192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1897 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1897  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  299  1e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03291  hypothetical protein  65.96 
 
 		 142 aa  202  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002692  sulfur acceptor protein SufE for iron-sulfur cluster assembly  66.67 
 
 		 142 aa  201  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0689  conserved hypothetical protein, SufE-related protein  64.49 
 
 		 145 aa  191  4e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0170145  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1420  cysteine desulfuration protein SufE  44.06 
 
 		 144 aa  133  7.000000000000001e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0902464  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2211  putative selenocysteine lyase  47.2 
 
 		 569 aa  127  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.686434  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3117  cysteine desulfuration protein CsdE  46.26 
 
 		 147 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000246129  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2952  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  46.26 
 
 		 147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0280562  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02662  predicted Fe-S metabolism protein  48.61 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0877  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  48.61 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.721288  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02623  hypothetical protein  48.61 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0901  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  48.61 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4076  cysteine desulfuration protein CsdE  48.61 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0951499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01363  Cysteine desulfurase SufE subunit  47.33 
 
 		 136 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.837457  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2955  cysteine desulfuration protein CsdE  48.61 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000740943  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0853  Fe-S metabolism associated SufE  45.74 
 
 		 145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3059  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  47.3 
 
 		 147 aa  125  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00674257  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3157  Fe-S metabolism associated SufE  45.26 
 
 		 152 aa  125  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1526  sufE protein  47.58 
 
 		 135 aa  121  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0924  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  46.62 
 
 		 151 aa  120  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0457641  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3380  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  47.37 
 
 		 151 aa  120  6e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.669606  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0752  Fe-S metabolism associated SufE  49.17 
 
 		 147 aa  120  9e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0858  Fe-S metabolism associated SufE  46.46 
 
 		 146 aa  119  9e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0766  Fe-S metabolism associated SufE  49.14 
 
 		 148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3790  hypothetical protein  45.26 
 
 		 147 aa  118  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1334  Fe-S metabolism associated SufE  43.55 
 
 		 135 aa  117  7e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3148  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  43.15 
 
 		 147 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3196  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  43.15 
 
 		 147 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.78287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3131  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  43.15 
 
 		 147 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0738734  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3211  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  43.15 
 
 		 147 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.416029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3311  chain A, Northeast Structural Genomic Consortium Target Er75  43.84 
 
 		 147 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3257  Fe-S metabolism associated SufE  41.55 
 
 		 148 aa  116  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3181  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  42.14 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.680141  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3475  cysteine desulfuration protein SufE  48.41 
 
 		 141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00677521  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3576  Fe-S metabolism associated SufE  44.35 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3699  Fe-S metabolism associated SufE  44.35 
 
 		 148 aa  114  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.486429 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3132  Fe-S metabolism associated SufE  45.16 
 
 		 147 aa  114  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0597  Fe-S metabolism associated SufE  44.35 
 
 		 133 aa  114  5e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.149472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0839  Fe-S metabolism associated SufE  44.53 
 
 		 148 aa  114  5e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0997  Fe-S metabolism associated protein  44.14 
 
 		 146 aa  113  7.999999999999999e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00392215  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0835  Fe-S metabolism associated SufE  44.35 
 
 		 147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0896  Fe-S metabolism associated SufE  45.16 
 
 		 139 aa  112  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0608769  normal  0.19145 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0807  Fe-S metabolism associated SufE  43.55 
 
 		 147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1302  hypothetical protein  44.88 
 
 		 139 aa  112  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3223  hypothetical protein  44.14 
 
 		 146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000637476  normal  0.384907 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1049  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  44.14 
 
 		 146 aa  112  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1471  hypothetical protein  43.55 
 
 		 140 aa  111  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1491  Fe-S metabolism associated SufE  44.96 
 
 		 139 aa  111  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3182  Fe-S metabolism associated SufE  43.97 
 
 		 151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3808  Fe-S metabolism associated SufE  43.51 
 
 		 144 aa  110  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000105316  hitchhiker  0.000000411108 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3508  Fe-S metabolism associated SufE  42.74 
 
 		 148 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16920  hypothetical protein  42.52 
 
 		 140 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.106423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1091  Fe-S metabolism associated SufE  42.31 
 
 		 134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2997  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  42.52 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.736409  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0615  Fe-S metabolism associated SufE  42.19 
 
