182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0734 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0734  Fe-S metabolism associated SufE  100 
 
 		 150 aa  307  2.9999999999999997e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0858  Fe-S metabolism associated SufE  67.86 
 
 		 146 aa  201  4e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0853  Fe-S metabolism associated SufE  67.63 
 
 		 145 aa  200  6e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0839  Fe-S metabolism associated SufE  63.12 
 
 		 148 aa  180  5.0000000000000004e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0766  Fe-S metabolism associated SufE  66.67 
 
 		 148 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3182  Fe-S metabolism associated SufE  58.33 
 
 		 151 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0752  Fe-S metabolism associated SufE  66.15 
 
 		 147 aa  168  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3699  Fe-S metabolism associated SufE  57.43 
 
 		 148 aa  167  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.486429 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3576  Fe-S metabolism associated SufE  57.43 
 
 		 148 aa  167  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3508  Fe-S metabolism associated SufE  57.43 
 
 		 148 aa  167  4e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3790  hypothetical protein  59.15 
 
 		 147 aa  166  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0807  Fe-S metabolism associated SufE  58.45 
 
 		 147 aa  166  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3132  Fe-S metabolism associated SufE  60 
 
 		 147 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0835  Fe-S metabolism associated SufE  60 
 
 		 147 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0742  Fe-S metabolism associated SufE  56.76 
 
 		 148 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2778  hypothetical protein  59.02 
 
 		 152 aa  144  5e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0689  conserved hypothetical protein, SufE-related protein  44.27 
 
 		 145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0170145  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1420  cysteine desulfuration protein SufE  41.67 
 
 		 144 aa  121  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0902464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03291  hypothetical protein  42.18 
 
 		 142 aa  121  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002692  sulfur acceptor protein SufE for iron-sulfur cluster assembly  41.5 
 
 		 142 aa  121  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2211  putative selenocysteine lyase  44.53 
 
 		 569 aa  117  4.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.686434  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3380  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  45.32 
 
 		 151 aa  117  6e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.669606  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16920  hypothetical protein  45.38 
 
 		 140 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.106423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3257  Fe-S metabolism associated SufE  41.04 
 
 		 148 aa  115  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1471  hypothetical protein  45.31 
 
 		 140 aa  114  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1091  Fe-S metabolism associated SufE  44.27 
 
 		 134 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3059  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  42.22 
 
 		 147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00674257  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0924  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  42.57 
 
 		 151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0457641  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1491  Fe-S metabolism associated SufE  44.53 
 
 		 139 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2952  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  41.48 
 
 		 147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0280562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3223  hypothetical protein  41.27 
 
 		 146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000637476  normal  0.384907 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1897  hypothetical protein  41.09 
 
 		 144 aa  111  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3181  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  40 
 
 		 147 aa  110  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.680141  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0997  Fe-S metabolism associated protein  41.27 
 
 		 146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00392215  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3117  cysteine desulfuration protein CsdE  41.48 
 
 		 147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000246129  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1049  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  41.27 
 
 		 146 aa  110  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02662  predicted Fe-S metabolism protein  40.74 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0877  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  40.74 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.721288  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02623  hypothetical protein  40.74 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4076  cysteine desulfuration protein CsdE  40.74 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0951499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0901  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  40.74 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2955  cysteine desulfuration protein CsdE  40.74 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000740943  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3808  Fe-S metabolism associated SufE  44.88 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000105316  hitchhiker  0.000000411108 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1526  sufE protein  43.9 
 
 		 135 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1334  Fe-S metabolism associated SufE  43.09 
 
 		 135 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3351  Fe-S metabolism associated SufE  37.3 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3148  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  40.15 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3211  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  40.15 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.416029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3196  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  40.15 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.78287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3131  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  40.15 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0738734  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3311  chain A, Northeast Structural Genomic Consortium Target Er75  40.91 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1662  Fe-S metabolism associated SufE  43.94 
 
 		 138 aa  104  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0597  Fe-S metabolism associated SufE  36.59 
 
 		 133 aa  103  6e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.149472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1699  cysteine desufuration protein SufE  38.76 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000746018  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4091  Fe-S metabolism associated SufE  50.85 
 
 		 136 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1672  Fe-S metabolism associated SufE  41.79 
 
 		 142 aa  99.4  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.398454 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1404  Fe-S metabolism associated SufE  38.17 
 
