190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002692 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002692  sulfur acceptor protein SufE for iron-sulfur cluster assembly  100 
 
 		 142 aa  295  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03291  hypothetical protein  94.93 
 
 		 142 aa  277  4e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0689  conserved hypothetical protein, SufE-related protein  66.67 
 
 		 145 aa  202  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0170145  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1897  hypothetical protein  66.67 
 
 		 144 aa  201  3e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1420  cysteine desulfuration protein SufE  52.27 
 
 		 144 aa  148  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0902464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0597  Fe-S metabolism associated SufE  48 
 
 		 133 aa  136  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.149472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0853  Fe-S metabolism associated SufE  48.06 
 
 		 145 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2211  putative selenocysteine lyase  45.16 
 
 		 569 aa  133  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.686434  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3132  Fe-S metabolism associated SufE  45.32 
 
 		 147 aa  130  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0839  Fe-S metabolism associated SufE  48.39 
 
 		 148 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2952  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  45.71 
 
 		 147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0280562  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02662  predicted Fe-S metabolism protein  45.71 
 
 		 147 aa  128  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0877  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  45.71 
 
 		 147 aa  128  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.721288  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02623  hypothetical protein  45.71 
 
 		 147 aa  128  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0901  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  45.71 
 
 		 147 aa  128  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4076  cysteine desulfuration protein CsdE  45.71 
 
 		 147 aa  128  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0951499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1049  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  47.73 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3223  hypothetical protein  47.73 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000637476  normal  0.384907 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2955  cysteine desulfuration protein CsdE  45.71 
 
 		 147 aa  128  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000740943  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3117  cysteine desulfuration protein CsdE  45.71 
 
 		 147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000246129  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0835  Fe-S metabolism associated SufE  44.6 
 
 		 147 aa  128  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0807  Fe-S metabolism associated SufE  46.04 
 
 		 147 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0997  Fe-S metabolism associated protein  46.97 
 
 		 146 aa  127  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00392215  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0924  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  47.73 
 
 		 151 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0457641  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3059  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  45 
 
 		 147 aa  127  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00674257  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3181  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  45.26 
 
 		 147 aa  125  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.680141  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01363  Cysteine desulfurase SufE subunit  48.41 
 
 		 136 aa  126  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.837457  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3380  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  46.21 
 
 		 151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.669606  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3157  Fe-S metabolism associated SufE  44.53 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3311  chain A, Northeast Structural Genomic Consortium Target Er75  45.8 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3196  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  45.04 
 
 		 147 aa  124  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.78287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3211  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  45.04 
 
 		 147 aa  124  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.416029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3131  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  45.04 
 
 		 147 aa  124  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0738734  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3808  Fe-S metabolism associated SufE  46.97 
 
 		 144 aa  124  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000105316  hitchhiker  0.000000411108 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3148  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  45.04 
 
 		 147 aa  124  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0752  Fe-S metabolism associated SufE  48.33 
 
 		 147 aa  123  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3699  Fe-S metabolism associated SufE  46.34 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.486429 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3508  Fe-S metabolism associated SufE  46.34 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3576  Fe-S metabolism associated SufE  46.34 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0858  Fe-S metabolism associated SufE  46.03 
 
 		 146 aa  121  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3790  hypothetical protein  43.88 
 
 		 147 aa  120  5e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0742  Fe-S metabolism associated SufE  45.53 
 
 		 148 aa  120  9e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3182  Fe-S metabolism associated SufE  44.27 
 
 		 151 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3257  Fe-S metabolism associated SufE  41.79 
 
 		 148 aa  119  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1302  hypothetical protein  49.15 
 
 		 139 aa  119  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0766  Fe-S metabolism associated SufE  49.14 
 
 		 148 aa  117  7e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1091  Fe-S metabolism associated SufE  41.73 
 
 		 134 aa  116  9e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3475  cysteine desulfuration protein SufE  43.26 
 
 		 141 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00677521  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1472  cysteine desulfuration protein SufE  46.4 
 
 		 140 aa  116  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1471  hypothetical protein  44.35 
 
 		 140 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16920  hypothetical protein  45.05 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.106423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2685  Fe-S metabolism associated SufE  46.09 
 
 		 141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2778  hypothetical protein  42.34 
 
