188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2223 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2223  Fe-S metabolism associated SufE  100 
 
 		 142 aa  289  9e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.416471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2625  Fe-S metabolism associated SufE  89.84 
 
 		 142 aa  243  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0386264  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3043  putative sufE-like protein  82.39 
 
 		 141 aa  235  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2061  Fe-S metabolism associated SufE  78.01 
 
 		 142 aa  233  6e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1777  Fe-S metabolism associated SufE  76.6 
 
 		 164 aa  227  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0862185  normal  0.039925 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3517  Fe-S metabolism associated SufE  76.06 
 
 		 142 aa  226  9e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0960536  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1942  Fe-S metabolism associated SufE  73.24 
 
 		 143 aa  223  9e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0211559  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1672  Fe-S metabolism associated SufE  66.67 
 
 		 142 aa  190  5e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.398454 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0877  Fe-S metabolism associated SufE  60.99 
 
 		 141 aa  177  4.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.264737  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1641  Fe-S metabolism associated SufE  60.9 
 
 		 141 aa  176  8e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.234613  normal  0.31626 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5927  hypothetical protein  62.5 
 
 		 151 aa  169  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2685  Fe-S metabolism associated SufE  58.57 
 
 		 141 aa  164  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0574  hypothetical protein  58.82 
 
 		 141 aa  160  5.0000000000000005e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0575  hypothetical protein  58.82 
 
 		 141 aa  160  5.0000000000000005e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1404  Fe-S metabolism associated SufE  56.49 
 
 		 140 aa  160  7e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0882  Fe-S metabolism associated SufE  53.19 
 
 		 140 aa  157  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000850545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0615  Fe-S metabolism associated SufE  52.52 
 
 		 140 aa  157  7e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.606248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1302  hypothetical protein  54.55 
 
 		 139 aa  154  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1236  Fe-S metabolism associated SufE  57.14 
 
 		 141 aa  152  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0210251 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0875  Fe-S metabolism associated SufE  52.14 
 
 		 144 aa  152  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0629601  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1008  Fe-S metabolism associated SufE  53.49 
 
 		 140 aa  150  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000255666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4443  Fe-S metabolism associated SufE  54.55 
 
 		 140 aa  150  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168146  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3475  cysteine desulfuration protein SufE  48.91 
 
 		 141 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00677521  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0424  cysteine desulfuration protein SufE  53.85 
 
 		 135 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.617411  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4178  Fe-S metabolism associated SufE  51.08 
 
 		 142 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259445  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0896  Fe-S metabolism associated SufE  50.76 
 
 		 139 aa  138  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0608769  normal  0.19145 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4957  Fe-S metabolism associated SufE  50 
 
 		 142 aa  136  7e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000286277 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1069  Fe-S metabolism associated SufE  50 
 
 		 164 aa  137  7e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.801847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3070  Fe-S metabolism associated SufE  50 
 
 		 142 aa  134  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1973  SufE protein  50.36 
 
 		 142 aa  133  9e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0681  Fe-S metabolism associated SufE  50.36 
 
 		 142 aa  133  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1472  cysteine desulfuration protein SufE  49.62 
 
 		 140 aa  131  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4099  Fe-S metabolism associated SufE  51.06 
 
 		 135 aa  131  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1840  Fe-S metabolism associated SufE  48.55 
 
 		 137 aa  128  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.757057  normal  0.0307633 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1662  Fe-S metabolism associated SufE  46.43 
 
 		 138 aa  127  4.0000000000000003e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0435  Fe-S metabolism associated SufE  46.27 
 
 		 142 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.666183 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0469  Fe-S metabolism associated SufE  45.52 
 
 		 142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.19684 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0506  Fe-S metabolism associated SufE  44.7 
 
 		 137 aa  122  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0176221 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1491  Fe-S metabolism associated SufE  46.15 
 
 		 139 aa  119  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1699  cysteine desufuration protein SufE  47.15 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000746018  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3257  Fe-S metabolism associated SufE  41.01 
 
 		 148 aa  115  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1420  cysteine desulfuration protein SufE  41.22 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0902464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1765  cysteine desufuration protein SufE  41.22 
 
 		 138 aa  110  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000206434  hitchhiker  0.0000210323 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3157  Fe-S metabolism associated SufE  43.08 
 
 		 152 aa  110  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2184  cysteine desufuration protein SufE  41.98 
 
 		 137 aa  110  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000219554  hitchhiker  0.00000283333 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2445  cysteine desufuration protein SufE  42.06 
 
 		 138 aa  110  7.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.032262  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1852  cysteine desufuration protein SufE  39.84 
 
 		 140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000534736  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2589  cysteine desufuration protein SufE  39.84 
 