 		 140 aa  99.4  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2026  Fe-S metabolism associated SufE  38.89 
 
 		 147 aa  100  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.908248  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2997  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  41.88 
 
 		 147 aa  99.4  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.736409  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0938  Fe-S metabolism associated SufE  36 
 
 		 139 aa  98.2  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00125991  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3157  Fe-S metabolism associated SufE  39.06 
 
 		 152 aa  97.4  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3475  cysteine desulfuration protein SufE  39.52 
 
 		 141 aa  97.1  7e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00677521  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04475  hypothetical protein  35.43 
 
 		 141 aa  96.7  9e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1472  cysteine desulfuration protein SufE  39.68 
 
 		 140 aa  95.1  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1641  Fe-S metabolism associated SufE  40.46 
 
 		 141 aa  94.4  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.234613  normal  0.31626 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1885  Fe-S metabolism associated SufE  37.6 
 
 		 136 aa  94  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0116695  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4099  Fe-S metabolism associated SufE  38.21 
 
 		 135 aa  94  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2184  cysteine desufuration protein SufE  36.43 
 
 		 137 aa  94  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000219554  hitchhiker  0.00000283333 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2747  cysteine desufuration protein SufE  37.21 
 
 		 138 aa  93.6  8e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00745111  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2445  cysteine desufuration protein SufE  37.21 
 
 		 138 aa  93.2  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.032262  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39110  Fe-S metabolism associated SufE  45.08 
 
 		 134 aa  93.2  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000905619  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1765  cysteine desufuration protein SufE  34.88 
 
 		 138 aa  92.8  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000206434  hitchhiker  0.0000210323 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4196  Fe-S metabolism associated SufE  48.7 
 
 		 136 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.583299  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2158  hypothetical protein  36.51 
 
 		 141 aa  91.7  3e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0461  cysteine desufuration protein SufE  35.38 
 
 		 144 aa  91.3  4e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.197192  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0974  sufE protein  35.71 
 
 		 141 aa  91.3  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0228427  normal  0.828222 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1176  Fe-S metabolism associated SufE  34.13 
 
 		 141 aa  91.3  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2061  Fe-S metabolism associated SufE  40 
 
 		 142 aa  90.9  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1528  Fe-S metabolism associated SufE  48.7 
 
 		 136 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.31069  normal  0.111344 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1302  hypothetical protein  36.43 
 
 		 139 aa  90.1  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1777  Fe-S metabolism associated SufE  36.49 
 
 		 164 aa  90.1  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0862185  normal  0.039925 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2685  Fe-S metabolism associated SufE  37.8 
 
 		 141 aa  90.1  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3517  Fe-S metabolism associated SufE  39.23 
 
 		 142 aa  88.6  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0960536  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1840  Fe-S metabolism associated SufE  37.59 
 
 		 137 aa  89  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.757057  normal  0.0307633 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1968  cysteine desufuration protein SufE  34.11 
 
 		 138 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0109106  hitchhiker  0.0000000878422 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1471  cysteine desufuration protein SufE  34.11 
 
 		 138 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00486624  normal  0.0737338 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1506  cysteine desufuration protein SufE  34.11 
 
 		 138 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000138977 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3043  putative sufE-like protein  38.76 
 
 		 141 aa  89  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1797  cysteine desufuration protein SufE  34.11 
 
 		 138 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000335199  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1487  cysteine desufuration protein SufE  34.11 
 
 		 138 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0255513  hitchhiker  0.000000000108827 
 
 
-
 
NC_004310  BR0574  hypothetical protein  37.8 
 
 		 141 aa  88.6  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0575  hypothetical protein  37.8 
 
 		 141 aa  88.6  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1069  Fe-S metabolism associated SufE  36 
 
 		 164 aa  88.6  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.801847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1137  Fe-S metabolism associated SufE  44.92 
 
 		 136 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707698 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1973  SufE protein  37.14 
 
 		 142 aa  87.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1942  Fe-S metabolism associated SufE  37.69 
 
 		 143 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0211559  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0681  Fe-S metabolism associated SufE  37.14 
 
 		 142 aa  87.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1753  Fe-S metabolism associated SufE  37.93 
 
 		 139 aa  87.4  6e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4443  Fe-S metabolism associated SufE  37.98 
 
 		 140 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168146  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1625  Fe-S metabolism associated SufE  36.8 
 
 		 147 aa  87  8e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00154018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>