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.118758  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0310  hypothetical protein  43.59 
 
 		 146 aa  115  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.507041  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01363  Cysteine desulfurase SufE subunit  40.62 
 
 		 136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.837457  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0280  Fe-S metabolism associated SufE  43.2 
 
 		 146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1302  hypothetical protein  41.98 
 
 		 139 aa  115  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1472  cysteine desulfuration protein SufE  39.85 
 
 		 140 aa  115  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2685  Fe-S metabolism associated SufE  42.64 
 
 		 141 aa  113  6.9999999999999995e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2732  Fe-S metabolism associated SufE  43.8 
 
 		 150 aa  113  8.999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0858  Fe-S metabolism associated SufE  38.81 
 
 		 146 aa  111  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2184  cysteine desufuration protein SufE  39.69 
 
 		 137 aa  111  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000219554  hitchhiker  0.00000283333 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2747  cysteine desufuration protein SufE  39.06 
 
 		 138 aa  110  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00745111  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0877  Fe-S metabolism associated SufE  41.26 
 
 		 141 aa  111  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.264737  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0615  Fe-S metabolism associated SufE  43.31 
 
 		 140 aa  110  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.606248  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0574  hypothetical protein  42.4 
 
 		 141 aa  110  6e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0575  hypothetical protein  42.4 
 
 		 141 aa  110  6e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1672  Fe-S metabolism associated SufE  39.29 
 
 		 142 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.398454 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1746  cysteine desufuration protein SufE  42.06 
 
 		 140 aa  110  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133663  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4099  Fe-S metabolism associated SufE  37.59 
 
 		 135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2589  cysteine desufuration protein SufE  42.06 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.403656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1852  cysteine desufuration protein SufE  42.06 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000534736  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1199  Fe-S metabolism associated SufE  39.02 
 
 		 145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0882  Fe-S metabolism associated SufE  43.31 
 
 		 140 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000850545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3475  cysteine desulfuration protein SufE  42.75 
 
 		 141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00677521  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2445  cysteine desufuration protein SufE  39.06 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.032262  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0875  Fe-S metabolism associated SufE  39.71 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0629601  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3084  Fe-S metabolism associated SufE  40.17 
 
 		 150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0119204 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2061  Fe-S metabolism associated SufE  39.69 
 
 		 142 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1008  Fe-S metabolism associated SufE  43.65 
 
 		 140 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000255666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0853  Fe-S metabolism associated SufE  38.35 
 
 		 145 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1350  Fe-S metabolism associated SufE  42.86 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.590476  unclonable  0.00000000000311985 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3517  Fe-S metabolism associated SufE  38.85 
 
 		 142 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0960536  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1662  Fe-S metabolism associated SufE  38.24 
 
 		 138 aa  104  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0997  hypothetical protein  35.61 
 
 		 140 aa  104  4e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3070  Fe-S metabolism associated SufE  36.22 
 
 		 142 aa  104  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3182  Fe-S metabolism associated SufE  39.84 
 
 		 151 aa  104  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1942  Fe-S metabolism associated SufE  38.17 
 
 		 143 aa  103  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0211559  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0461  cysteine desufuration protein SufE  39.69 
 
 		 144 aa  103  7e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.197192  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3043  putative sufE-like protein  38.06 
 
 		 141 aa  103  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1973  SufE protein  35.61 
 
 		 142 aa  103  8e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0681  Fe-S metabolism associated SufE  35.61 
 
 		 142 aa  103  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3157  Fe-S metabolism associated SufE  37.59 
 
 		 152 aa  102  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4443  Fe-S metabolism associated SufE  36.51 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168146  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2223  Fe-S metabolism associated SufE  36.22 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.416471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1777  Fe-S metabolism associated SufE  36.3 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0862185  normal  0.039925 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1765  cysteine desufuration protein SufE  36.8 
 
 		 138 aa  101  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000206434  hitchhiker  0.0000210323 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002692  sulfur acceptor protein SufE for iron-sulfur cluster assembly  38.21 
 
 		 142 aa  101  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1069  Fe-S metabolism associated SufE  33.09 
 
 		 164 aa  101  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.801847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0424  cysteine desulfuration protein SufE  37.9 
 
 		 135 aa  100  6e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.617411  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1641  Fe-S metabolism associated SufE  39.23 
 
 		 141 aa  100  7e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.234613  normal  0.31626 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03291  hypothetical protein  39.83 
 
 		 142 aa  100  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5927  hypothetical protein  36.29 
 
 		 151 aa  98.6  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4178  Fe-S metabolism associated SufE  35.71 
 
 		 142 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259445  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0839  Fe-S metabolism associated SufE  39.02 
 
 		 148 aa  97.8  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1491  Fe-S metabolism associated SufE  38.71 
 
 		 139 aa  97.4  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0734  Fe-S metabolism associated SufE  37.72 
 
 		 150 aa  97.4  6e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1699  cysteine desufuration protein SufE  34.92 
 
 		 148 aa  97.4  7e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000746018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2625  Fe-S metabolism associated SufE  38.1 
 
 		 142 aa  97.1  8e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0386264  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0689  conserved hypothetical protein, SufE-related protein  41.07 
 
 		 145 aa  97.1  8e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0170145  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5125  Fe-S metabolism associated SufE  36.15 
 
 		 144 aa  96.7  9e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0469  Fe-S metabolism associated SufE  35.43 
 
 		 142 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.19684 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1236  Fe-S metabolism associated SufE  38.46 
 
 		 141 aa  96.3  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0210251 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1897  hypothetical protein  39.83 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1840  Fe-S metabolism associated SufE  31.78 
 
 		 137 aa  95.5  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.757057  normal  0.0307633 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2211  putative selenocysteine lyase  38.58 
 
 		 569 aa  94.7  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.686434  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0435  Fe-S metabolism associated SufE  34.65 
 
 		 142 aa  94.4  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.666183 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1049  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  33.33 
 
 		 146 aa  93.6  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0506  Fe-S metabolism associated SufE  35.2 
 
 		 137 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0176221 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0997  Fe-S metabolism associated protein  33.33 
 
 		 146 aa  93.2  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00392215  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3223  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  93.2  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000637476  normal  0.384907 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0766  Fe-S metabolism associated SufE  38.02 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3132  Fe-S metabolism associated SufE  36.8 
 
 		 147 aa  92  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01648  cysteine desufuration protein SufE  34.13 
 
 		 138 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000768854  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1963  Fe-S metabolism associated SufE  34.13 
 
 		 138 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000464178  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4443  Fe-S metabolism associated SufE  33.33 
 
 		 140 aa  91.7  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1952  cysteine desufuration protein SufE  34.13 
 
 		 138 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000146804  unclonable  0.00000000819474 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1517  cysteine desufuration protein SufE  34.13 
 
 		 138 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000018022  hitchhiker  0.000000327732 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01638  hypothetical protein  34.13 
 
 		 138 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000509918  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1760  cysteine desufuration protein SufE  34.13 
 
 		 138 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000168999  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2393  cysteine desufuration protein SufE  33.33 
 
 		 138 aa  91.3  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000216673  hitchhiker  0.0000615703 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1895  cysteine desufuration protein SufE  34.13 
 
 		 138 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000720615  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1880  cysteine desufuration protein SufE  33.33 
 
 		 138 aa  90.5  7e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000195157  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0835  Fe-S metabolism associated SufE  36 
 
 		 147 aa  90.1  9e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1334  Fe-S metabolism associated SufE  33.33 
 
 		 135 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0936579 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>