 		 140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.403656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2747  cysteine desufuration protein SufE  42.06 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00745111  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1176  Fe-S metabolism associated SufE  40.88 
 
 		 141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1746  cysteine desufuration protein SufE  39.84 
 
 		 140 aa  108  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133663  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04475  hypothetical protein  37.5 
 
 		 141 aa  107  4.0000000000000004e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2026  Fe-S metabolism associated SufE  38.13 
 
 		 147 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.908248  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01648  cysteine desufuration protein SufE  41.53 
 
 		 138 aa  106  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000768854  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1963  Fe-S metabolism associated SufE  41.53 
 
 		 138 aa  106  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000464178  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1952  cysteine desufuration protein SufE  41.53 
 
 		 138 aa  106  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000146804  unclonable  0.00000000819474 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1517  cysteine desufuration protein SufE  41.53 
 
 		 138 aa  106  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000018022  hitchhiker  0.000000327732 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1760  cysteine desufuration protein SufE  41.53 
 
 		 138 aa  106  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000168999  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01638  hypothetical protein  41.53 
 
 		 138 aa  106  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000509918  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2393  cysteine desufuration protein SufE  40.68 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000216673  hitchhiker  0.0000615703 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1895  cysteine desufuration protein SufE  41.53 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000720615  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1880  cysteine desufuration protein SufE  40.68 
 
 		 138 aa  105  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000195157  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3351  Fe-S metabolism associated SufE  36.3 
 
 		 148 aa  104  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0938  Fe-S metabolism associated SufE  35.66 
 
 		 139 aa  103  9e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00125991  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5783  Fe-S metabolism associated SufE  36.3 
 
 		 142 aa  103  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.131653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1625  Fe-S metabolism associated SufE  39.23 
 
 		 147 aa  102  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00154018  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03291  hypothetical protein  40.3 
 
 		 142 aa  103  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1797  cysteine desufuration protein SufE  38.1 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000335199  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1487  cysteine desufuration protein SufE  38.1 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0255513  hitchhiker  0.000000000108827 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1968  cysteine desufuration protein SufE  38.1 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0109106  hitchhiker  0.0000000878422 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1506  cysteine desufuration protein SufE  38.1 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000138977 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1350  Fe-S metabolism associated SufE  38.97 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.590476  unclonable  0.00000000000311985 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1471  cysteine desufuration protein SufE  38.1 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00486624  normal  0.0737338 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1049  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  36.64 
 
 		 146 aa  101  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3223  hypothetical protein  36.64 
 
 		 146 aa  101  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000637476  normal  0.384907 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0997  Fe-S metabolism associated protein  35.88 
 
 		 146 aa  100  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00392215  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0461  cysteine desufuration protein SufE  38.46 
 
 		 144 aa  100  8e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.197192  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1885  Fe-S metabolism associated SufE  42.06 
 
 		 136 aa  99.8  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0116695  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0974  sufE protein  37.23 
 
 		 141 aa  99.8  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0228427  normal  0.828222 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3036  Fe-S metabolism associated SufE  36.92 
 
 		 147 aa  98.6  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.011002 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002692  sulfur acceptor protein SufE for iron-sulfur cluster assembly  40.15 
 
 		 142 aa  99  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01363  Cysteine desulfurase SufE subunit  37.12 
 
 		 136 aa  97.4  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.837457  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3117  cysteine desulfuration protein CsdE  34.56 
 
 		 147 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000246129  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2952  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  34.56 
 
 		 147 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0280562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3084  Fe-S metabolism associated SufE  39.42 
 
 		 150 aa  97.4  6e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0119204 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3059  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  34.56 
 
 		 147 aa  97.1  8e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00674257  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2158  hypothetical protein  35.94 
 
 		 141 aa  97.1  8e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02662  predicted Fe-S metabolism protein  35.38 
 
 		 147 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0877  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  35.38 
 
 		 147 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.721288  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02623  hypothetical protein  35.38 
 
 		 147 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0924  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  38.93 
 
 		 151 aa  96.3  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0457641  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4076  cysteine desulfuration protein CsdE  35.38 
 
 		 147 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0951499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0901  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  35.38 
 
 		 147 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0725  Fe-S metabolism associated SufE  41.86 
 
 		 145 aa  96.3  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2955  cysteine desulfuration protein CsdE  35.38 
 
 		 147 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000740943  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0689  conserved hypothetical protein, SufE-related protein  40 
 
 		 145 aa  95.5  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0170145  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3380  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  38.58 
 
 		 151 aa  92.8  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.669606  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0310  hypothetical protein  39.06 
 
 		 146 aa  92.8  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.507041  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3808  Fe-S metabolism associated SufE  37.7 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000105316  hitchhiker  0.000000411108 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3211  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  36.64 
 
 		 147 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.416029  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>