 		 152 aa  114  5e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1404  Fe-S metabolism associated SufE  43.08 
 
 		 140 aa  114  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0734  Fe-S metabolism associated SufE  42.22 
 
 		 150 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1526  sufE protein  41.6 
 
 		 135 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2997  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  42.4 
 
 		 147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.736409  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0424  cysteine desulfuration protein SufE  41.41 
 
 		 135 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.617411  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0896  Fe-S metabolism associated SufE  44.19 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0608769  normal  0.19145 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0615  Fe-S metabolism associated SufE  46.96 
 
 		 140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.606248  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0574  hypothetical protein  44.88 
 
 		 141 aa  111  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1334  Fe-S metabolism associated SufE  42.98 
 
 		 135 aa  110  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0882  Fe-S metabolism associated SufE  46.55 
 
 		 140 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000850545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0575  hypothetical protein  44.88 
 
 		 141 aa  111  4.0000000000000004e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1008  Fe-S metabolism associated SufE  47.37 
 
 		 140 aa  110  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000255666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1491  Fe-S metabolism associated SufE  44.8 
 
 		 139 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4099  Fe-S metabolism associated SufE  44.72 
 
 		 135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1885  Fe-S metabolism associated SufE  42.98 
 
 		 136 aa  108  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0116695  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3043  putative sufE-like protein  41.54 
 
 		 141 aa  108  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0461  cysteine desufuration protein SufE  37.41 
 
 		 144 aa  107  5e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.197192  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1625  Fe-S metabolism associated SufE  40.16 
 
 		 147 aa  106  9.000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00154018  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5927  hypothetical protein  41.79 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1641  Fe-S metabolism associated SufE  42.64 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.234613  normal  0.31626 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1942  Fe-S metabolism associated SufE  40.46 
 
 		 143 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0211559  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0875  Fe-S metabolism associated SufE  43.86 
 
 		 144 aa  104  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0629601  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1662  Fe-S metabolism associated SufE  44.35 
 
 		 138 aa  104  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1350  Fe-S metabolism associated SufE  49.23 
 
 		 141 aa  104  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.590476  unclonable  0.00000000000311985 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3517  Fe-S metabolism associated SufE  40.46 
 
 		 142 aa  103  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0960536  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1672  Fe-S metabolism associated SufE  41.98 
 
 		 142 aa  103  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.398454 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3061  Fe-S metabolism associated SufE  45.69 
 
 		 142 aa  103  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.720717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0938  Fe-S metabolism associated SufE  38.21 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00125991  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3036  Fe-S metabolism associated SufE  39.02 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.011002 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1137  Fe-S metabolism associated SufE  48.7 
 
 		 136 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707698 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1765  cysteine desufuration protein SufE  43.36 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000206434  hitchhiker  0.0000210323 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1762  SufS subfamily cysteine desulfurase  40 
 
 		 572 aa  101  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2061  Fe-S metabolism associated SufE  39.69 
 
 		 142 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3351  Fe-S metabolism associated SufE  38.21 
 
 		 148 aa  101  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0877  Fe-S metabolism associated SufE  41.98 
 
 		 141 aa  100  7e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.264737  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4443  Fe-S metabolism associated SufE  42.52 
 
 		 140 aa  100  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168146  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2747  cysteine desufuration protein SufE  43.75 
 
 		 138 aa  100  8e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00745111  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0310  hypothetical protein  40.17 
 
 		 146 aa  99.4  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.507041  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1777  Fe-S metabolism associated SufE  40.15 
 
 		 164 aa  99.4  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0862185  normal  0.039925 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3070  Fe-S metabolism associated SufE  44.09 
 
 		 142 aa  99.8  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2445  cysteine desufuration protein SufE  42.86 
 
 		 138 aa  99.8  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.032262  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00356  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  37.14 
 
 		 145 aa  99.4  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.118758  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01648  cysteine desufuration protein SufE  39.5 
 
 		 138 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000768854  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0280  Fe-S metabolism associated SufE  40.17 
 
 		 146 aa  98.6  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1952  cysteine desufuration protein SufE  39.5 
 
 		 138 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000146804  unclonable  0.00000000819474 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01638  hypothetical protein  39.5 
 
 		 138 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000509918  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1760  cysteine desufuration protein SufE  39.5 
 
 		 138 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000168999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>