173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1852 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1852  cysteine desufuration protein SufE  100 
 
 		 140 aa  290  4e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000534736  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2589  cysteine desufuration protein SufE  100 
 
 		 140 aa  290  4e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.403656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1746  cysteine desufuration protein SufE  98.57 
 
 		 140 aa  288  3e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133663  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2184  cysteine desufuration protein SufE  74.45 
 
 		 137 aa  219  9e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000219554  hitchhiker  0.00000283333 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1765  cysteine desufuration protein SufE  68.84 
 
 		 138 aa  207  3e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000206434  hitchhiker  0.0000210323 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1797  cysteine desufuration protein SufE  69.57 
 
 		 138 aa  205  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000335199  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1487  cysteine desufuration protein SufE  69.57 
 
 		 138 aa  204  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0255513  hitchhiker  0.000000000108827 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1968  cysteine desufuration protein SufE  69.57 
 
 		 138 aa  204  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0109106  hitchhiker  0.0000000878422 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1471  cysteine desufuration protein SufE  69.57 
 
 		 138 aa  205  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00486624  normal  0.0737338 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1506  cysteine desufuration protein SufE  69.57 
 
 		 138 aa  204  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000138977 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1699  cysteine desufuration protein SufE  64.96 
 
 		 148 aa  196  7e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000746018  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2445  cysteine desufuration protein SufE  67.15 
 
 		 138 aa  191  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.032262  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2747  cysteine desufuration protein SufE  65.69 
 
 		 138 aa  189  8e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00745111  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01648  cysteine desufuration protein SufE  67.46 
 
 		 138 aa  184  4e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000768854  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1963  Fe-S metabolism associated SufE  67.46 
 
 		 138 aa  184  4e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000464178  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1517  cysteine desufuration protein SufE  67.46 
 
 		 138 aa  184  4e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000018022  hitchhiker  0.000000327732 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1952  cysteine desufuration protein SufE  67.46 
 
 		 138 aa  184  4e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000146804  unclonable  0.00000000819474 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01638  hypothetical protein  67.46 
 
 		 138 aa  184  4e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000509918  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1760  cysteine desufuration protein SufE  67.46 
 
 		 138 aa  184  4e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000168999  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2393  cysteine desufuration protein SufE  66.67 
 
 		 138 aa  184  5e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000216673  hitchhiker  0.0000615703 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1895  cysteine desufuration protein SufE  67.46 
 
 		 138 aa  183  8e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000720615  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1880  cysteine desufuration protein SufE  66.67 
 
 		 138 aa  182  9e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000195157  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0461  cysteine desufuration protein SufE  59.12 
 
 		 144 aa  170  6.999999999999999e-42  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.197192  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0877  Fe-S metabolism associated SufE  44.85 
 
 		 141 aa  122  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.264737  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1672  Fe-S metabolism associated SufE  43.07 
 
 		 142 aa  118  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.398454 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3043  putative sufE-like protein  40.62 
 
 		 141 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1641  Fe-S metabolism associated SufE  41.09 
 
 		 141 aa  110  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.234613  normal  0.31626 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1236  Fe-S metabolism associated SufE  41.22 
 
 		 141 aa  110  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0210251 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0896  Fe-S metabolism associated SufE  40.62 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0608769  normal  0.19145 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3351  Fe-S metabolism associated SufE  42.06 
 
 		 148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01363  Cysteine desulfurase SufE subunit  39.06 
 
 		 136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.837457  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5927  hypothetical protein  40.77 
 
 		 151 aa  108  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1404  Fe-S metabolism associated SufE  43.31 
 
 		 140 aa  108  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1302  hypothetical protein  41.91 
 
 		 139 aa  107  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2625  Fe-S metabolism associated SufE  38.71 
 
 		 142 aa  107  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0386264  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1777  Fe-S metabolism associated SufE  39.06 
 
 		 164 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0862185  normal  0.039925 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2061  Fe-S metabolism associated SufE  40.62 
 
 		 142 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2223  Fe-S metabolism associated SufE  39.37 
 
 		 142 aa  106  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.416471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1420  cysteine desulfuration protein SufE  37.9 
 
 		 144 aa  106  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0902464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3517  Fe-S metabolism associated SufE  39.84 
 
 		 142 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0960536  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0424  cysteine desulfuration protein SufE  40 
 
 		 135 aa  105  3e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.617411  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1942  Fe-S metabolism associated SufE  39.06 
 
 		 143 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0211559  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0882  Fe-S metabolism associated SufE  39.53 
 
 		 140 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000850545  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2158  hypothetical protein  40.8 
 
 		 141 aa  103  5e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2685  Fe-S metabolism associated SufE  40.94 
 
 		 141 aa  103  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1973  SufE protein  40 
 
 		 142 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0681  Fe-S metabolism associated SufE  40 
 
