178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0997 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0997  Fe-S metabolism associated protein  100 
 
 		 146 aa  299  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00392215  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1049  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  99.32 
 
 		 146 aa  298  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3223  hypothetical protein  98.63 
 
 		 146 aa  295  1e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000637476  normal  0.384907 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3808  Fe-S metabolism associated SufE  74.31 
 
 		 144 aa  215  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000105316  hitchhiker  0.000000411108 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3181  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  64.03 
 
 		 147 aa  191  4e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.680141  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0924  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  62.14 
 
 		 151 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0457641  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3380  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  60.81 
 
 		 151 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.669606  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2952  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  57.78 
 
 		 147 aa  166  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0280562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3257  Fe-S metabolism associated SufE  59.71 
 
 		 148 aa  165  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3117  cysteine desulfuration protein CsdE  57.78 
 
 		 147 aa  165  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000246129  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02662  predicted Fe-S metabolism protein  57.78 
 
 		 147 aa  164  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0877  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  57.78 
 
 		 147 aa  164  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.721288  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02623  hypothetical protein  57.78 
 
 		 147 aa  164  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0901  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  57.78 
 
 		 147 aa  164  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4076  cysteine desulfuration protein CsdE  57.78 
 
 		 147 aa  164  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0951499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2955  cysteine desulfuration protein CsdE  57.78 
 
 		 147 aa  164  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000740943  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3059  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  57.78 
 
 		 147 aa  164  4e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00674257  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2997  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  57.97 
 
 		 147 aa  160  5.0000000000000005e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.736409  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3211  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  58.33 
 
 		 147 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.416029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3196  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  58.33 
 
 		 147 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.78287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3131  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  58.33 
 
 		 147 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0738734  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3311  chain A, Northeast Structural Genomic Consortium Target Er75  58.33 
 
 		 147 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3148  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  58.33 
 
 		 147 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002692  sulfur acceptor protein SufE for iron-sulfur cluster assembly  46.97 
 
 		 142 aa  127  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0689  conserved hypothetical protein, SufE-related protein  43.94 
 
 		 145 aa  124  4.0000000000000003e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0170145  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03291  hypothetical protein  45.19 
 
 		 142 aa  124  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3157  Fe-S metabolism associated SufE  42.55 
 
 		 152 aa  114  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1897  hypothetical protein  44.14 
 
 		 144 aa  113  6.9999999999999995e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3790  hypothetical protein  44 
 
 		 147 aa  111  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1420  cysteine desulfuration protein SufE  38.13 
 
 		 144 aa  111  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0902464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5927  hypothetical protein  40.32 
 
 		 151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3517  Fe-S metabolism associated SufE  38.06 
 
 		 142 aa  110  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0960536  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3132  Fe-S metabolism associated SufE  42.74 
 
 		 147 aa  110  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1777  Fe-S metabolism associated SufE  38.13 
 
 		 164 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0862185  normal  0.039925 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0835  Fe-S metabolism associated SufE  43.2 
 
 		 147 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0839  Fe-S metabolism associated SufE  41.41 
 
 		 148 aa  110  9e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0807  Fe-S metabolism associated SufE  41.94 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3182  Fe-S metabolism associated SufE  44.88 
 
 		 151 aa  108  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0853  Fe-S metabolism associated SufE  40 
 
 		 145 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1404  Fe-S metabolism associated SufE  40 
 
 		 140 aa  107  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3475  cysteine desulfuration protein SufE  41.04 
 
 		 141 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00677521  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0858  Fe-S metabolism associated SufE  39.23 
 
 		 146 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2061  Fe-S metabolism associated SufE  35.07 
 
 		 142 aa  104  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1942  Fe-S metabolism associated SufE  34.35 
 
 		 143 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0211559  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0424  cysteine desulfuration protein SufE  39.53 
 
 		 135 aa  104  5e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.617411  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0734  Fe-S metabolism associated SufE  41.74 
 
 		 150 aa  104  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0877  Fe-S metabolism associated SufE  38.41 
 
 		 141 aa  103  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.264737  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3508  Fe-S metabolism associated SufE  40.98 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3576  Fe-S metabolism associated SufE  40.8 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0766  Fe-S metabolism associated SufE  44.04 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3699  Fe-S metabolism associated SufE  40.8 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.486429 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3043  putative sufE-like protein  35.82 
 
 		 141 aa  101  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1672  Fe-S metabolism associated SufE  38.81 
 
 		 142 aa  101  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.398454 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1472  cysteine desulfuration protein SufE  39.23 
 