 		 140 aa  108  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.606248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0742  Fe-S metabolism associated SufE  41.94 
 
 		 148 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0882  Fe-S metabolism associated SufE  42.19 
 
 		 140 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000850545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0875  Fe-S metabolism associated SufE  43.41 
 
 		 144 aa  106  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0629601  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0734  Fe-S metabolism associated SufE  41.53 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0461  cysteine desufuration protein SufE  39.13 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.197192  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1404  Fe-S metabolism associated SufE  39.69 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1008  Fe-S metabolism associated SufE  42.74 
 
 		 140 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000255666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0424  cysteine desulfuration protein SufE  37.69 
 
 		 135 aa  103  7e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.617411  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0574  hypothetical protein  43.41 
 
 		 141 aa  102  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0575  hypothetical protein  43.41 
 
 		 141 aa  102  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1662  Fe-S metabolism associated SufE  44.8 
 
 		 138 aa  101  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2685  Fe-S metabolism associated SufE  43.41 
 
 		 141 aa  100  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00356  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  39.29 
 
 		 145 aa  100  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.118758  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1625  Fe-S metabolism associated SufE  38.03 
 
 		 147 aa  99  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00154018  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1942  Fe-S metabolism associated SufE  40 
 
 		 143 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0211559  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1885  Fe-S metabolism associated SufE  45.05 
 
 		 136 aa  98.6  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0116695  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3070  Fe-S metabolism associated SufE  42.52 
 
 		 142 aa  98.2  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0938  Fe-S metabolism associated SufE  36.29 
 
 		 139 aa  98.2  4e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00125991  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3517  Fe-S metabolism associated SufE  40.77 
 
 		 142 aa  97.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0960536  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1762  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.15 
 
 		 572 aa  97.4  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0725  Fe-S metabolism associated SufE  45.05 
 
 		 145 aa  97.1  7e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1350  Fe-S metabolism associated SufE  44.78 
 
 		 141 aa  97.1  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.590476  unclonable  0.00000000000311985 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2778  hypothetical protein  42.62 
 
 		 152 aa  96.7  9e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1973  SufE protein  41.73 
 
 		 142 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1777  Fe-S metabolism associated SufE  39.71 
 
 		 164 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0862185  normal  0.039925 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3351  Fe-S metabolism associated SufE  39.83 
 
 		 148 aa  96.3  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0681  Fe-S metabolism associated SufE  41.73 
 
 		 142 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1176  Fe-S metabolism associated SufE  36.29 
 
 		 141 aa  96.7  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3043  putative sufE-like protein  41.09 
 
 		 141 aa  96.3  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5927  hypothetical protein  40.65 
 
 		 151 aa  96.7  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04475  hypothetical protein  37.8 
 
 		 141 aa  95.9  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4099  Fe-S metabolism associated SufE  40.65 
 
 		 135 aa  95.9  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1641  Fe-S metabolism associated SufE  39.69 
 
 		 141 aa  95.9  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.234613  normal  0.31626 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0877  Fe-S metabolism associated SufE  42.64 
 
 		 141 aa  95.5  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.264737  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0280  Fe-S metabolism associated SufE  39.02 
 
 		 146 aa  94.4  4e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1472  cysteine desulfuration protein SufE  38.89 
 
 		 140 aa  94.4  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1672  Fe-S metabolism associated SufE  39.53 
 
 		 142 aa  94.4  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.398454 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2061  Fe-S metabolism associated SufE  40 
 
 		 142 aa  94  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0310  hypothetical protein  38.21 
 
 		 146 aa  93.6  7e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.507041  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5783  Fe-S metabolism associated SufE  39.84 
 
 		 142 aa  92  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.131653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0506  Fe-S metabolism associated SufE  37.01 
 
 		 137 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0176221 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1840  Fe-S metabolism associated SufE  38.89 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.757057  normal  0.0307633 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3036  Fe-S metabolism associated SufE  37.3 
 
 		 147 aa  91.3  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.011002 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1765  cysteine desufuration protein SufE  35.2 
 
 		 138 aa  91.3  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000206434  hitchhiker  0.0000210323 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2445  cysteine desufuration protein SufE  39.06 
 
 		 138 aa  90.5  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.032262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>