 		 142 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3475  cysteine desulfuration protein SufE  39.37 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00677521  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1472  cysteine desulfuration protein SufE  39.84 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5783  Fe-S metabolism associated SufE  41.6 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.131653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3157  Fe-S metabolism associated SufE  39.37 
 
 		 152 aa  101  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1008  Fe-S metabolism associated SufE  39.68 
 
 		 140 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000255666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3070  Fe-S metabolism associated SufE  39.26 
 
 		 142 aa  100  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0938  Fe-S metabolism associated SufE  38.93 
 
 		 139 aa  100  7e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00125991  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0875  Fe-S metabolism associated SufE  36.92 
 
 		 144 aa  99.8  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0629601  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0574  hypothetical protein  39.68 
 
 		 141 aa  99  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0575  hypothetical protein  39.68 
 
 		 141 aa  99  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0615  Fe-S metabolism associated SufE  36.43 
 
 		 140 aa  99.4  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.606248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0435  Fe-S metabolism associated SufE  38.69 
 
 		 142 aa  99  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.666183 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04475  hypothetical protein  35.61 
 
 		 141 aa  98.6  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0469  Fe-S metabolism associated SufE  38.69 
 
 		 142 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.19684 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3036  Fe-S metabolism associated SufE  38.71 
 
 		 147 aa  97.8  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.011002 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4099  Fe-S metabolism associated SufE  37.8 
 
 		 135 aa  97.4  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1625  Fe-S metabolism associated SufE  38.71 
 
 		 147 aa  96.3  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00154018  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1885  Fe-S metabolism associated SufE  40.16 
 
 		 136 aa  96.3  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0116695  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1662  Fe-S metabolism associated SufE  37.5 
 
 		 138 aa  96.3  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1334  Fe-S metabolism associated SufE  35.54 
 
 		 135 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3084  Fe-S metabolism associated SufE  42.15 
 
 		 150 aa  95.5  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0119204 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2026  Fe-S metabolism associated SufE  42.28 
 
 		 147 aa  95.5  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.908248  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4443  Fe-S metabolism associated SufE  37.41 
 
 		 140 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168146  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2211  putative selenocysteine lyase  37.1 
 
 		 569 aa  94.7  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.686434  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1350  Fe-S metabolism associated SufE  38.35 
 
 		 141 aa  94.4  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.590476  unclonable  0.00000000000311985 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0506  Fe-S metabolism associated SufE  34.56 
 
 		 137 aa  94  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0176221 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0689  conserved hypothetical protein, SufE-related protein  37.5 
 
 		 145 aa  93.6  8e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0170145  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0997  Fe-S metabolism associated protein  36.43 
 
 		 146 aa  93.6  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00392215  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3223  hypothetical protein  36.43 
 
 		 146 aa  93.6  9e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000637476  normal  0.384907 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1049  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  36.43 
 
 		 146 aa  93.2  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1840  Fe-S metabolism associated SufE  37.69 
 
 		 137 aa  92.8  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.757057  normal  0.0307633 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1176  Fe-S metabolism associated SufE  34.4 
 
 		 141 aa  93.2  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1491  Fe-S metabolism associated SufE  37.1 
 
 		 139 aa  92  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4178  Fe-S metabolism associated SufE  36.23 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259445  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03291  hypothetical protein  38.26 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1069  Fe-S metabolism associated SufE  34.09 
 
 		 164 aa  91.7  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.801847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1091  Fe-S metabolism associated SufE  35 
 
 		 134 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0974  sufE protein  36.8 
 
 		 141 aa  90.9  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0228427  normal  0.828222 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1199  Fe-S metabolism associated SufE  39.69 
 
 		 145 aa  90.9  5e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1471  hypothetical protein  35.77 
 
 		 140 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3808  Fe-S metabolism associated SufE  38.76 
 
 		 144 aa  90.9  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000105316  hitchhiker  0.000000411108 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16920  hypothetical protein  35.59 
 
 		 140 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.106423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0310  hypothetical protein  38.58 
 
 		 146 aa  88.6  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.507041  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002692  sulfur acceptor protein SufE for iron-sulfur cluster assembly  33.86 
 
 		 142 aa  87.4  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3953  Fe-S metabolism associated SufE  36.15 
 
 		 146 aa  87.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0597  Fe-S metabolism associated SufE  31.01 
 
 		 133 aa  86.7  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.149472  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1526  sufE protein  31.4 
 
 		 135 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0752  Fe-S metabolism associated SufE  39.82 
 
 		 147 aa  85.9  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3182  Fe-S metabolism associated SufE  38.39 
 
 		 151 aa  85.5  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1897  hypothetical protein  37.39 
 
 		 144 aa  85.5  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4957  Fe-S metabolism associated SufE  35 
 
 		 142 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000286277 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0853  Fe-S metabolism associated SufE  35.43 
 
 		 145 aa  85.9  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0280  Fe-S metabolism associated SufE  37.01 
 
 		 146 aa  84.3  5e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>