 		 140 aa  100  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2211  putative selenocysteine lyase  35.94 
 
 		 569 aa  100  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.686434  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0882  Fe-S metabolism associated SufE  37.6 
 
 		 140 aa  99.8  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000850545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2223  Fe-S metabolism associated SufE  36.15 
 
 		 142 aa  99.8  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.416471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0742  Fe-S metabolism associated SufE  40.16 
 
 		 148 aa  99.4  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1008  Fe-S metabolism associated SufE  37.9 
 
 		 140 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000255666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1302  hypothetical protein  41.13 
 
 		 139 aa  99  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1885  Fe-S metabolism associated SufE  36.15 
 
 		 136 aa  97.4  6e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0116695  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4443  Fe-S metabolism associated SufE  35.07 
 
 		 140 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168146  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2625  Fe-S metabolism associated SufE  34.38 
 
 		 142 aa  97.1  8e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0386264  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2184  cysteine desufuration protein SufE  36.72 
 
 		 137 aa  96.7  9e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000219554  hitchhiker  0.00000283333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5783  Fe-S metabolism associated SufE  38.98 
 
 		 142 aa  96.3  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.131653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0615  Fe-S metabolism associated SufE  36.57 
 
 		 140 aa  95.5  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.606248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2778  hypothetical protein  39.2 
 
 		 152 aa  95.1  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1641  Fe-S metabolism associated SufE  36.72 
 
 		 141 aa  94.7  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.234613  normal  0.31626 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3070  Fe-S metabolism associated SufE  38.35 
 
 		 142 aa  95.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04475  hypothetical protein  33.33 
 
 		 141 aa  95.1  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2685  Fe-S metabolism associated SufE  36.15 
 
 		 141 aa  95.1  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0938  Fe-S metabolism associated SufE  37.98 
 
 		 139 aa  94.7  4e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00125991  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0752  Fe-S metabolism associated SufE  40.58 
 
 		 147 aa  94.4  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1753  Fe-S metabolism associated SufE  39.17 
 
 		 139 aa  94.4  5e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1852  cysteine desufuration protein SufE  36.43 
 
 		 140 aa  93.6  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000534736  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2589  cysteine desufuration protein SufE  36.43 
 
 		 140 aa  93.6  8e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.403656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3351  Fe-S metabolism associated SufE  33.33 
 
 		 148 aa  93.2  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2026  Fe-S metabolism associated SufE  33.59 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.908248  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1746  cysteine desufuration protein SufE  37.3 
 
 		 140 aa  93.2  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133663  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0574  hypothetical protein  35.38 
 
 		 141 aa  92.4  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1625  Fe-S metabolism associated SufE  36.51 
 
 		 147 aa  92  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00154018  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2445  cysteine desufuration protein SufE  34.13 
 
 		 138 aa  92  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.032262  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0575  hypothetical protein  35.38 
 
 		 141 aa  92.4  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3036  Fe-S metabolism associated SufE  32.56 
 
 		 147 aa  91.7  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.011002 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0875  Fe-S metabolism associated SufE  36.84 
 
 		 144 aa  91.3  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0629601  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1526  sufE protein  41.46 
 
 		 135 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1973  SufE protein  36.09 
 
 		 142 aa  90.1  8e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2747  cysteine desufuration protein SufE  33.33 
 
 		 138 aa  90.5  8e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00745111  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0681  Fe-S metabolism associated SufE  36.09 
 
 		 142 aa  90.1  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2158  hypothetical protein  35.16 
 
 		 141 aa  90.1  9e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1091  Fe-S metabolism associated SufE  38.46 
 
 		 134 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1491  Fe-S metabolism associated SufE  34.11 
 
 		 139 aa  89.7  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1069  Fe-S metabolism associated SufE  35.11 
 
 		 164 aa  89.7  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.801847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1236  Fe-S metabolism associated SufE  34.81 
 
 		 141 aa  89  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0210251 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1662  Fe-S metabolism associated SufE  37.59 
 
 		 138 aa  89  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3084  Fe-S metabolism associated SufE  33.56 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0119204 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1699  cysteine desufuration protein SufE  32.54 
 
 		 148 aa  88.2  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000746018  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1176  Fe-S metabolism associated SufE  30.77 
 
 		 141 aa  88.2  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4178  Fe-S metabolism associated SufE  35.04 
 
 		 142 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259445  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4099  Fe-S metabolism associated SufE  34.65 
 
 		 135 aa  87.8  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>